67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0590 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_0590  protein of unknown function DUF1028  100 
 
 
243 aa  492  9.999999999999999e-139  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0883139  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0033  protein of unknown function DUF1028  69.83 
 
 
226 aa  324  7e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0234991 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0619  protein of unknown function DUF1028  67.65 
 
 
243 aa  309  2.9999999999999997e-83  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.265478 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1479  protein of unknown function DUF1028  63.2 
 
 
253 aa  299  3e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3041  protein of unknown function DUF1028  60.56 
 
 
257 aa  279  3e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2428  protein of unknown function DUF1028  36.73 
 
 
297 aa  124  1e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2646  protein of unknown function DUF1028  40.81 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.475903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2851  hypothetical protein  34.35 
 
 
236 aa  110  3e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4048  protein of unknown function DUF1028  35.75 
 
 
228 aa  109  5e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4107  protein of unknown function DUF1028  36.2 
 
 
251 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0704  protein of unknown function DUF1028  35 
 
 
287 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0976  hypothetical protein  34.5 
 
 
270 aa  106  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0314029 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3267  hypothetical protein  34.96 
 
 
224 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2631  hypothetical protein  36.94 
 
 
224 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2258  hypothetical protein  37.39 
 
 
224 aa  103  3e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0130  protein of unknown function DUF1028  34.6 
 
 
353 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1405  hypothetical protein  39.25 
 
 
285 aa  100  3e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1006  hypothetical protein  33.47 
 
 
286 aa  98.6  7e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.728263 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0871  hypothetical protein  36.76 
 
 
288 aa  95.9  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1609  hypothetical protein  33.02 
 
 
289 aa  93.6  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.457391  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0928  protein of unknown function DUF1028  33.49 
 
 
292 aa  94  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3098  hypothetical protein  38.03 
 
 
285 aa  90.5  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0971  protein of unknown function DUF1028  30.77 
 
 
297 aa  89.4  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0491555  normal  0.0527085 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0160  hypothetical protein  33.88 
 
 
282 aa  89  7e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0318  protein of unknown function DUF1028  38.05 
 
 
327 aa  85.9  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194212  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4426  hypothetical protein  38.74 
 
 
310 aa  85.5  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0329  protein of unknown function DUF1028  38.05 
 
 
327 aa  85.5  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346477  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0307  hypothetical protein  36.77 
 
 
327 aa  83.6  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3117  hypothetical protein  32.02 
 
 
292 aa  81.6  0.000000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1192  hypothetical protein  35 
 
 
303 aa  81.6  0.00000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164754  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2917  hypothetical protein  32.62 
 
 
292 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3100  hypothetical protein  36.2 
 
 
280 aa  79.7  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04410  hypothetical protein  32.86 
 
 
293 aa  79.3  0.00000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490271  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2387  hypothetical protein  35.29 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0064  protein of unknown function DUF1028  31.53 
 
 
225 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3268  hypothetical protein  33.33 
 
 
225 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.282091  normal  0.0348053 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0444  hypothetical protein  32.3 
 
 
224 aa  75.9  0.0000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2646  hypothetical protein  35.19 
 
 
296 aa  75.1  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2581  hypothetical protein  32.88 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1205  protein of unknown function DUF1028  33.64 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377065  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1274  protein of unknown function DUF1028  33.64 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1145  hypothetical protein  33.64 
 
 
301 aa  68.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3032  hypothetical protein  35 
 
 
225 aa  67  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00540438  normal  0.842366 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16540  hypothetical protein  33.62 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.461208 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0217  protein of unknown function DUF1028  31.84 
 
 
324 aa  65.5  0.0000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.974495 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7081  hypothetical protein  33.19 
 
 
225 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0655705 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1856  hypothetical protein  27.64 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71190  hypothetical protein  33.8 
 
 
224 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4339  protein of unknown function DUF1028  30.88 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0396233  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3464  hypothetical protein  33.03 
 
 
225 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.616711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6177  hypothetical protein  33.1 
 
 
224 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5619  protein of unknown function DUF1028  31.67 
 
 
310 aa  55.1  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.266584  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2366  protein of unknown function DUF1028  32.13 
 
 
225 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425356  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0379  protein of unknown function DUF1028  30.46 
 
 
211 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5673  hypothetical protein  35.53 
 
 
225 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396491  normal  0.198047 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2959  hypothetical protein  31.67 
 
 
225 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00977193  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01761  hypothetical protein  30 
 
 
233 aa  52  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2349  hypothetical protein  30.07 
 
 
225 aa  52  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6993  hypothetical protein  33.48 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.869328  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3572  hypothetical protein  30.77 
 
 
225 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2202  hypothetical protein  30.77 
 
 
225 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.808249  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6422  hypothetical protein  34.21 
 
 
225 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.99012 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3226  hypothetical protein  29.55 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6044  hypothetical protein  30.77 
 
 
225 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00596745  hitchhiker  0.000198605 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2209  hypothetical protein  26.14 
 
 
236 aa  48.5  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230458 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3455  hypothetical protein  28.76 
 
 
224 aa  46.6  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5406  hypothetical protein  32.59 
 
 
225 aa  47  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0245954 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>