64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01761 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_01761  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  486  1e-136  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3267  hypothetical protein  35.53 
 
 		 224 aa  89.4  4e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4107  protein of unknown function DUF1028  34.27 
 
 		 251 aa  89.4  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2851  hypothetical protein  32.31 
 
 		 236 aa  88.2  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2687  hypothetical protein  30.3 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2631  hypothetical protein  30.8 
 
 		 224 aa  79.3  0.00000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2258  hypothetical protein  31.44 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2428  protein of unknown function DUF1028  28.99 
 
 		 297 aa  77.8  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0704  protein of unknown function DUF1028  29.73 
 
 		 287 aa  76.6  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2387  hypothetical protein  29.05 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7081  hypothetical protein  27.63 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0655705 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1145  hypothetical protein  31.65 
 
 		 301 aa  75.1  0.000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1405  hypothetical protein  30.11 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1274  protein of unknown function DUF1028  31.22 
 
 		 302 aa  73.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1205  protein of unknown function DUF1028  31.22 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1192  hypothetical protein  32.91 
 
 		 303 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2581  hypothetical protein  29.73 
 
 		 217 aa  72.4  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1006  hypothetical protein  28.57 
 
 		 286 aa  71.6  0.00000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.728263 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1609  hypothetical protein  29.09 
 
 		 289 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.457391  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3268  hypothetical protein  25.76 
 
 		 225 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.282091  normal  0.0348053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0871  hypothetical protein  29.36 
 
 		 288 aa  69.7  0.00000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2646  protein of unknown function DUF1028  28.81 
 
 		 230 aa  69.3  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.475903 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0064  protein of unknown function DUF1028  27.83 
 
 		 225 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0928  protein of unknown function DUF1028  28.5 
 
 		 292 aa  67  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4339  protein of unknown function DUF1028  30.77 
 
 		 273 aa  67  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0396233  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3455  hypothetical protein  26.05 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0444  hypothetical protein  26.17 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6177  hypothetical protein  29.69 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4426  hypothetical protein  31.78 
 
 		 310 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0033  protein of unknown function DUF1028  34.05 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0234991 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0160  hypothetical protein  28.25 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0971  protein of unknown function DUF1028  28.57 
 
 		 297 aa  62.8  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0491555  normal  0.0527085 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0976  hypothetical protein  28.7 
 
 		 270 aa  62.4  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0314029 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71190  hypothetical protein  28.82 
 
 		 224 aa  62  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0619  protein of unknown function DUF1028  34.55 
 
 		 243 aa  61.2  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.265478 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2202  hypothetical protein  28.7 
 
 		 225 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.808249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2959  hypothetical protein  28.26 
 
 		 225 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00977193  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3572  hypothetical protein  28.26 
 
 		 225 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5673  hypothetical protein  28.07 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396491  normal  0.198047 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3464  hypothetical protein  28.26 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616711 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6422  hypothetical protein  28.07 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.99012 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3041  protein of unknown function DUF1028  32.43 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16540  hypothetical protein  31.58 
 
 		 218 aa  58.5  0.00000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.461208 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2349  hypothetical protein  27.83 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2366  protein of unknown function DUF1028  27.39 
 
 		 225 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5406  hypothetical protein  26.52 
 
 		 225 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0245954 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3098  hypothetical protein  31.58 
 
 		 285 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6993  hypothetical protein  26.75 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.869328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3226  hypothetical protein  25.94 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3032  hypothetical protein  27.31 
 
 		 225 aa  54.7  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00540438  normal  0.842366 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0318  protein of unknown function DUF1028  30.6 
 
 		 327 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194212  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0329  protein of unknown function DUF1028  30.6 
 
 		 327 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346477  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2045  hypothetical protein  25.54 
 
 		 226 aa  52.8  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6044  hypothetical protein  28.99 
 
 		 225 aa  52.4  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00596745  hitchhiker  0.000198605 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0590  protein of unknown function DUF1028  30 
 
 		 243 aa  52  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0883139  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1856  hypothetical protein  24.37 
 
 		 239 aa  52  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1479  protein of unknown function DUF1028  31.02 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0307  hypothetical protein  30.08 
 
 		 327 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0130  protein of unknown function DUF1028  25.98 
 
 		 353 aa  50.8  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0217  protein of unknown function DUF1028  29.46 
 
 		 324 aa  48.5  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.974495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3117  hypothetical protein  27.78 
 
 		 292 aa  43.9  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2917  hypothetical protein  29.63 
 
 		 292 aa  43.1  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2646  hypothetical protein  28.05 
 
 		 296 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4048  protein of unknown function DUF1028  26.83 
 
 		 228 aa  42  0.008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>