69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3455 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3455  hypothetical protein  100 
 
 		 224 aa  450  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3226  hypothetical protein  71.75 
 
 		 224 aa  305  4.0000000000000004e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0444  hypothetical protein  50.45 
 
 		 224 aa  229  3e-59  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3268  hypothetical protein  49.55 
 
 		 225 aa  222  4e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.282091  normal  0.0348053 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2387  hypothetical protein  50.89 
 
 		 224 aa  222  4.9999999999999996e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7081  hypothetical protein  51.11 
 
 		 225 aa  212  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0655705 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3464  hypothetical protein  54.22 
 
 		 225 aa  210  1e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616711 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6177  hypothetical protein  54.02 
 
 		 224 aa  205  6e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71190  hypothetical protein  54.02 
 
 		 224 aa  204  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2366  protein of unknown function DUF1028  52.42 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2959  hypothetical protein  51.56 
 
 		 225 aa  204  1e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00977193  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5406  hypothetical protein  53.33 
 
 		 225 aa  201  9e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0245954 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3032  hypothetical protein  52.44 
 
 		 225 aa  201  9.999999999999999e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00540438  normal  0.842366 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6044  hypothetical protein  52.89 
 
 		 225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00596745  hitchhiker  0.000198605 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2349  hypothetical protein  51.56 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2045  hypothetical protein  50.44 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3572  hypothetical protein  51.11 
 
 		 225 aa  197  9e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2202  hypothetical protein  50.67 
 
 		 225 aa  196  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.808249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6993  hypothetical protein  51.56 
 
 		 225 aa  195  5.000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.869328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6422  hypothetical protein  51.56 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.99012 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5673  hypothetical protein  51.11 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396491  normal  0.198047 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0379  protein of unknown function DUF1028  52.91 
 
 		 211 aa  179  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1856  hypothetical protein  41.07 
 
 		 239 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0064  protein of unknown function DUF1028  40.85 
 
 		 225 aa  155  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2581  hypothetical protein  43.69 
 
 		 217 aa  152  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1662  protein of unknown function DUF1028  49.11 
 
 		 222 aa  148  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.444376  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2258  hypothetical protein  36.11 
 
 		 224 aa  112  3e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2631  hypothetical protein  35.29 
 
 		 224 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0704  protein of unknown function DUF1028  35.29 
 
 		 287 aa  103  3e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1405  hypothetical protein  41.76 
 
 		 285 aa  98.2  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4107  protein of unknown function DUF1028  35.38 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2428  protein of unknown function DUF1028  35.15 
 
 		 297 aa  95.1  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3267  hypothetical protein  34.17 
 
 		 224 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0971  protein of unknown function DUF1028  28.92 
 
 		 297 aa  89.7  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0491555  normal  0.0527085 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0871  hypothetical protein  33.33 
 
 		 288 aa  88.2  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2646  protein of unknown function DUF1028  33.18 
 
 		 230 aa  87.4  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.475903 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2851  hypothetical protein  31.65 
 
 		 236 aa  87.4  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4339  protein of unknown function DUF1028  34.98 
 
 		 273 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0396233  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0928  protein of unknown function DUF1028  34.93 
 
 		 292 aa  85.1  9e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1609  hypothetical protein  33.5 
 
 		 289 aa  81.6  0.000000000000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.457391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4426  hypothetical protein  33.98 
 
 		 310 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1006  hypothetical protein  32.24 
 
 		 286 aa  80.5  0.00000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.728263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0130  protein of unknown function DUF1028  31.51 
 
 		 353 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0160  hypothetical protein  31.84 
 
 		 282 aa  79.7  0.00000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01761  hypothetical protein  26.05 
 
 		 233 aa  78.2  0.00000000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0318  protein of unknown function DUF1028  34.83 
 
 		 327 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194212  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0217  protein of unknown function DUF1028  34.76 
 
 		 324 aa  75.5  0.0000000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.974495 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0329  protein of unknown function DUF1028  33.83 
 
 		 327 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346477  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1205  protein of unknown function DUF1028  35.71 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377065  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1145  hypothetical protein  37.31 
 
 		 301 aa  72.8  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1274  protein of unknown function DUF1028  37.31 
 
 		 302 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5619  protein of unknown function DUF1028  38.24 
 
 		 310 aa  72.4  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.266584  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0307  hypothetical protein  33.33 
 
 		 327 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2917  hypothetical protein  34.65 
 
 		 292 aa  69.7  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3117  hypothetical protein  34.65 
 
 		 292 aa  69.3  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0619  protein of unknown function DUF1028  29.69 
 
 		 243 aa  65.9  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.265478 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0976  hypothetical protein  29.19 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0314029 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4048  protein of unknown function DUF1028  28.28 
 
 		 228 aa  63.5  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3098  hypothetical protein  33.33 
 
 		 285 aa  62.4  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0033  protein of unknown function DUF1028  28.38 
 
 		 226 aa  61.6  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0234991 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2646  hypothetical protein  33.5 
 
 		 296 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1479  protein of unknown function DUF1028  27.43 
 
 		 253 aa  60.1  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0590  protein of unknown function DUF1028  30.53 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0883139  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1192  hypothetical protein  33.5 
 
 		 303 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164754  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04410  hypothetical protein  34.43 
 
 		 293 aa  52.8  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3041  protein of unknown function DUF1028  26.15 
 
 		 257 aa  53.1  0.000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16540  hypothetical protein  34.09 
 
 		 218 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.461208 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3100  hypothetical protein  31.25 
 
 		 280 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2328  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.17 
 
 		 409 aa  42.4  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>