71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_1006 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_1006  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.728263 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0160  hypothetical protein  77.86 
 
 
282 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0704  protein of unknown function DUF1028  44.84 
 
 
287 aa  226  3e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2428  protein of unknown function DUF1028  46.45 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1609  hypothetical protein  47 
 
 
289 aa  221  1.9999999999999999e-56  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.457391  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0871  hypothetical protein  50.57 
 
 
288 aa  217  1e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3098  hypothetical protein  48.21 
 
 
285 aa  215  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0928  protein of unknown function DUF1028  45.88 
 
 
292 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1145  hypothetical protein  49.15 
 
 
301 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0976  hypothetical protein  45.77 
 
 
270 aa  199  3.9999999999999996e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0314029 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0130  protein of unknown function DUF1028  42.77 
 
 
353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1405  hypothetical protein  47.21 
 
 
285 aa  196  4.0000000000000005e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1274  protein of unknown function DUF1028  48.08 
 
 
302 aa  194  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1205  protein of unknown function DUF1028  48.08 
 
 
302 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1192  hypothetical protein  46.71 
 
 
303 aa  193  3e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164754  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2646  hypothetical protein  45.66 
 
 
296 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3117  hypothetical protein  41.81 
 
 
292 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2646  protein of unknown function DUF1028  51.92 
 
 
230 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.475903 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2917  hypothetical protein  43.82 
 
 
292 aa  169  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0971  protein of unknown function DUF1028  38.28 
 
 
297 aa  160  2e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0491555  normal  0.0527085 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4107  protein of unknown function DUF1028  39.39 
 
 
251 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3100  hypothetical protein  53.59 
 
 
280 aa  154  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0318  protein of unknown function DUF1028  49.75 
 
 
327 aa  152  5e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194212  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0329  protein of unknown function DUF1028  48.74 
 
 
327 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346477  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0307  hypothetical protein  48.74 
 
 
327 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2851  hypothetical protein  37.39 
 
 
236 aa  145  6e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4426  hypothetical protein  48.51 
 
 
310 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4339  protein of unknown function DUF1028  44.28 
 
 
273 aa  139  6e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0396233  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3267  hypothetical protein  41.7 
 
 
224 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04410  hypothetical protein  40.67 
 
 
293 aa  126  5e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490271  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0217  protein of unknown function DUF1028  41.35 
 
 
324 aa  123  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.974495 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16540  hypothetical protein  40.65 
 
 
218 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.461208 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4048  protein of unknown function DUF1028  37.93 
 
 
228 aa  117  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0033  protein of unknown function DUF1028  37.33 
 
 
226 aa  116  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0234991 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2258  hypothetical protein  39.6 
 
 
224 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0619  protein of unknown function DUF1028  37.44 
 
 
243 aa  113  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.265478 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2631  hypothetical protein  38.42 
 
 
224 aa  114  3e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0444  hypothetical protein  36.84 
 
 
224 aa  105  9e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7081  hypothetical protein  37.93 
 
 
225 aa  104  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0655705 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3268  hypothetical protein  35.65 
 
 
225 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.282091  normal  0.0348053 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5619  protein of unknown function DUF1028  39.81 
 
 
310 aa  101  2e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.266584  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0590  protein of unknown function DUF1028  33.47 
 
 
243 aa  98.6  9e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0883139  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0064  protein of unknown function DUF1028  35.12 
 
 
225 aa  98.6  1e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2349  hypothetical protein  40.96 
 
 
225 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2387  hypothetical protein  35.55 
 
 
224 aa  94.4  2e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2959  hypothetical protein  40.43 
 
 
225 aa  94  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00977193  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3464  hypothetical protein  38.92 
 
 
225 aa  93.6  3e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.616711 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6422  hypothetical protein  38.92 
 
 
225 aa  93.2  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.99012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3572  hypothetical protein  39.89 
 
 
225 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5673  hypothetical protein  38.42 
 
 
225 aa  91.7  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396491  normal  0.198047 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2366  protein of unknown function DUF1028  37.25 
 
 
225 aa  91.3  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425356  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71190  hypothetical protein  39.11 
 
 
224 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6993  hypothetical protein  38.42 
 
 
225 aa  91.3  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.869328  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3041  protein of unknown function DUF1028  31.71 
 
 
257 aa  90.9  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6177  hypothetical protein  38.61 
 
 
224 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2202  hypothetical protein  39.36 
 
 
225 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.808249  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1856  hypothetical protein  33.68 
 
 
239 aa  90.1  4e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1479  protein of unknown function DUF1028  33.05 
 
 
253 aa  89.7  5e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6044  hypothetical protein  38.39 
 
 
225 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00596745  hitchhiker  0.000198605 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0379  protein of unknown function DUF1028  34.74 
 
 
211 aa  86.3  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5406  hypothetical protein  38.42 
 
 
225 aa  85.9  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0245954 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1662  protein of unknown function DUF1028  39.05 
 
 
222 aa  83.6  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.444376  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00625  hypothetical protein  33.79 
 
 
1083 aa  79.3  0.00000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.733753  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3032  hypothetical protein  37.59 
 
 
225 aa  73.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00540438  normal  0.842366 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01761  hypothetical protein  28.57 
 
 
233 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3455  hypothetical protein  32.24 
 
 
224 aa  70.5  0.00000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2045  hypothetical protein  31.22 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3226  hypothetical protein  38.24 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2687  hypothetical protein  37.25 
 
 
224 aa  64.7  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2581  hypothetical protein  31.34 
 
 
217 aa  62.4  0.000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2209  hypothetical protein  30.17 
 
 
236 aa  55.1  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230458 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>