71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0871 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0871  hypothetical protein  100 
 
 
288 aa  570  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2428  protein of unknown function DUF1028  62.9 
 
 
297 aa  358  7e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0704  protein of unknown function DUF1028  53.52 
 
 
287 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3098  hypothetical protein  53.02 
 
 
285 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0130  protein of unknown function DUF1028  51.23 
 
 
353 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1405  hypothetical protein  53.9 
 
 
285 aa  248  7e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0928  protein of unknown function DUF1028  46.94 
 
 
292 aa  228  8e-59  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0329  protein of unknown function DUF1028  60.85 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346477  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0318  protein of unknown function DUF1028  60.85 
 
 
327 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194212  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0971  protein of unknown function DUF1028  38.93 
 
 
297 aa  221  1.9999999999999999e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0491555  normal  0.0527085 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0307  hypothetical protein  60.38 
 
 
327 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1006  hypothetical protein  50.57 
 
 
286 aa  217  1e-55  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.728263 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1205  protein of unknown function DUF1028  52.04 
 
 
302 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377065  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1274  protein of unknown function DUF1028  51.7 
 
 
302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1145  hypothetical protein  52.22 
 
 
301 aa  216  4e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1609  hypothetical protein  45.64 
 
 
289 aa  211  9e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.457391  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0160  hypothetical protein  50.94 
 
 
282 aa  210  3e-53  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2646  hypothetical protein  49.46 
 
 
296 aa  208  6e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0976  hypothetical protein  49.37 
 
 
270 aa  207  2e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0314029 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3117  hypothetical protein  48.39 
 
 
292 aa  206  5e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1192  hypothetical protein  52.98 
 
 
303 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164754  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2917  hypothetical protein  47.48 
 
 
292 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3100  hypothetical protein  52.69 
 
 
280 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4107  protein of unknown function DUF1028  45.07 
 
 
251 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2851  hypothetical protein  46.73 
 
 
236 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2646  protein of unknown function DUF1028  48.37 
 
 
230 aa  163  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.475903 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04410  hypothetical protein  46.32 
 
 
293 aa  148  1.0000000000000001e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490271  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3267  hypothetical protein  43.19 
 
 
224 aa  142  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4339  protein of unknown function DUF1028  45.37 
 
 
273 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0396233  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4426  hypothetical protein  45.89 
 
 
310 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0217  protein of unknown function DUF1028  45.71 
 
 
324 aa  136  4e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.974495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5619  protein of unknown function DUF1028  45.45 
 
 
310 aa  132  7.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.266584  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2258  hypothetical protein  41.4 
 
 
224 aa  130  3e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3268  hypothetical protein  37.5 
 
 
225 aa  121  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.282091  normal  0.0348053 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0064  protein of unknown function DUF1028  37.25 
 
 
225 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2631  hypothetical protein  40.39 
 
 
224 aa  120  3e-26  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0033  protein of unknown function DUF1028  40.1 
 
 
226 aa  119  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0234991 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7081  hypothetical protein  41.09 
 
 
225 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0655705 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2366  protein of unknown function DUF1028  42.57 
 
 
225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425356  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3464  hypothetical protein  41.79 
 
 
225 aa  114  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.616711 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4048  protein of unknown function DUF1028  36.5 
 
 
228 aa  113  3e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0444  hypothetical protein  37.5 
 
 
224 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0619  protein of unknown function DUF1028  39.39 
 
 
243 aa  110  3e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.265478 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6422  hypothetical protein  42.57 
 
 
225 aa  108  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.99012 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5673  hypothetical protein  42.57 
 
 
225 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396491  normal  0.198047 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6993  hypothetical protein  41.58 
 
 
225 aa  105  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.869328  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3032  hypothetical protein  43.48 
 
 
225 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00540438  normal  0.842366 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71190  hypothetical protein  43.28 
 
 
224 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6177  hypothetical protein  42.79 
 
 
224 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2387  hypothetical protein  37.93 
 
 
224 aa  104  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2349  hypothetical protein  40.3 
 
 
225 aa  103  3e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2959  hypothetical protein  40.3 
 
 
225 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00977193  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1856  hypothetical protein  36.06 
 
 
239 aa  101  1e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5406  hypothetical protein  41.58 
 
 
225 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0245954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3572  hypothetical protein  40.3 
 
 
225 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2202  hypothetical protein  40.3 
 
 
225 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.808249  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16540  hypothetical protein  38.57 
 
 
218 aa  99.4  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.461208 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6044  hypothetical protein  41.35 
 
 
225 aa  96.7  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00596745  hitchhiker  0.000198605 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0590  protein of unknown function DUF1028  36.76 
 
 
243 aa  95.9  6e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0883139  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1479  protein of unknown function DUF1028  33.62 
 
 
253 aa  94  3e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3226  hypothetical protein  41.67 
 
 
224 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3041  protein of unknown function DUF1028  34.63 
 
 
257 aa  87  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2581  hypothetical protein  36.5 
 
 
217 aa  84  0.000000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2045  hypothetical protein  31.9 
 
 
226 aa  81.3  0.00000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3455  hypothetical protein  33.33 
 
 
224 aa  79.3  0.00000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1662  protein of unknown function DUF1028  41.41 
 
 
222 aa  73.6  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.444376  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00625  hypothetical protein  33.63 
 
 
1083 aa  70.1  0.00000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.733753  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01761  hypothetical protein  29.36 
 
 
233 aa  69.7  0.00000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2687  hypothetical protein  36.76 
 
 
224 aa  68.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2209  hypothetical protein  29.78 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230458 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0379  protein of unknown function DUF1028  32.99 
 
 
211 aa  65.1  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>