71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_2428 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_2428  protein of unknown function DUF1028  100 
 
 
297 aa  602  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0871  hypothetical protein  62.9 
 
 
288 aa  358  8e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0704  protein of unknown function DUF1028  57.6 
 
 
287 aa  332  3e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0130  protein of unknown function DUF1028  52.67 
 
 
353 aa  291  9e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3098  hypothetical protein  55.87 
 
 
285 aa  275  9e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0307  hypothetical protein  67.46 
 
 
327 aa  258  7e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0318  protein of unknown function DUF1028  66.03 
 
 
327 aa  254  1.0000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.194212  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0329  protein of unknown function DUF1028  65.55 
 
 
327 aa  253  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346477  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1405  hypothetical protein  50.18 
 
 
285 aa  241  7e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.93712 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0928  protein of unknown function DUF1028  49.13 
 
 
292 aa  241  7.999999999999999e-63  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.247129 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1609  hypothetical protein  47.96 
 
 
289 aa  229  4e-59  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.457391  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0160  hypothetical protein  48.75 
 
 
282 aa  227  2e-58  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1006  hypothetical protein  46.45 
 
 
286 aa  221  9.999999999999999e-57  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.728263 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1145  hypothetical protein  50.7 
 
 
301 aa  218  7e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1205  protein of unknown function DUF1028  50.52 
 
 
302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.377065  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1274  protein of unknown function DUF1028  50.52 
 
 
302 aa  216  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2646  hypothetical protein  47.42 
 
 
296 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1192  hypothetical protein  52.11 
 
 
303 aa  212  7e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.164754  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3117  hypothetical protein  46.08 
 
 
292 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0976  hypothetical protein  46.61 
 
 
270 aa  206  4e-52  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0314029 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0971  protein of unknown function DUF1028  43.23 
 
 
297 aa  204  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0491555  normal  0.0527085 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2917  hypothetical protein  45.73 
 
 
292 aa  201  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4107  protein of unknown function DUF1028  46.8 
 
 
251 aa  181  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2646  protein of unknown function DUF1028  46.08 
 
 
230 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.475903 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3100  hypothetical protein  46.07 
 
 
280 aa  166  2.9999999999999998e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04410  hypothetical protein  43.45 
 
 
293 aa  161  1e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.490271  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2851  hypothetical protein  41.71 
 
 
236 aa  157  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.466263 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4426  hypothetical protein  47 
 
 
310 aa  156  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.827378  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5619  protein of unknown function DUF1028  50.96 
 
 
310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.266584  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4339  protein of unknown function DUF1028  44.23 
 
 
273 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0396233  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2631  hypothetical protein  42.66 
 
 
224 aa  150  3e-35  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.84994 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0217  protein of unknown function DUF1028  46.45 
 
 
324 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.974495 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2258  hypothetical protein  40.93 
 
 
224 aa  140  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4048  protein of unknown function DUF1028  42.93 
 
 
228 aa  132  5e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3267  hypothetical protein  41.18 
 
 
224 aa  132  9e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0619  protein of unknown function DUF1028  37.89 
 
 
243 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.265478 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0033  protein of unknown function DUF1028  37.27 
 
 
226 aa  125  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0234991 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0590  protein of unknown function DUF1028  36.73 
 
 
243 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0883139  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0444  hypothetical protein  37.81 
 
 
224 aa  122  8e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7081  hypothetical protein  39.6 
 
 
225 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0655705 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2366  protein of unknown function DUF1028  41.87 
 
 
225 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.425356  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3268  hypothetical protein  37 
 
 
225 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.282091  normal  0.0348053 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3464  hypothetical protein  41.58 
 
 
225 aa  116  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.616711 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0064  protein of unknown function DUF1028  37.26 
 
 
225 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16540  hypothetical protein  37.09 
 
 
218 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.461208 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6422  hypothetical protein  41.09 
 
 
225 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.99012 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5673  hypothetical protein  40.59 
 
 
225 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.396491  normal  0.198047 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6993  hypothetical protein  41.09 
 
 
225 aa  108  1e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.869328  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5406  hypothetical protein  40.59 
 
 
225 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0245954 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3032  hypothetical protein  42.78 
 
 
225 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00540438  normal  0.842366 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2959  hypothetical protein  38.61 
 
 
225 aa  105  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.00977193  normal  0.494101 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71190  hypothetical protein  41.79 
 
 
224 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6177  hypothetical protein  41.29 
 
 
224 aa  105  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2349  hypothetical protein  38.12 
 
 
225 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2387  hypothetical protein  35.02 
 
 
224 aa  102  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2581  hypothetical protein  36.32 
 
 
217 aa  102  8e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2202  hypothetical protein  38.12 
 
 
225 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.808249  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3572  hypothetical protein  37.62 
 
 
225 aa  100  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6044  hypothetical protein  39.11 
 
 
225 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00596745  hitchhiker  0.000198605 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3041  protein of unknown function DUF1028  34.31 
 
 
257 aa  99.8  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1856  hypothetical protein  34.15 
 
 
239 aa  98.6  1e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1479  protein of unknown function DUF1028  34.93 
 
 
253 aa  98.6  1e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2045  hypothetical protein  36.06 
 
 
226 aa  94  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3226  hypothetical protein  39.9 
 
 
224 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00625  hypothetical protein  34.26 
 
 
1083 aa  86.3  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.733753  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3455  hypothetical protein  35.15 
 
 
224 aa  83.2  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.333542  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01761  hypothetical protein  28.99 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2209  hypothetical protein  32.02 
 
 
236 aa  77  0.0000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230458 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0379  protein of unknown function DUF1028  36.47 
 
 
211 aa  76.6  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1662  protein of unknown function DUF1028  39.3 
 
 
222 aa  70.9  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.444376  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2687  hypothetical protein  33.59 
 
 
224 aa  52.8  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0581628  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>