16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0834 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0834  CHU large protein  100 
 
 
909 aa  1811    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0835  hypothetical protein  60.71 
 
 
1084 aa  747    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0837  hypothetical protein  56.1 
 
 
1184 aa  679    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0838  hypothetical protein  53.12 
 
 
1046 aa  693    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0839  hypothetical protein  56.27 
 
 
1331 aa  669    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  41.76 
 
 
2416 aa  433  1e-120  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0878  hypothetical protein  28.8 
 
 
1051 aa  158  4e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.599854 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0873  CHU large protein  28.62 
 
 
1053 aa  156  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.539179 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4916  hypothetical protein  26.98 
 
 
2650 aa  140  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284664 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0808  D-galactoside/L-rhamnose binding SUEL lectin  27.21 
 
 
1436 aa  127  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0805  hypothetical protein  25.25 
 
 
1021 aa  79  0.0000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265346  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0806  hypothetical protein  24.07 
 
 
1351 aa  61.6  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00625  hypothetical protein  23.55 
 
 
1083 aa  52.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.733753  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0803  hypothetical protein  24.32 
 
 
1114 aa  51.2  0.00009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3740  hypothetical protein  20.68 
 
 
1054 aa  49.3  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  38.14 
 
 
4978 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>