18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0838 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0835  hypothetical protein  60.53 
 
 
1084 aa  711    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0837  hypothetical protein  53.78 
 
 
1184 aa  654    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0838  hypothetical protein  100 
 
 
1046 aa  2055    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0839  hypothetical protein  71.31 
 
 
1331 aa  868    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0834  CHU large protein  49.82 
 
 
909 aa  696    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  44.89 
 
 
2416 aa  478  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4916  hypothetical protein  30.25 
 
 
2650 aa  187  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0873  CHU large protein  30.34 
 
 
1053 aa  168  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.539179 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0878  hypothetical protein  30.15 
 
 
1051 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.599854 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0808  D-galactoside/L-rhamnose binding SUEL lectin  26.63 
 
 
1436 aa  90.5  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0805  hypothetical protein  26.32 
 
 
1021 aa  74.7  0.000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265346  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0806  hypothetical protein  26.27 
 
 
1351 aa  71.2  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2755  hypothetical protein  46.15 
 
 
564 aa  57  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0803  hypothetical protein  23.65 
 
 
1114 aa  56.2  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3740  hypothetical protein  22.03 
 
 
1054 aa  55.1  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  35.62 
 
 
1483 aa  51.6  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00625  hypothetical protein  33.76 
 
 
1083 aa  50.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.733753  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2604  Fibronectin type III domain protein  30.22 
 
 
1302 aa  45.1  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.178054  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>