34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3740 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3740  hypothetical protein  100 
 
 		 1054 aa  2162    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10753  putative membrane-anchored cell surface protein  26.36 
 
 		 827 aa  95.1  6e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00625  hypothetical protein  24.05 
 
 		 1083 aa  92  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.733753  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  25.82 
 
 		 607 aa  89  4e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.61 
 
 		 603 aa  81.3  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2609  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.81 
 
 		 598 aa  80.5  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  26.01 
 
 		 655 aa  78.2  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.85 
 
 		 599 aa  73.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.89 
 
 		 671 aa  72.8  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.67 
 
 		 598 aa  69.7  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4817  transport protein ExbB2  25.48 
 
 		 608 aa  68.6  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.966305  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5112  hypothetical protein  21.16 
 
 		 376 aa  68.2  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.690635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0837  hypothetical protein  22.76 
 
 		 1184 aa  67.8  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.33 
 
 		 555 aa  66.2  0.000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0292  hypothetical protein  24.72 
 
 		 756 aa  64.3  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0269  hypothetical protein  24.72 
 
 		 756 aa  64.3  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0902  hypothetical protein  24.72 
 
 		 756 aa  64.3  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.33 
 
 		 680 aa  64.3  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55360  transport protein ExbB2  25.75 
 
 		 615 aa  62.4  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  0.0265066 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  23.14 
 
 		 585 aa  62  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.43 
 
 		 594 aa  60.8  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0838  hypothetical protein  21.97 
 
 		 1046 aa  56.6  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3871  laminin G, domain-containing 2  28.23 
 
 		 1159 aa  56.2  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0555  laminin G, domain-containing 2  28.46 
 
 		 1597 aa  55.5  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0834  CHU large protein  20.99 
 
 		 909 aa  55.1  0.000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3863  laminin G, domain-containing 2  27.64 
 
 		 1708 aa  55.1  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.389258 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  24.88 
 
 		 11716 aa  53.1  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2475  hypothetical protein  25.49 
 
 		 714 aa  51.2  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2570  MotA/TolQ/ExbB proton channel  24.5 
 
 		 551 aa  50.1  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0835  hypothetical protein  22.68 
 
 		 1084 aa  50.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4916  hypothetical protein  29.26 
 
 		 2650 aa  49.7  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284664 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1576 aa  48.1  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3385  hypothetical protein  26.06 
 
 		 1931 aa  46.6  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.807986 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  27.16 
 
 		 4761 aa  45.8  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>