More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A2570 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A2570  MotA/TolQ/ExbB proton channel  100 
 
 
551 aa  1118    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0357  putative transport protein ExbB2  58.63 
 
 
555 aa  578  1.0000000000000001e-163  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0867857 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1087  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.56 
 
 
598 aa  415  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000962589  normal  0.110672 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.87 
 
 
603 aa  412  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2404  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.56 
 
 
555 aa  412  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2238  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  40.3 
 
 
607 aa  393  1e-108  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.363335  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2992  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.44 
 
 
655 aa  389  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0423324 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2105  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.54 
 
 
585 aa  378  1e-103  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.794323 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2220  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.64 
 
 
671 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.350798  normal  0.274856 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2609  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.52 
 
 
598 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2199  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.72 
 
 
594 aa  292  1e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55360  transport protein ExbB2  34.31 
 
 
615 aa  291  3e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0512673  normal  0.0265066 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2498  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.22 
 
 
599 aa  289  7e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.855406 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4817  transport protein ExbB2  34.48 
 
 
608 aa  286  5e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.966305  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2920  MotA/TolQ/ExbB proton channel  52.74 
 
 
680 aa  272  9e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33.01 
 
 
268 aa  108  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_002936  DET0269  hypothetical protein  28.53 
 
 
756 aa  105  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0292  hypothetical protein  28.53 
 
 
756 aa  105  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0902  hypothetical protein  28.53 
 
 
756 aa  105  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3510  protein TolQ  30.5 
 
 
224 aa  101  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0310094  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3579  protein TolQ  30.5 
 
 
224 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0136  protein TolQ  30.36 
 
 
232 aa  99  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0028  tolQ protein  29.9 
 
 
225 aa  96.3  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0957491  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0206  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.35 
 
 
224 aa  95.5  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000366729  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0856  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29 
 
 
225 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.339673  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.27 
 
 
224 aa  90.1  9e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5112  hypothetical protein  27.18 
 
 
376 aa  89.4  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.690635  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1239  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.87 
 
 
223 aa  89.7  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  29.85 
 
 
241 aa  89  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3326  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.87 
 
 
223 aa  89  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.589276  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0585  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.84 
 
 
263 aa  89  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.127539  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3473  protein TolQ  28.17 
 
 
227 aa  88.6  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110028  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3174  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.62 
 
 
243 aa  88.2  4e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.37 
 
 
232 aa  87.4  6e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  29.73 
 
 
238 aa  87  7e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2902  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.84 
 
 
238 aa  87  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0078158  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3581  MotA/TolQ/ExbB proton channel  30.77 
 
 
299 aa  87  8e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2890  MotA/TolQ/ExbB proton channel  31.34 
 
 
230 aa  87  8e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.99 
 
 
229 aa  87  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  31.18 
 
 
223 aa  86.3  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  29.44 
 
 
248 aa  86.7  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  28.8 
 
 
231 aa  85.9  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.62 
 
 
237 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3059  Tol-Pal system TolQ  29.52 
 
 
274 aa  85.9  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.170634 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4150  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.68 
 
 
227 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00529693  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3515  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.62 
 
 
237 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0208141  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1308  protein TolQ  38.68 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4763  protein TolQ  39.64 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  28.84 
 
 
236 aa  84.7  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5230  protein TolQ  39.64 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.811663  normal  0.0703567 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  39.64 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  32.37 
 
 
238 aa  84.3  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1809  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.68 
 
 
237 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.280539  normal  0.488626 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.27 
 
 
234 aa  84  0.000000000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0696  protein TolQ  27.43 
 
 
257 aa  84  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.71 
 
 
228 aa  84  0.000000000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0697  protein TolQ  27.43 
 
 
257 aa  84  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.553708  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6884  TolQ protein  38.68 
 
 
237 aa  83.6  0.000000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0859687  normal  0.084864 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0662  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.43 
 
 
247 aa  83.6  0.000000000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.391375  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.89 
 
 
235 aa  83.6  0.000000000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2364  protein TolQ  30.45 
 
 
231 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.501441 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  28.37 
 
 
236 aa  82.8  0.00000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  28.85 
 
 
236 aa  82.8  0.00000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2720  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.74 
 
 
237 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0862  protein TolQ  27.32 
 
 
231 aa  82.4  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000829474  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1214  protein TolQ  28.21 
 
 
238 aa  82.4  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  29.05 
 
 
231 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.05 
 
 
231 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  38.74 
 
 
238 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.58 
 
 
221 aa  81.6  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2391  biopolymer transport protein  28.29 
 
 
234 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  26.7 
 
 
231 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2119  Tol-Pal system TolQ  31.06 
 
 
241 aa  81.6  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.145493  normal  0.278172 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  26.7 
 
 
231 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  26.7 
 
 
231 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  26.7 
 
 
231 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3618  protein TolQ  43.93 
 
 
239 aa  81.3  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.75 
 
 
231 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0673  TonB system transport protein ExbB  28.77 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.649257  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4481  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.77 
 
 
230 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2922  MotA/TolQ/ExbB proton channel  29.77 
 
 
230 aa  80.5  0.00000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835722  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3115  protein TolQ  33.33 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04980  TolQ-like protein  27.14 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0561039  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1907  ExbB/TolQ family protein  29.63 
 
 
220 aa  80.5  0.00000000000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2209  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  27.84 
 
 
231 aa  80.1  0.00000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00714084 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3629  tolQ protein  28.1 
 
 
228 aa  80.1  0.00000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  29.52 
 
 
236 aa  79.7  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0706  Tol-Pal system TolQ  26.4 
 
 
245 aa  80.1  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.199813  normal  0.496524 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1065  TolQ protein  28.12 
 
 
257 aa  79.7  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4062  MotA/TolQ/ExbB proton channel  25.78 
 
 
236 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.508438  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0946  protein TolQ  27.37 
 
 
257 aa  79.7  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.338843  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  28.83 
 
 
235 aa  79.3  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0064  TolQ protein  26.07 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0296877  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0065  protein TolQ  26.07 
 
 
233 aa  78.2  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.566643  normal  0.905632 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3499  protein TolQ  42.99 
 
 
239 aa  78.2  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.130049 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1091  MotA/TolQ/ExbB proton channel  27.04 
 
 
308 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2630  Tol-Pal system TolQ  42.06 
 
 
239 aa  77.8  0.0000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0841  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.61 
 
 
311 aa  77.4  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0385052 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  28.51 
 
 
234 aa  77.4  0.0000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0785  protein TolQ  29.72 
 
 
222 aa  77.4  0.0000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0555571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>