25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_0837 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_0834  CHU large protein  56.1 
 
 
909 aa  701    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0835  hypothetical protein  60.5 
 
 
1084 aa  733    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0837  hypothetical protein  100 
 
 
1184 aa  2338    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0838  hypothetical protein  50.71 
 
 
1046 aa  677    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0839  hypothetical protein  49.68 
 
 
1331 aa  714    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0841  hypothetical protein  41.83 
 
 
2416 aa  618  1e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4916  hypothetical protein  31.31 
 
 
2650 aa  172  3e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.284664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0873  CHU large protein  30.3 
 
 
1053 aa  167  8e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.539179 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0878  hypothetical protein  30.1 
 
 
1051 aa  166  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.599854 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0961  beta-glycosidase-like protein  37.39 
 
 
1452 aa  156  2e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496478  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3727  b-glycosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 8 protein  33.33 
 
 
1223 aa  155  4e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0598979  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0808  D-galactoside/L-rhamnose binding SUEL lectin  25.36 
 
 
1436 aa  107  1e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0805  hypothetical protein  25.23 
 
 
1021 aa  73.6  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265346  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3740  hypothetical protein  23.2 
 
 
1054 aa  73.2  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0806  hypothetical protein  26.7 
 
 
1351 aa  70.9  0.0000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  35.29 
 
 
1332 aa  67  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2850  hypothetical protein  52.11 
 
 
915 aa  62.4  0.00000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0776011 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5223  hypothetical protein  38.46 
 
 
1228 aa  59.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.774723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3337  hypothetical protein  38.22 
 
 
1202 aa  49.7  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  39.81 
 
 
1111 aa  50.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3105  hypothetical protein  32.18 
 
 
787 aa  48.5  0.0007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.667845  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00625  hypothetical protein  32.37 
 
 
1083 aa  48.1  0.0009  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.733753  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6390  conserved repeat domain protein  31.38 
 
 
1483 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  39.74 
 
 
1130 aa  46.2  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0803  hypothetical protein  23.38 
 
 
1114 aa  45.1  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>