44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3337 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0888  hypothetical protein  45.24 
 
 		 1191 aa  736    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.199681 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3337  hypothetical protein  100 
 
 		 1202 aa  2381    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3335  hypothetical protein  43.57 
 
 		 1553 aa  203  1.9999999999999998e-50  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.545908  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3739  hypothetical protein  42.14 
 
 		 1532 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0496  hypothetical protein  44.4 
 
 		 1543 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0848067  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0521  hypothetical protein  44.44 
 
 		 1543 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.402104 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0517  hypothetical protein  44.4 
 
 		 1543 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3823  hypothetical protein  43.73 
 
 		 1541 aa  197  1e-48  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.473732  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4100  MSHA biogenesis protein MshQ  42.35 
 
 		 1257 aa  190  1e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0478  MSHA biogenesis protein MshQ  41.7 
 
 		 1255 aa  184  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233703  normal  0.793103 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3649  MSHA biogenesis protein MshQ  41.78 
 
 		 1248 aa  182  2.9999999999999997e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.516469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0573  MSHA biogenesis protein MshQ  43.01 
 
 		 1258 aa  179  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0117136  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3473  MSHA biogenesis protein MshQ  40.75 
 
 		 1261 aa  178  6e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.928372 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2833  hypothetical protein  41.46 
 
 		 1252 aa  173  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000270915  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4403  hypothetical protein  42.25 
 
 		 1463 aa  159  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  26.88 
 
 		 907 aa  132  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  39.74 
 
 		 2642 aa  129  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002382  hypothetical protein  32.99 
 
 		 1508 aa  127  1e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  27.79 
 
 		 1306 aa  127  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1576 aa  119  3.9999999999999997e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  35.8 
 
 		 900 aa  91.3  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  51.89 
 
 		 1902 aa  89.4  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05333  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  30.34 
 
 		 1111 aa  87  0.000000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.476781 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0765  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1085 aa  83.2  0.00000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232029  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  25.26 
 
 		 1072 aa  80.5  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  30.68 
 
 		 4896 aa  77.8  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3755  PA14 domain-containing protein  26.54 
 
 		 1382 aa  77.4  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0111574  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0192  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  29.77 
 
 		 1127 aa  76.6  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.48482 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  49.06 
 
 		 852 aa  70.1  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0402  MSHA biogenesis protein MshQ  25.97 
 
 		 900 aa  69.3  0.0000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0473177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  30 
 
 		 3911 aa  62.8  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0557  MSHA biogenesis protein MshQ  25.47 
 
 		 906 aa  62  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0109211  normal  0.590942 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00263  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshQ (pilus type IV)  27.95 
 
 		 1168 aa  62  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0466  MSHA biogenesis protein MshQ  25.07 
 
 		 837 aa  53.5  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0264284  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3101  hypothetical protein  27.35 
 
 		 1133 aa  53.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1961  hypothetical protein  23.34 
 
 		 1404 aa  53.1  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.40483  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1593  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1268 aa  52  0.00006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0010  WD40 domain-containing protein  51.67 
 
 		 560 aa  52  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348529  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0411  hypothetical protein  22.22 
 
 		 657 aa  51.2  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0182  CUB domain-containing protein  25.1 
 
 		 1537 aa  48.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384689  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  30.51 
 
 		 1504 aa  48.1  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4916  hypothetical protein  40.82 
 
 		 2650 aa  47  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.284664 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  46.07 
 
 		 1424 aa  47.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00625  hypothetical protein  37.5 
 
 		 1083 aa  47.4  0.002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.733753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>