58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4562 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  100 
 
 		 1576 aa  3213    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  26.95 
 
 		 1072 aa  254  9.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0396  VcfQ-like protein  24.8 
 
 		 1306 aa  192  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4403  hypothetical protein  25.36 
 
 		 1463 aa  155  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0573  MSHA biogenesis protein MshQ  24.94 
 
 		 1258 aa  154  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0117136  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00263  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshQ (pilus type IV)  25.03 
 
 		 1168 aa  152  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0765  hypothetical protein  26.13 
 
 		 1085 aa  144  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.232029  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0466  MSHA biogenesis protein MshQ  25.09 
 
 		 837 aa  142  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0264284  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3649  MSHA biogenesis protein MshQ  24.75 
 
 		 1248 aa  141  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.516469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3473  MSHA biogenesis protein MshQ  24.47 
 
 		 1261 aa  141  8.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.928372 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0478  MSHA biogenesis protein MshQ  24.47 
 
 		 1255 aa  141  1e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233703  normal  0.793103 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3755  PA14 domain-containing protein  24.01 
 
 		 1382 aa  126  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0111574  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4100  MSHA biogenesis protein MshQ  24.39 
 
 		 1257 aa  123  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2833  hypothetical protein  22.24 
 
 		 1252 aa  119  6e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000270915  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3337  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1202 aa  119  6e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0182  CUB domain-containing protein  24.2 
 
 		 1537 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.384689  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3335  hypothetical protein  23.92 
 
 		 1553 aa  116  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.545908  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3101  hypothetical protein  24.68 
 
 		 1133 aa  112  8.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0402  MSHA biogenesis protein MshQ  24.11 
 
 		 900 aa  108  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0473177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3739  hypothetical protein  22.99 
 
 		 1532 aa  104  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0517  hypothetical protein  21.97 
 
 		 1543 aa  103  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0496  hypothetical protein  21.84 
 
 		 1543 aa  99  6e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0848067  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  23.29 
 
 		 1504 aa  97.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3823  hypothetical protein  22.49 
 
 		 1541 aa  97.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.473732  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0521  hypothetical protein  22.66 
 
 		 1543 aa  96.7  3e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.402104 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0557  MSHA biogenesis protein MshQ  20.78 
 
 		 906 aa  92.4  6e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0109211  normal  0.590942 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  23.91 
 
 		 907 aa  87  0.000000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2255  hypothetical protein  23.58 
 
 		 1374 aa  80.9  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  23.44 
 
 		 1367 aa  68.9  0.0000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4996  protein of unknown function DUF1680  31.44 
 
 		 846 aa  68.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0569195 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  27.11 
 
 		 6678 aa  60.5  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0888  hypothetical protein  34.65 
 
 		 1191 aa  59.3  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.199681 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0682  Fibronectin type III domain protein  27.81 
 
 		 1735 aa  55.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2169  LamG domain-containing protein  24.57 
 
 		 4357 aa  54.7  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4870  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  22.75 
 
 		 1147 aa  54.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000290642  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2506  S-layer-like domain-containing protein  27.59 
 
 		 1013 aa  53.1  0.00004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  23.87 
 
 		 11716 aa  51.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3011  LamG domain-containing protein  29.31 
 
 		 4761 aa  50.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6069  LamG domain-containing protein  30.23 
 
 		 739 aa  50.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0554  LamG domain-containing protein jellyroll fold domain-containing protein  28.44 
 
 		 570 aa  50.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6366  putative transmembrane protein  29.82 
 
 		 739 aa  49.7  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4814  putative transmembrane protein  24.37 
 
 		 757 aa  49.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1999  LamG domain-containing protein  30 
 
 		 3907 aa  48.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2755  hypothetical protein  31.85 
 
 		 564 aa  48.5  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0201  laminin G, domain-containing 2  30.06 
 
 		 793 aa  48.5  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.317242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2203  protein of unknown function DUF1549  28.5 
 
 		 1091 aa  48.5  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3740  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1054 aa  48.1  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1017  hypothetical protein  26.43 
 
 		 252 aa  48.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03686  hypothetical protein  30.46 
 
 		 1544 aa  47.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001507  MSHA biogenesis protein MshQ  30.54 
 
 		 1008 aa  47.8  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.101461  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05444  hypothetical protein  53.66 
 
 		 793 aa  46.6  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5589  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  29.81 
 
 		 1292 aa  47  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002382  hypothetical protein  51.22 
 
 		 1508 aa  47  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1047  hypothetical protein  27.07 
 
 		 316 aa  46.2  0.005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2467  glycoside hydrolase family 2 sugar binding  26.29 
 
 		 1064 aa  46.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1112  LamG domain-containing protein  27.43 
 
 		 471 aa  45.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4267  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  22.71 
 
 		 236 aa  45.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.958159 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  23.77 
 
 		 1565 aa  45.1  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>