188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1128 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  100 
 
 
3911 aa  7405    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00005  transcriptional regulator, AraC family with Parallel beta-helix repeat  26.21 
 
 
8918 aa  177  2.9999999999999996e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4498  Ig family protein  47.23 
 
 
1232 aa  172  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3554  conserved repeat domain protein  25.4 
 
 
2490 aa  171  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.5801e-29 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2222  hypothetical protein  23.86 
 
 
2489 aa  166  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3305  hypothetical protein  25.35 
 
 
2490 aa  165  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0115  putative hemagglutinin-related protein  39.8 
 
 
1672 aa  164  3e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5260  hypothetical protein  36.1 
 
 
1879 aa  164  3e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3560  hypothetical protein  25.06 
 
 
2490 aa  160  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0147  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  30.33 
 
 
2724 aa  155  2e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1663  hypothetical protein  24.61 
 
 
2490 aa  150  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.365155  hitchhiker  0.00000000000128609 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03554  hemagglutinin-like protein  41.14 
 
 
1222 aa  149  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3601  hypothetical protein  24.57 
 
 
2358 aa  147  4e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  37.33 
 
 
2522 aa  147  5e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3340  hypothetical protein  24.42 
 
 
2358 aa  146  6e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3316  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  45.4 
 
 
692 aa  146  8e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3255  hypothetical protein  24.31 
 
 
2490 aa  145  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3249  hypothetical protein  24.35 
 
 
2487 aa  134  3e-29  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0168  Ig family protein  33.88 
 
 
3544 aa  133  8.000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  24.8 
 
 
4896 aa  130  7e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0148  conserved repeat domain protein  28.43 
 
 
2553 aa  126  9.999999999999999e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3564  conserved repeat domain protein  24.47 
 
 
2490 aa  124  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.977027  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3364  hypothetical protein  25.74 
 
 
2520 aa  122  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  45.96 
 
 
1673 aa  120  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3654  conserved repeat domain protein  24.07 
 
 
2485 aa  117  3e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1552  Ig family protein  35.88 
 
 
1544 aa  116  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1816  Ig family protein  36.6 
 
 
1626 aa  114  4.0000000000000004e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  31.58 
 
 
900 aa  111  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0307  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.01 
 
 
1272 aa  106  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3746  Ig family protein  32.44 
 
 
3542 aa  104  3e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5804  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  40.74 
 
 
1394 aa  103  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.512223  normal  0.443028 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1464  cell surface protein  22.26 
 
 
5017 aa  103  9e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0427  Fibronectin type III domain protein  39.5 
 
 
2039 aa  101  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0312  hypothetical protein  36.75 
 
 
3563 aa  99.8  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.61904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3941  hypothetical protein  44.19 
 
 
450 aa  95.9  1e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.123998  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1073  fibronectin type III domain-containing protein  41.09 
 
 
9585 aa  94.7  3e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2414  hypothetical protein  27.38 
 
 
1898 aa  92  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3971  hypothetical protein  24.45 
 
 
3602 aa  91.7  3e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5754  conserved repeat domain protein  27.92 
 
 
3471 aa  89.4  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350912 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3414  hypothetical protein  24.4 
 
 
2520 aa  89  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0192  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  39.38 
 
 
1127 aa  89  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.48482 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3674  conserved repeat domain protein  26.29 
 
 
1533 aa  88.6  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  37.81 
 
 
1628 aa  87  0.000000000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1502  hypothetical protein  28.21 
 
 
5017 aa  86.7  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1618  hypothetical protein  28.21 
 
 
5017 aa  86.7  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0250  conserved repeat domain protein  25.18 
 
 
5010 aa  86.7  0.000000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05333  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  31.52 
 
 
1111 aa  86.3  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.476781 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1287  fibronectin, type III domain-containing protein  36.27 
 
 
2011 aa  86.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.111865  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1330  Fibronectin type III domain protein  32.64 
 
 
2056 aa  85.9  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000696723 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1654  conserved repeat domain protein  27.58 
 
 
5010 aa  85.9  0.00000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0546  hypothetical protein  36.23 
 
 
571 aa  85.5  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2624  hypothetical protein  46.03 
 
 
168 aa  84  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3649  MSHA biogenesis protein MshQ  31.1 
 
 
1248 aa  83.6  0.00000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.516469  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1759  conserved repeat domain protein  27.58 
 
 
5010 aa  83.2  0.00000000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0322  hypothetical protein  40.29 
 
 
409 aa  82.8  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.620183  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1286  fibronectin, type III domain-containing protein  33.17 
 
 
2051 aa  82.4  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0989  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  43.94 
 
 
173 aa  82.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0756  polymorphic outer membrane protein  33.69 
 
 
2042 aa  80.9  0.0000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.442384  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0478  MSHA biogenesis protein MshQ  30.04 
 
 
1255 aa  80.1  0.0000000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233703  normal  0.793103 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  31.34 
 
 
2642 aa  79.7  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3690  hypothetical protein  25.02 
 
 
2121 aa  79.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0573  MSHA biogenesis protein MshQ  30.34 
 
 
1258 aa  79.3  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0117136  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1331  Fibronectin type III domain protein  33.51 
 
 
2040 aa  79.7  0.000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000211706 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0170  outer membrane adhesin like proteiin  30.29 
 
 
3699 aa  79.7  0.000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.388732 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21610  fibronectin type III domain-containing protein  34.53 
 
 
2084 aa  79  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1686  conserved repeat domain protein  27.42 
 
 
5017 aa  78.2  0.000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4660  conserved repeat domain protein  25.97 
 
 
2573 aa  77  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3452  hypothetical protein  26.24 
 
 
2113 aa  76.6  0.000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09240  conserved repeat protein  28.03 
 
 
2912 aa  77  0.000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.211499 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1759  Fibronectin type III domain protein  28.98 
 
 
2067 aa  76.6  0.000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.77836  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3111  fibronectin type III domain-containing protein  37.44 
 
 
865 aa  76.6  0.000000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0177201 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2392  cell wall associated biofilm protein  26.05 
 
 
2402 aa  75.9  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1881  conserved repeat domain protein  30.24 
 
 
1118 aa  76.3  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.00308042  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3696  conserved repeat domain protein  25.43 
 
 
1857 aa  75.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3473  MSHA biogenesis protein MshQ  38.65 
 
 
1261 aa  75.1  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.928372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4226  conserved repeat domain protein  29.2 
 
 
983 aa  74.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.405356 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2911  fibronectin, type III domain-containing protein  37.37 
 
 
864 aa  74.3  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2073  EF hand domain/PKD domain-containing protein  30.89 
 
 
1779 aa  73.6  0.00000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.167028  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1474  hypothetical protein  22.75 
 
 
5017 aa  71.6  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05620  fibronectin type III domain-containing protein  40.57 
 
 
2052 aa  72.4  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.691963  normal  0.30022 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2718  conserved repeat domain protein  34.09 
 
 
2000 aa  71.6  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3739  hypothetical protein  28.83 
 
 
1532 aa  71.6  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2946  Ig family protein  33.22 
 
 
683 aa  71.2  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0465755  hitchhiker  0.00278278 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0638  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.6 
 
 
878 aa  70.9  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.167196  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2198  Fibronectin type III domain protein  37.23 
 
 
2047 aa  70.5  0.0000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0185742 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4244  hypothetical protein  25.88 
 
 
1332 aa  69.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.472735  normal  0.133034 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0888  hypothetical protein  30.61 
 
 
1191 aa  68.9  0.000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.199681 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3185  Ig family protein  42.55 
 
 
1129 aa  68.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0185  Ig family protein  47.37 
 
 
813 aa  68.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5537  Fibronectin type III domain protein  34.08 
 
 
744 aa  68.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320231  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3335  hypothetical protein  28.62 
 
 
1553 aa  68.2  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.545908  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0188  Ig family protein  51.47 
 
 
891 aa  68.2  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1522  conserved repeat domain protein  36.53 
 
 
1984 aa  68.6  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000121408 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4022  conserved repeat domain protein  25.96 
 
 
1989 aa  68.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4100  MSHA biogenesis protein MshQ  28.31 
 
 
1257 aa  67.4  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3691  hypothetical protein  23.56 
 
 
5010 aa  67.4  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0327  Peptidase S53 propeptide  33.98 
 
 
1199 aa  67.4  0.000000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0684029  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0529  fibronectin, type III domain-containing protein  37.67 
 
 
448 aa  67.4  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4189  Ig family protein  34.92 
 
 
2503 aa  66.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3550  fibronectin, type III domain-containing protein  29.53 
 
 
2476 aa  66.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>