40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0888 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0888  hypothetical protein  100 
 
 		 1191 aa  2363    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.199681 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3337  hypothetical protein  44.56 
 
 		 1202 aa  710    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3739  hypothetical protein  44.33 
 
 		 1532 aa  209  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3335  hypothetical protein  42.11 
 
 		 1553 aa  206  2e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.545908  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3823  hypothetical protein  41.29 
 
 		 1541 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.473732  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0521  hypothetical protein  41.45 
 
 		 1543 aa  203  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.402104 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0496  hypothetical protein  42.25 
 
 		 1543 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0848067  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0517  hypothetical protein  40.79 
 
 		 1543 aa  202  3e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3649  MSHA biogenesis protein MshQ  44.21 
 
 		 1248 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.516469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0478  MSHA biogenesis protein MshQ  40.82 
 
 		 1255 aa  198  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233703  normal  0.793103 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4100  MSHA biogenesis protein MshQ  38.61 
 
 		 1257 aa  189  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3473  MSHA biogenesis protein MshQ  42.36 
 
 		 1261 aa  188  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.928372 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0573  MSHA biogenesis protein MshQ  42.61 
 
 		 1258 aa  179  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0117136  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2833  hypothetical protein  40.89 
 
 		 1252 aa  178  7e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000270915  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4403  hypothetical protein  46.21 
 
 		 1463 aa  177  9.999999999999999e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  44.16 
 
 		 2642 aa  149  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002382  hypothetical protein  34.2 
 
 		 1508 aa  144  9e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1146  hypothetical protein  31.15 
 
 		 1504 aa  115  6e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0466  MSHA biogenesis protein MshQ  30.45 
 
 		 837 aa  100  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0264284  normal  0.812437 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0759  hypothetical protein  28.14 
 
 		 907 aa  92.8  3e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.747993 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  35.63 
 
 		 900 aa  92.8  4e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_003296  RS05333  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  41.94 
 
 		 1111 aa  75.9  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.476781 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00263  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshQ (pilus type IV)  30.93 
 
 		 1168 aa  68.2  0.0000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4272  hypothetical protein  47.92 
 
 		 852 aa  65.9  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.176048  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0192  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  27.25 
 
 		 1127 aa  65.5  0.000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.48482 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  39.62 
 
 		 3911 aa  64.7  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0010  WD40 domain-containing protein  40.68 
 
 		 560 aa  63.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.348529  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  28.43 
 
 		 4896 aa  60.8  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3263  VcfQ-like protein  32.52 
 
 		 1072 aa  57.8  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1161  hypothetical protein  40 
 
 		 1902 aa  55.5  0.000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.125794  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4562  hypothetical protein  34.65 
 
 		 1576 aa  51.6  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2807  FHA domain-containing protein  44.21 
 
 		 1424 aa  49.7  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4251  Ig family protein  35.04 
 
 		 2802 aa  49.3  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.676511 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0411  hypothetical protein  24.08 
 
 		 657 aa  48.9  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3101  hypothetical protein  48.78 
 
 		 1133 aa  48.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1039  Fibronectin type III domain protein  38.2 
 
 		 2927 aa  47.8  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.761605 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0189  fibronectin type III domain-containing protein  39.71 
 
 		 2522 aa  47  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4248  cell surface receptor IPT/TIG domain-containing protein  41.05 
 
 		 1848 aa  46.6  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.296495 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1673  FHA domain-containing protein  42.11 
 
 		 1428 aa  46.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0402  MSHA biogenesis protein MshQ  26.9 
 
 		 900 aa  45.8  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0473177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>