114 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3534 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  100 
 
 		 2642 aa  4905    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  30.4 
 
 		 1882 aa  256  3e-66  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  35.98 
 
 		 2906 aa  221  1e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  34.57 
 
 		 2578 aa  182  1e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  37.34 
 
 		 994 aa  160  4e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.65 
 
 		 3629 aa  160  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  29.06 
 
 		 1971 aa  158  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  34.45 
 
 		 1881 aa  156  5.9999999999999996e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0888  hypothetical protein  44.16 
 
 		 1191 aa  149  7.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.199681 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  32.33 
 
 		 1530 aa  141  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2801  conserved repeat domain protein  36.09 
 
 		 900 aa  131  2.0000000000000002e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.292647 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3337  hypothetical protein  39.74 
 
 		 1202 aa  129  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  32.3 
 
 		 2396 aa  129  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  41.47 
 
 		 2926 aa  125  9e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3335  hypothetical protein  33.45 
 
 		 1553 aa  124  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.545908  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3473  MSHA biogenesis protein MshQ  35 
 
 		 1261 aa  124  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.134713  normal  0.928372 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  41.21 
 
 		 2407 aa  121  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0478  MSHA biogenesis protein MshQ  35.36 
 
 		 1255 aa  121  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233703  normal  0.793103 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  34.14 
 
 		 2365 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  34.14 
 
 		 2346 aa  117  3e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3649  MSHA biogenesis protein MshQ  35 
 
 		 1248 aa  117  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.516469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2833  hypothetical protein  33.94 
 
 		 1252 aa  115  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000270915  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  36.2 
 
 		 3089 aa  114  2.0000000000000002e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3739  hypothetical protein  35.12 
 
 		 1532 aa  114  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0517  hypothetical protein  35.74 
 
 		 1543 aa  114  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0496  hypothetical protein  35.74 
 
 		 1543 aa  113  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0848067  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4100  MSHA biogenesis protein MshQ  32.27 
 
 		 1257 aa  109  6e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4403  hypothetical protein  33.55 
 
 		 1463 aa  109  6e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0521  hypothetical protein  34.89 
 
 		 1543 aa  109  6e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.402104 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0573  MSHA biogenesis protein MshQ  33.22 
 
 		 1258 aa  107  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0117136  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3823  hypothetical protein  34.47 
 
 		 1541 aa  107  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.473732  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  34.46 
 
 		 1113 aa  106  6e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0107  conserved repeat domain protein  33.12 
 
 		 4896 aa  105  2e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.615678 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0082  beta strand repeat-containing protein  42.26 
 
 		 1300 aa  104  3e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  30.96 
 
 		 3391 aa  102  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  36.42 
 
 		 1119 aa  100  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  34.94 
 
 		 2711 aa  99  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  31.71 
 
 		 1508 aa  97.8  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  39.48 
 
 		 1180 aa  97.8  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  48.97 
 
 		 2363 aa  96.7  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_003296  RS05333  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  32.05 
 
 		 1111 aa  89.4  8e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.476781 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.28 
 
 		 1532 aa  89  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  32.31 
 
 		 950 aa  87.8  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  42.67 
 
 		 1550 aa  87.4  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  32.13 
 
 		 3420 aa  87  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  30.05 
 
 		 1741 aa  87  0.000000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  32.13 
 
 		 3415 aa  86.7  0.000000000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  36.31 
 
 		 3506 aa  84.7  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  43.56 
 
 		 1099 aa  83.2  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.95 
 
 		 1285 aa  82.8  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  31.22 
 
 		 2003 aa  80.1  0.0000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  32.01 
 
 		 1459 aa  80.1  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.34 
 
 		 1357 aa  79  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  34.15 
 
 		 1571 aa  78.2  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  35.68 
 
 		 1782 aa  77.8  0.000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.46 
 
 		 1848 aa  77.8  0.000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002382  hypothetical protein  27.92 
 
 		 1508 aa  77  0.000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  41.04 
 
 		 1447 aa  74.7  0.00000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1128  hypothetical protein  30.37 
 
 		 3911 aa  73.9  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  41.78 
 
 		 1108 aa  73.2  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  28.93 
 
 		 2057 aa  72.8  0.00000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  35.1 
 
 		 2366 aa  72.8  0.00000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  32.49 
 
 		 1111 aa  71.6  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0192  putative type-4 fimbrial biogenesis pily1-related protein  44.34 
 
 		 1127 aa  70.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.48482 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  32.07 
 
 		 1078 aa  68.2  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.39 
 
 		 1227 aa  68.2  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  33.76 
 
 		 1593 aa  67.8  0.000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0725  Outer membrane autotransporter barrel  26.94 
 
 		 3504 aa  65.1  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  33.46 
 
 		 1130 aa  64.7  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  31.03 
 
 		 1458 aa  64.7  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  36.5 
 
 		 861 aa  63.5  0.00000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  27.16 
 
 		 1632 aa  61.2  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  27.53 
 
 		 1254 aa  61.2  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  35.78 
 
 		 3954 aa  59.7  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  27.16 
 
 		 1806 aa  59.7  0.0000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  50 
 
 		 1093 aa  59.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  50 
 
 		 1093 aa  59.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  48.28 
 
 		 1115 aa  58.2  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  31.55 
 
 		 1451 aa  58.5  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  36.69 
 
 		 3822 aa  58.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2201  serine protease  40.96 
 
 		 641 aa  58.2  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  36.2 
 
 		 2371 aa  57.8  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  34.57 
 
 		 4238 aa  57.8  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  43.96 
 
 		 1055 aa  57.4  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1117  beta strand repeat-containing protein  48.39 
 
 		 422 aa  57.4  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  26.58 
 
 		 1250 aa  57  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  27.19 
 
 		 1234 aa  56.6  0.000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  26.58 
 
 		 1250 aa  56.2  0.000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.19 
 
 		 1234 aa  55.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  38.38 
 
 		 683 aa  55.1  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  35.14 
 
 		 1861 aa  55.1  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1165 aa  54.7  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1165 aa  54.7  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0033  autotransporter-associated beta strand repeat protein  49.23 
 
 		 348 aa  54.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.354567 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  25.62 
 
 		 1234 aa  54.3  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  29.98 
 
 		 852 aa  53.9  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  35 
 
 		 1102 aa  53.1  0.00006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  35.57 
 
 		 986 aa  52.4  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  39.45 
 
 		 995 aa  52.8  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0027  autotransporter-associated beta strand repeat protein  47.69 
 
 		 661 aa  51.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>