186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BRA0173 on replicon NC_004311
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 1113 aa  2139    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  82.49 
 
 		 861 aa  1152    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  55.99 
 
 		 1108 aa  733    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  57.01 
 
 		 2578 aa  762    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  57.14 
 
 		 1861 aa  756    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  57.92 
 
 		 2906 aa  776    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  45.89 
 
 		 1593 aa  580  1e-164  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  42.97 
 
 		 950 aa  525  1e-147  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  41.64 
 
 		 1571 aa  452  1e-125  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  46.06 
 
 		 1012 aa  435  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  41.44 
 
 		 3420 aa  416  1e-114  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  41.61 
 
 		 2926 aa  415  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  41.44 
 
 		 3415 aa  416  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  34.24 
 
 		 1068 aa  330  9e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  35.64 
 
 		 1268 aa  328  4.0000000000000003e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  35.66 
 
 		 1259 aa  324  6e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  35.81 
 
 		 1285 aa  324  6e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  35.69 
 
 		 1259 aa  323  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  35.06 
 
 		 1269 aa  315  2.9999999999999996e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  38.67 
 
 		 1254 aa  314  4.999999999999999e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  32.25 
 
 		 1741 aa  201  6e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  31.97 
 
 		 1806 aa  197  8.000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  29.57 
 
 		 1165 aa  194  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  29.57 
 
 		 1165 aa  194  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  30.64 
 
 		 2637 aa  186  3e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  29.55 
 
 		 4312 aa  185  4.0000000000000006e-45  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  29.55 
 
 		 4391 aa  184  7e-45  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  40.98 
 
 		 1881 aa  177  9e-43  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  29.23 
 
 		 1327 aa  176  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  32.27 
 
 		 1594 aa  174  7.999999999999999e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  37.59 
 
 		 3506 aa  173  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  29.92 
 
 		 1099 aa  173  2e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  32.99 
 
 		 1626 aa  167  8e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  30.55 
 
 		 1349 aa  161  5e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  33.1 
 
 		 466 aa  161  8e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  39.25 
 
 		 2396 aa  160  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.13 
 
 		 1055 aa  160  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  30.55 
 
 		 1327 aa  160  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  30.55 
 
 		 1327 aa  159  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  36.96 
 
 		 1550 aa  158  5.0000000000000005e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  40.06 
 
 		 1530 aa  155  4e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  31.19 
 
 		 1579 aa  153  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  35.86 
 
 		 2711 aa  153  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  29.32 
 
 		 1093 aa  153  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  29.32 
 
 		 1093 aa  153  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.03 
 
 		 3629 aa  150  9e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  29.5 
 
 		 989 aa  143  1.9999999999999998e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  37.14 
 
 		 1971 aa  142  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  32.26 
 
 		 1119 aa  139  3.0000000000000003e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  30.86 
 
 		 2057 aa  139  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  29.47 
 
 		 1115 aa  137  9.999999999999999e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  37.15 
 
 		 2365 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  37.15 
 
 		 2346 aa  134  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.15 
 
 		 868 aa  132  3e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  29.96 
 
 		 1748 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  30.77 
 
 		 773 aa  129  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  40.85 
 
 		 2363 aa  128  6e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  35.76 
 
 		 2366 aa  125  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  41.02 
 
 		 1508 aa  125  4e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  29.12 
 
 		 1753 aa  124  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  37.09 
 
 		 994 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  34.75 
 
 		 2003 aa  122  3e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.85 
 
 		 1023 aa  121  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  28.54 
 
 		 1762 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  28.54 
 
 		 1762 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  26.01 
 
 		 1102 aa  119  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.55 
 
 		 1532 aa  119  3.9999999999999997e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  29.21 
 
 		 1770 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  39.27 
 
 		 3322 aa  116  2.0000000000000002e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  27.92 
 
 		 1763 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  26.57 
 
 		 1067 aa  117  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  34.61 
 
 		 2642 aa  114  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  36.5 
 
 		 3391 aa  114  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  30.06 
 
 		 1770 aa  113  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  37.01 
 
 		 1882 aa  111  7.000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.1 
 
 		 1227 aa  109  3e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  35.69 
 
 		 4238 aa  108  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  39.74 
 
 		 1782 aa  108  7e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  35.86 
 
 		 4238 aa  107  9e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  28.02 
 
 		 1040 aa  105  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  25.62 
 
 		 1234 aa  105  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  35.47 
 
 		 2371 aa  104  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  32.88 
 
 		 997 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  32.88 
 
 		 1004 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  25.28 
 
 		 1070 aa  103  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  25.81 
 
 		 1250 aa  102  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  25.78 
 
 		 1252 aa  102  3e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  30.27 
 
 		 1234 aa  102  5e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  26.53 
 
 		 1234 aa  102  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  27.47 
 
 		 820 aa  102  5e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.56 
 
 		 1234 aa  101  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  25.09 
 
 		 1070 aa  100  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  44.23 
 
 		 955 aa  99.8  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  42.95 
 
 		 955 aa  99  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  28.94 
 
 		 1277 aa  98.2  8e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  27.43 
 
 		 1254 aa  95.9  3e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.74 
 
 		 1081 aa  95.9  4e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  24.77 
 
 		 1250 aa  93.6  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  39.53 
 
 		 1458 aa  93.2  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  26.61 
 
 		 947 aa  93.6  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>