112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0372 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 		 1277 aa  2519    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  72.6 
 
 		 1234 aa  646    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  34.91 
 
 		 989 aa  259  2e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  33.97 
 
 		 1579 aa  252  3e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  33.53 
 
 		 1327 aa  246  1.9999999999999999e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.44 
 
 		 868 aa  245  3.9999999999999997e-63  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  33.13 
 
 		 4312 aa  243  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  32.76 
 
 		 773 aa  242  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  32.71 
 
 		 4391 aa  241  5e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  31.03 
 
 		 1349 aa  233  1e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  30.72 
 
 		 1327 aa  230  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  30.72 
 
 		 1327 aa  229  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  34.22 
 
 		 466 aa  229  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  31.51 
 
 		 2637 aa  229  3e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  32.13 
 
 		 2057 aa  213  2e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  30.96 
 
 		 1102 aa  210  1e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  33.82 
 
 		 955 aa  204  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  33.53 
 
 		 955 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  32.33 
 
 		 1165 aa  199  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  32.33 
 
 		 1165 aa  199  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.87 
 
 		 806 aa  197  1e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  33.04 
 
 		 3322 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01154  hypothetical protein  32.71 
 
 		 338 aa  163  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  31.13 
 
 		 1040 aa  152  5e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1312  autotransporter (AT) family porin  32.37 
 
 		 306 aa  150  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000904355  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  30.27 
 
 		 947 aa  148  7.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  30.12 
 
 		 818 aa  147  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  31.52 
 
 		 825 aa  142  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  30.58 
 
 		 819 aa  141  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  31.56 
 
 		 995 aa  141  8.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  29.01 
 
 		 1763 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  27.76 
 
 		 1762 aa  136  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  27.76 
 
 		 1762 aa  136  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  29.9 
 
 		 1753 aa  134  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.63 
 
 		 1234 aa  133  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  28.48 
 
 		 1250 aa  133  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  28.48 
 
 		 1234 aa  133  3e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  28.07 
 
 		 1234 aa  130  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  30.91 
 
 		 1770 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  31.01 
 
 		 1748 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  27.23 
 
 		 1028 aa  130  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  27.96 
 
 		 1252 aa  129  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  28.02 
 
 		 1250 aa  126  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  27.62 
 
 		 1254 aa  127  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  32.35 
 
 		 1108 aa  126  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  30.5 
 
 		 1770 aa  126  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  30.5 
 
 		 1093 aa  124  9e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  30.5 
 
 		 1093 aa  124  9e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  25.22 
 
 		 1004 aa  124  9.999999999999999e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  31.7 
 
 		 2906 aa  122  6e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  31.7 
 
 		 2578 aa  121  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  31.7 
 
 		 1861 aa  119  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  24.63 
 
 		 997 aa  119  3.9999999999999997e-25  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  27.88 
 
 		 1099 aa  119  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  28.66 
 
 		 1741 aa  117  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  28.33 
 
 		 3420 aa  110  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.25 
 
 		 1357 aa  109  4e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  31.16 
 
 		 1113 aa  108  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  28.43 
 
 		 3415 aa  108  6e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2848  hypothetical protein  53.64 
 
 		 132 aa  108  7e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5168  hypothetical protein  70.31 
 
 		 79 aa  108  9e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.32759  normal  0.551734 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  29.89 
 
 		 2926 aa  105  7e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  27.83 
 
 		 950 aa  103  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  27.83 
 
 		 1012 aa  99  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  28.31 
 
 		 1067 aa  98.2  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  29.22 
 
 		 924 aa  97.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  31.16 
 
 		 1593 aa  95.9  5e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.61 
 
 		 1023 aa  91.7  8e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  24.74 
 
 		 773 aa  84.3  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  24.25 
 
 		 820 aa  84.7  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  27.08 
 
 		 1068 aa  83.6  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  27.63 
 
 		 1070 aa  84  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0333  outer membrane autotransporter  24.19 
 
 		 1602 aa  84  0.00000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  27.63 
 
 		 1070 aa  83.2  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  27.53 
 
 		 1254 aa  82.8  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  27.27 
 
 		 1259 aa  82  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  27.89 
 
 		 1268 aa  81.6  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.75 
 
 		 1009 aa  81.6  0.00000000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  27.89 
 
 		 1259 aa  80.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  27.64 
 
 		 1285 aa  80.1  0.0000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  27.64 
 
 		 1269 aa  79.3  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  39.58 
 
 		 927 aa  77.4  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  24.74 
 
 		 733 aa  77  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  25.41 
 
 		 769 aa  76.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  27.35 
 
 		 1049 aa  76.6  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  27.27 
 
 		 730 aa  75.5  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  39.36 
 
 		 909 aa  75.5  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  39.58 
 
 		 914 aa  73.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  27.15 
 
 		 729 aa  72.4  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  33.9 
 
 		 864 aa  70.1  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  24.16 
 
 		 732 aa  69.3  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.61 
 
 		 1055 aa  68.9  0.0000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  23.75 
 
 		 731 aa  66.2  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.91 
 
 		 1086 aa  66.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  29.35 
 
 		 861 aa  63.2  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  24.93 
 
 		 709 aa  62.4  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0916  outer membrane autotransporter  25.76 
 
 		 1144 aa  58.9  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  23.98 
 
 		 3506 aa  56.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.33 
 
 		 1039 aa  54.3  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1133  outer membrane autotransporter  26.38 
 
 		 1058 aa  53.9  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>