140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0640 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  85.14 
 
 
1753 aa  2842    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  100 
 
 
1763 aa  3409    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  93.82 
 
 
1762 aa  3114    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  82.7 
 
 
1770 aa  2709    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  93.82 
 
 
1762 aa  3114    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  82.53 
 
 
1770 aa  2710    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  79.35 
 
 
1748 aa  2647    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  40.02 
 
 
1579 aa  559  1e-157  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  37.98 
 
 
1594 aa  541  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  34.44 
 
 
1067 aa  322  3.9999999999999996e-86  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  34.17 
 
 
1070 aa  306  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  34.17 
 
 
1070 aa  305  4.0000000000000003e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  29.17 
 
 
2637 aa  300  1e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  31.11 
 
 
1040 aa  271  8e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.69 
 
 
1023 aa  253  2e-65  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  32.63 
 
 
947 aa  252  5e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  36.33 
 
 
1099 aa  228  9e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  34.25 
 
 
1115 aa  209  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  31.55 
 
 
1234 aa  208  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  34.31 
 
 
1093 aa  194  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  34.31 
 
 
1093 aa  194  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  29.79 
 
 
820 aa  182  4.999999999999999e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  32.21 
 
 
924 aa  173  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  32.44 
 
 
818 aa  149  3e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  32.57 
 
 
825 aa  145  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  34.34 
 
 
995 aa  142  7e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  32.49 
 
 
1028 aa  141  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  32.06 
 
 
819 aa  139  4e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  31.21 
 
 
1593 aa  137  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  30.59 
 
 
1571 aa  137  1.9999999999999998e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  29.73 
 
 
950 aa  134  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  29.46 
 
 
864 aa  134  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.17 
 
 
1357 aa  133  3e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  32.62 
 
 
1049 aa  133  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  27.96 
 
 
730 aa  132  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  28.3 
 
 
1741 aa  131  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  29.32 
 
 
1012 aa  128  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  28.78 
 
 
1277 aa  127  2e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  32.91 
 
 
2926 aa  126  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  32.01 
 
 
909 aa  125  5e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.78 
 
 
1055 aa  123  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  26.58 
 
 
1008 aa  123  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  30.96 
 
 
2057 aa  115  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  28.38 
 
 
1113 aa  115  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  28.7 
 
 
729 aa  115  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  30.17 
 
 
1108 aa  114  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  28.4 
 
 
1068 aa  112  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  26.98 
 
 
773 aa  108  8e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.26 
 
 
1039 aa  107  2e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.93 
 
 
806 aa  107  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  28.99 
 
 
1268 aa  106  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  28.82 
 
 
1327 aa  105  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  27.76 
 
 
4391 aa  105  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  27.55 
 
 
4312 aa  104  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  28.65 
 
 
1806 aa  104  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.59 
 
 
1009 aa  103  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.41 
 
 
1086 aa  103  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  28.51 
 
 
1259 aa  102  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  28.71 
 
 
1259 aa  101  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  28.71 
 
 
1254 aa  101  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  37.76 
 
 
927 aa  100  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  26.89 
 
 
949 aa  100  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  26.76 
 
 
732 aa  100  3e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  28.33 
 
 
3322 aa  99  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  39.05 
 
 
914 aa  98.6  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  28.51 
 
 
1285 aa  98.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.77 
 
 
868 aa  98.6  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  28.52 
 
 
1269 aa  98.2  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  27.09 
 
 
733 aa  97.4  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  28.4 
 
 
948 aa  97.8  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  26.05 
 
 
731 aa  96.7  3e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  26.73 
 
 
709 aa  94.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  27.72 
 
 
1327 aa  94  3e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  27.4 
 
 
1327 aa  93.6  3e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  29.83 
 
 
989 aa  92.8  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  27.24 
 
 
1349 aa  91.3  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  28.19 
 
 
466 aa  91.3  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  30.08 
 
 
1861 aa  90.1  3e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  31.64 
 
 
1626 aa  89.4  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  25.96 
 
 
773 aa  89  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  25.87 
 
 
769 aa  86.7  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  27.19 
 
 
955 aa  85.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  27.19 
 
 
955 aa  84  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  31.87 
 
 
948 aa  82.4  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  26.16 
 
 
1165 aa  80.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  26.16 
 
 
1165 aa  80.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  25.06 
 
 
747 aa  81.3  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  31.56 
 
 
948 aa  80.9  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  30.52 
 
 
506 aa  79.7  0.0000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  30.52 
 
 
506 aa  78.2  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0051  hypothetical protein  42.74 
 
 
508 aa  76.3  0.000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  37.25 
 
 
861 aa  73.9  0.00000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0333  outer membrane autotransporter  23.5 
 
 
1602 aa  73.2  0.00000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  32.97 
 
 
1102 aa  67.8  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  30.12 
 
 
997 aa  66.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  30.12 
 
 
1004 aa  66.2  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.94 
 
 
1197 aa  64.7  0.00000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  32.03 
 
 
1254 aa  64.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5619  YadA-like  44 
 
 
1471 aa  63.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5983  YadA domain-containing protein  44 
 
 
1471 aa  63.9  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228839 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>