87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1972 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 1197 aa  2358    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  38.31 
 
 		 1971 aa  320  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0259  Outer membrane autotransporter barrel  29 
 
 		 940 aa  229  2e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  28.27 
 
 		 819 aa  115  5e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  28.12 
 
 		 825 aa  114  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  25.27 
 
 		 1099 aa  107  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  26.19 
 
 		 924 aa  107  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  29.21 
 
 		 909 aa  102  6e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2335  hemolysin-type calcium-binding region  29.59 
 
 		 2198 aa  101  8e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  25.05 
 
 		 1115 aa  95.5  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  26.79 
 
 		 947 aa  94  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  25.16 
 
 		 1093 aa  93.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  25.16 
 
 		 1093 aa  93.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  29.38 
 
 		 3954 aa  88.6  6e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  25 
 
 		 1067 aa  85.5  0.000000000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  24.64 
 
 		 1070 aa  82.4  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  30.17 
 
 		 914 aa  81.3  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  25.36 
 
 		 1070 aa  80.9  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  27.95 
 
 		 1748 aa  78.6  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.76 
 
 		 1009 aa  78.2  0.0000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  28.67 
 
 		 818 aa  77.4  0.000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  29.23 
 
 		 950 aa  75.9  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  28.04 
 
 		 927 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  26.69 
 
 		 1040 aa  73.6  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  25.57 
 
 		 1770 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  26.79 
 
 		 1049 aa  71.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  26.13 
 
 		 1753 aa  71.2  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  25.52 
 
 		 864 aa  70.9  0.0000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  25.25 
 
 		 1762 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  25.25 
 
 		 1762 aa  67.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  24.85 
 
 		 1108 aa  67  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  24.68 
 
 		 1770 aa  65.9  0.000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  28.08 
 
 		 948 aa  65.9  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  26.68 
 
 		 731 aa  65.5  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  28.08 
 
 		 949 aa  64.7  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  26.99 
 
 		 948 aa  64.3  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  24.94 
 
 		 1763 aa  64.7  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.74 
 
 		 1039 aa  64.3  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  28.08 
 
 		 948 aa  63.9  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  25.18 
 
 		 1234 aa  63.2  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  25.27 
 
 		 1349 aa  62.8  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  23.52 
 
 		 989 aa  61.6  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  25.54 
 
 		 1327 aa  60.8  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  25.05 
 
 		 1327 aa  60.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  22.99 
 
 		 1268 aa  59.7  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  25 
 
 		 1741 aa  59.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  23.23 
 
 		 1285 aa  58.5  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  23.6 
 
 		 2637 aa  58.5  0.0000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  26.62 
 
 		 3415 aa  57.4  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.3 
 
 		 1357 aa  57.8  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1165 aa  58.2  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.81 
 
 		 1023 aa  58.2  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  22.87 
 
 		 1165 aa  58.2  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  22.39 
 
 		 1259 aa  57.4  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  22.09 
 
 		 1254 aa  56.6  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  22.39 
 
 		 1269 aa  56.2  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  25.79 
 
 		 1571 aa  55.1  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  25.32 
 
 		 2926 aa  54.3  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  27.87 
 
 		 1012 aa  53.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  26.64 
 
 		 3420 aa  53.5  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  25.6 
 
 		 1068 aa  53.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.86 
 
 		 1055 aa  52.8  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  24.33 
 
 		 730 aa  51.2  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.05 
 
 		 868 aa  50.1  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  22.58 
 
 		 1327 aa  50.4  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  22.58 
 
 		 1806 aa  49.3  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  21.85 
 
 		 2057 aa  49.3  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  29.63 
 
 		 955 aa  49.3  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  24.38 
 
 		 4391 aa  49.3  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.63 
 
 		 955 aa  49.3  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  24.7 
 
 		 1594 aa  48.9  0.0005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  29.63 
 
 		 955 aa  49.3  0.0005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1348  putative outer membrane autotransporter  29.63 
 
 		 961 aa  48.9  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  28.89 
 
 		 955 aa  47.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.33795 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0822  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.68 
 
 		 854 aa  47.8  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.68 
 
 		 870 aa  48.1  0.001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0916  outer membrane autotransporter  25.06 
 
 		 1144 aa  47.8  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  24.15 
 
 		 759 aa  47.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1818  outer membrane autotransporter  24.77 
 
 		 358 aa  47  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  21.17 
 
 		 466 aa  47  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  22.63 
 
 		 1626 aa  46.6  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  24.15 
 
 		 759 aa  46.6  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  22.61 
 
 		 1861 aa  46.2  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  22.61 
 
 		 2578 aa  45.4  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  22.61 
 
 		 2906 aa  45.1  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  30.7 
 
 		 1593 aa  45.1  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  27.88 
 
 		 1113 aa  44.7  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>