45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_0822 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013515  Smon_0204  outer membrane autotransporter barrel domain protein  47.59 
 
 
857 aa  719    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  73.55 
 
 
870 aa  1194    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1220  outer membrane autotransporter barrel domain protein  61.81 
 
 
863 aa  969    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0823  outer membrane autotransporter barrel domain protein  56.87 
 
 
855 aa  853    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0822  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 
854 aa  1687    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  22.6 
 
 
1594 aa  92.4  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  22 
 
 
1806 aa  79.3  0.0000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  22.52 
 
 
1327 aa  79  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  22 
 
 
1349 aa  77.8  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  22.52 
 
 
466 aa  76.6  0.000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  21.59 
 
 
1327 aa  76.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  21.59 
 
 
1327 aa  76.3  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  23.03 
 
 
2637 aa  75.5  0.000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  23.55 
 
 
1579 aa  73.2  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  25.25 
 
 
955 aa  71.2  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.41 
 
 
868 aa  70.1  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  22.91 
 
 
989 aa  67.8  0.0000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  24.75 
 
 
955 aa  67.8  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  23.29 
 
 
773 aa  67  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  22.74 
 
 
4391 aa  65.5  0.000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  22.74 
 
 
4312 aa  64.7  0.000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  21.44 
 
 
1165 aa  57  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  21.44 
 
 
1165 aa  57  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.62 
 
 
1357 aa  55.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0916  outer membrane autotransporter  31.58 
 
 
1144 aa  55.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  26.64 
 
 
818 aa  54.3  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  21.37 
 
 
1102 aa  52  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1312  autotransporter (AT) family porin  24.66 
 
 
306 aa  50.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000904355  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  27.21 
 
 
1099 aa  49.7  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  32.2 
 
 
3322 aa  49.7  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.53 
 
 
1086 aa  48.1  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  23.21 
 
 
947 aa  48.5  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.68 
 
 
1197 aa  48.1  0.0008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  22.1 
 
 
1748 aa  47.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  24.32 
 
 
825 aa  46.6  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01154  hypothetical protein  24.48 
 
 
338 aa  46.6  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  27.94 
 
 
1108 aa  46.2  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.87 
 
 
806 aa  46.2  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1330  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.27 
 
 
1122 aa  45.8  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  23.63 
 
 
819 aa  45.8  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  30.34 
 
 
927 aa  45.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  24.54 
 
 
1277 aa  45.1  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  25.54 
 
 
909 aa  44.7  0.008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  30.77 
 
 
1250 aa  44.7  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  21.73 
 
 
1234 aa  44.7  0.008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>