141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_2148 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_2123  putative lipoprotein  97.51 
 
 		 1297 aa  2391    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.590284  normal  0.395646 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  40.33 
 
 		 4391 aa  691    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  97.66 
 
 		 1327 aa  1570    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  99.57 
 
 		 466 aa  965    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  40.3 
 
 		 4312 aa  678    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  100 
 
 		 1806 aa  3588    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  97.59 
 
 		 1626 aa  3078    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  42.41 
 
 		 2637 aa  780    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  55.91 
 
 		 1594 aa  556  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  46.26 
 
 		 1327 aa  546  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  46.26 
 
 		 1349 aa  548  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  46.26 
 
 		 1327 aa  546  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  54.6 
 
 		 1579 aa  543  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  37.32 
 
 		 1165 aa  486  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  37.32 
 
 		 1165 aa  486  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  47.92 
 
 		 868 aa  444  1e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  47.81 
 
 		 773 aa  431  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  49.71 
 
 		 955 aa  382  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  49.43 
 
 		 955 aa  379  1e-103  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  35.16 
 
 		 1102 aa  339  1.9999999999999998e-91  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01154  hypothetical protein  48.38 
 
 		 338 aa  304  9e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1312  autotransporter (AT) family porin  47.52 
 
 		 306 aa  298  5e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000904355  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  35.08 
 
 		 989 aa  289  4e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  32.38 
 
 		 3322 aa  271  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  29.25 
 
 		 2057 aa  254  9.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  36.54 
 
 		 1004 aa  246  1.9999999999999999e-63  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.96 
 
 		 806 aa  246  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  35.99 
 
 		 997 aa  242  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  33.48 
 
 		 1234 aa  241  9e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  33 
 
 		 1277 aa  236  4.0000000000000004e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  30.56 
 
 		 1234 aa  210  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  30.75 
 
 		 1250 aa  208  9e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.75 
 
 		 1234 aa  207  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  29.38 
 
 		 1234 aa  204  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  30.43 
 
 		 1254 aa  204  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  29.96 
 
 		 1252 aa  203  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  30.09 
 
 		 1113 aa  196  3e-48  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  29.56 
 
 		 1250 aa  196  4e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  30.85 
 
 		 2906 aa  191  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  30.85 
 
 		 2578 aa  190  3e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  30.51 
 
 		 1861 aa  186  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  31.46 
 
 		 1108 aa  176  5e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  30.33 
 
 		 2926 aa  163  3e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  28.31 
 
 		 950 aa  153  2e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  29.94 
 
 		 3420 aa  151  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  28.76 
 
 		 995 aa  151  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  32.8 
 
 		 861 aa  146  3e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  28.06 
 
 		 1099 aa  145  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30 
 
 		 1086 aa  140  2e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  26.49 
 
 		 1093 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  26.49 
 
 		 1093 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.38 
 
 		 1023 aa  137  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  28.37 
 
 		 1040 aa  128  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  31.36 
 
 		 1593 aa  124  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  30.16 
 
 		 1012 aa  124  1.9999999999999998e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  27.87 
 
 		 1259 aa  124  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  27.61 
 
 		 1254 aa  122  3.9999999999999996e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  28.6 
 
 		 1268 aa  122  7e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  27.96 
 
 		 1259 aa  121  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  28.68 
 
 		 1269 aa  121  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  25.93 
 
 		 1115 aa  120  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  27.9 
 
 		 1285 aa  121  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  26.95 
 
 		 818 aa  120  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  27.12 
 
 		 947 aa  119  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  26.5 
 
 		 1741 aa  118  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  26.19 
 
 		 1571 aa  118  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  28.36 
 
 		 1067 aa  116  3e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  27.63 
 
 		 1028 aa  116  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  26.73 
 
 		 825 aa  113  3e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0264  beta strand repeat-containing protein  27.93 
 
 		 860 aa  111  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  26.88 
 
 		 819 aa  110  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  27.78 
 
 		 1068 aa  109  4e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  28.17 
 
 		 1763 aa  103  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  27.81 
 
 		 1762 aa  102  6e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  27.81 
 
 		 1762 aa  102  6e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  28.54 
 
 		 1770 aa  102  7e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  28.26 
 
 		 1748 aa  102  9e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  27.73 
 
 		 1070 aa  102  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  24.96 
 
 		 773 aa  101  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  27.19 
 
 		 1753 aa  100  3e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  27.73 
 
 		 1070 aa  99.4  5e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  28.08 
 
 		 1770 aa  99.4  6e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  27.36 
 
 		 733 aa  94.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  26.91 
 
 		 820 aa  89.4  5e-16  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.55 
 
 		 972 aa  88.6  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  23.43 
 
 		 924 aa  87.4  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.48 
 
 		 1357 aa  87  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  25.76 
 
 		 731 aa  85.9  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.07 
 
 		 870 aa  84.7  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  26.33 
 
 		 769 aa  81.3  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  24.26 
 
 		 732 aa  80.9  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  24.51 
 
 		 709 aa  79.3  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  30.34 
 
 		 1459 aa  79.3  0.0000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0822  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22 
 
 		 854 aa  79.3  0.0000000000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  35.43 
 
 		 927 aa  77.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  23.78 
 
 		 730 aa  76.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  22.93 
 
 		 729 aa  75.9  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.93 
 
 		 1055 aa  75.9  0.000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  36.6 
 
 		 914 aa  75.5  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1220  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.56 
 
 		 863 aa  73.9  0.00000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>