52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smon_1220 on replicon NC_013515
Organism: Streptobacillus moniliformis DSM 12112



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  56.82 
 
 		 870 aa  864    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1220  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 863 aa  1709    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0823  outer membrane autotransporter barrel domain protein  62.74 
 
 		 855 aa  965    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0822  outer membrane autotransporter barrel domain protein  61.81 
 
 		 854 aa  953    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0204  outer membrane autotransporter barrel domain protein  50.06 
 
 		 857 aa  752    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  23.87 
 
 		 773 aa  78.2  0.0000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  23.31 
 
 		 1327 aa  77.4  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  23.11 
 
 		 1349 aa  75.5  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  22.9 
 
 		 1327 aa  75.5  0.000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  21.43 
 
 		 1327 aa  75.1  0.000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  21.56 
 
 		 1806 aa  73.9  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  22.45 
 
 		 989 aa  73.6  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  21.43 
 
 		 466 aa  71.2  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.71 
 
 		 868 aa  69.3  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  22.46 
 
 		 2637 aa  68.6  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  27.94 
 
 		 1579 aa  65.9  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  25.58 
 
 		 1594 aa  61.6  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1312  autotransporter (AT) family porin  24.83 
 
 		 306 aa  59.7  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000904355  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  23.37 
 
 		 3322 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  22.2 
 
 		 4312 aa  58.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  21.21 
 
 		 4391 aa  58.2  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  23.71 
 
 		 1748 aa  57.4  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0916  outer membrane autotransporter  34.38 
 
 		 1144 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.753371 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01154  hypothetical protein  24.7 
 
 		 338 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  23.12 
 
 		 955 aa  56.2  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  27.27 
 
 		 1770 aa  55.8  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  28.79 
 
 		 1762 aa  55.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  28.79 
 
 		 1762 aa  55.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  28.79 
 
 		 1763 aa  55.5  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  27.27 
 
 		 1770 aa  55.5  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  21.15 
 
 		 1165 aa  55.1  0.000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  21.15 
 
 		 1165 aa  55.1  0.000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  23.97 
 
 		 2057 aa  54.7  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  22.61 
 
 		 955 aa  53.5  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  24.17 
 
 		 947 aa  53.5  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  27.48 
 
 		 1753 aa  54.3  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1330  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.24 
 
 		 1122 aa  53.9  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  23.99 
 
 		 1741 aa  52  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  26 
 
 		 1234 aa  50.8  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  24.48 
 
 		 825 aa  50.4  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  24.48 
 
 		 819 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  30.07 
 
 		 818 aa  48.9  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  27.82 
 
 		 1099 aa  48.5  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  32.46 
 
 		 864 aa  47.8  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  27.12 
 
 		 1108 aa  47.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  24.88 
 
 		 1102 aa  47  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  23.31 
 
 		 2578 aa  46.6  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  23.31 
 
 		 1861 aa  46.2  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  31.71 
 
 		 909 aa  46.2  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  26.14 
 
 		 3415 aa  45.1  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  30.61 
 
 		 1250 aa  44.7  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  23 
 
 		 924 aa  44.3  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>