130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_0190 on replicon NC_008060
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  84.85 
 
 
1753 aa  2831    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 
1762 aa  3408    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  83.03 
 
 
1770 aa  2706    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  100 
 
 
1762 aa  3408    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  79.63 
 
 
1748 aa  2647    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  93.82 
 
 
1763 aa  3112    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  82.69 
 
 
1770 aa  2701    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  39.94 
 
 
1579 aa  554  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  38.08 
 
 
1594 aa  533  1e-149  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  33.64 
 
 
1067 aa  324  8e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  33.38 
 
 
1070 aa  309  4.0000000000000004e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  33.38 
 
 
1070 aa  308  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  30.28 
 
 
2637 aa  303  2e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  30.89 
 
 
1040 aa  275  4.0000000000000004e-72  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  32.69 
 
 
947 aa  258  6e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.57 
 
 
1023 aa  251  1e-64  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  36.26 
 
 
1099 aa  229  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  33.98 
 
 
1115 aa  211  7e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  31.34 
 
 
1234 aa  208  9e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  34.51 
 
 
1093 aa  196  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  34.51 
 
 
1093 aa  196  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  30.37 
 
 
820 aa  188  1.0000000000000001e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  32.67 
 
 
924 aa  169  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  31.95 
 
 
818 aa  148  9e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  32.57 
 
 
825 aa  144  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  34.72 
 
 
995 aa  144  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  30.89 
 
 
1593 aa  139  4e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  32.06 
 
 
819 aa  139  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  29.83 
 
 
950 aa  138  8e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  32.76 
 
 
1049 aa  136  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  28.22 
 
 
730 aa  133  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  29.46 
 
 
864 aa  132  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.23 
 
 
1357 aa  132  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  30.23 
 
 
1571 aa  132  8.000000000000001e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  29.94 
 
 
1012 aa  130  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  28.19 
 
 
1741 aa  130  3e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  33.05 
 
 
2926 aa  129  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  32.01 
 
 
909 aa  126  3e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  30.53 
 
 
1277 aa  126  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.88 
 
 
1055 aa  123  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  26.46 
 
 
1008 aa  123  3e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  29.63 
 
 
3415 aa  123  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  29.45 
 
 
3420 aa  122  7e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  28.65 
 
 
1113 aa  119  3.9999999999999997e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  30.23 
 
 
1108 aa  117  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  29.68 
 
 
729 aa  116  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  29.57 
 
 
2906 aa  111  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  28.64 
 
 
1068 aa  110  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  30.49 
 
 
2057 aa  108  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.18 
 
 
806 aa  107  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  29.05 
 
 
1268 aa  106  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.16 
 
 
1039 aa  106  4e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.88 
 
 
1009 aa  105  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.41 
 
 
1086 aa  104  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  28.16 
 
 
1327 aa  104  2e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  26.38 
 
 
773 aa  104  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  28 
 
 
1806 aa  103  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  26.54 
 
 
732 aa  102  5e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  28.77 
 
 
1254 aa  102  7e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  28.77 
 
 
1259 aa  102  8e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  27.82 
 
 
733 aa  102  8e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  28.57 
 
 
1259 aa  102  9e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  37.76 
 
 
927 aa  101  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  26.99 
 
 
4391 aa  101  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  26.99 
 
 
4312 aa  100  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  26.79 
 
 
949 aa  100  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.42 
 
 
868 aa  100  3e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  28.57 
 
 
1269 aa  99.8  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  28.57 
 
 
1285 aa  99  7e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  39.05 
 
 
914 aa  99  8e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  28.11 
 
 
948 aa  97.8  2e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  28.87 
 
 
1861 aa  96.3  4e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  26.48 
 
 
731 aa  95.5  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  27.12 
 
 
709 aa  94.4  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  28.27 
 
 
989 aa  94.4  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  27.81 
 
 
948 aa  91.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  27.81 
 
 
948 aa  91.3  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  26.36 
 
 
773 aa  90.5  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  26.76 
 
 
1349 aa  90.1  3e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  28.04 
 
 
466 aa  89.4  5e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  27.74 
 
 
955 aa  89.7  5e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  31.75 
 
 
1626 aa  89.7  5e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  27.74 
 
 
955 aa  88.6  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  26.26 
 
 
769 aa  87.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  26.92 
 
 
1327 aa  87.8  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  26.6 
 
 
1327 aa  87.8  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  26.37 
 
 
1165 aa  85.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  26.37 
 
 
1165 aa  85.1  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  25.71 
 
 
747 aa  80.1  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  30.31 
 
 
506 aa  79.3  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0333  outer membrane autotransporter  23.93 
 
 
1602 aa  78.2  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  30.66 
 
 
506 aa  77  0.000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  29.68 
 
 
861 aa  76.6  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0051  hypothetical protein  41.94 
 
 
508 aa  76.6  0.000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  46.55 
 
 
3322 aa  75.1  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.25 
 
 
1197 aa  68.2  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  32.26 
 
 
1102 aa  66.2  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  32.04 
 
 
1254 aa  64.7  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  29.52 
 
 
1004 aa  64.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  29.52 
 
 
997 aa  64.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>