25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0051 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0051  hypothetical protein  100 
 
 
508 aa  960    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0169  hypothetical protein  58.64 
 
 
489 aa  415  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.559059  normal  0.671211 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04390  hypothetical protein  41.46 
 
 
499 aa  209  7e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00230297 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1518  hypothetical protein  39.3 
 
 
445 aa  194  4e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.7159  hitchhiker  0.00152141 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0757  hypothetical protein  38.99 
 
 
446 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1234  hypothetical protein  38.34 
 
 
439 aa  165  2.0000000000000002e-39  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000907369  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03990  hypothetical protein  34.66 
 
 
611 aa  156  8e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.311503 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  32.09 
 
 
1748 aa  94.7  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  32.19 
 
 
1770 aa  89.4  1e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  33.69 
 
 
1763 aa  88.6  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  32.97 
 
 
1762 aa  86.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  32.97 
 
 
1762 aa  86.7  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  31.51 
 
 
1770 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  32.26 
 
 
1753 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03397  conserved hypothetical protein  25.54 
 
 
461 aa  75.9  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.485233 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  27.4 
 
 
1070 aa  58.2  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  27.25 
 
 
1070 aa  55.1  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  26.74 
 
 
1067 aa  54.3  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  28.06 
 
 
995 aa  47  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.08 
 
 
1023 aa  46.2  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  34.93 
 
 
1040 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  40.62 
 
 
709 aa  46.2  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  24.72 
 
 
1008 aa  45.8  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  41.94 
 
 
769 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.78 
 
 
1086 aa  43.1  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.837049 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>