133 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0107 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  96.92 
 
 		 1067 aa  2070    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  97.29 
 
 		 1070 aa  2017    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 1070 aa  2138    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  33.68 
 
 		 1762 aa  319  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  33.68 
 
 		 1762 aa  319  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  32.3 
 
 		 1770 aa  317  7e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  34.48 
 
 		 1763 aa  316  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  33.07 
 
 		 1770 aa  313  1e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  33.88 
 
 		 1753 aa  306  1.0000000000000001e-81  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  30.88 
 
 		 1748 aa  303  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  27.34 
 
 		 1008 aa  236  3e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  28.98 
 
 		 947 aa  231  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.13 
 
 		 1023 aa  213  1e-53  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  27.48 
 
 		 1040 aa  199  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  31.47 
 
 		 1099 aa  174  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  30.64 
 
 		 1115 aa  158  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  25.93 
 
 		 1594 aa  153  1e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  31.44 
 
 		 820 aa  147  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  28.57 
 
 		 825 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  28.32 
 
 		 819 aa  137  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  30.96 
 
 		 3415 aa  135  3e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  30.96 
 
 		 3420 aa  135  6e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  27.98 
 
 		 818 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  30.67 
 
 		 2926 aa  129  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  27.29 
 
 		 995 aa  127  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  28.74 
 
 		 909 aa  121  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  28.24 
 
 		 1012 aa  121  9e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.98 
 
 		 1086 aa  119  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.17 
 
 		 868 aa  117  7.999999999999999e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  24.23 
 
 		 1579 aa  115  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  28.36 
 
 		 1327 aa  116  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  25.45 
 
 		 864 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  28.36 
 
 		 1806 aa  115  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  24.62 
 
 		 1234 aa  115  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  30.51 
 
 		 950 aa  114  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  30.03 
 
 		 1259 aa  112  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  30.03 
 
 		 1285 aa  112  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  30.33 
 
 		 1269 aa  112  5e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  27.53 
 
 		 730 aa  111  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  30.33 
 
 		 1254 aa  111  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  28.6 
 
 		 729 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  30.03 
 
 		 1259 aa  109  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  29.43 
 
 		 1268 aa  108  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  28.36 
 
 		 466 aa  108  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  27.72 
 
 		 989 aa  108  7e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  25.5 
 
 		 1113 aa  108  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  26.67 
 
 		 2637 aa  107  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  28.22 
 
 		 924 aa  105  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  27.6 
 
 		 2578 aa  105  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  28.35 
 
 		 914 aa  104  9e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  27.81 
 
 		 2906 aa  104  9e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  27.19 
 
 		 4391 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  25.4 
 
 		 773 aa  103  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1657  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.56 
 
 		 1039 aa  102  3e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.656845  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  29.07 
 
 		 1571 aa  103  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  27.19 
 
 		 4312 aa  102  3e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  27.45 
 
 		 1861 aa  102  4e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  24.93 
 
 		 709 aa  101  8e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  28.27 
 
 		 927 aa  101  9e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  31.76 
 
 		 1049 aa  101  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  25.07 
 
 		 1028 aa  100  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  27.27 
 
 		 1108 aa  97.8  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  26.01 
 
 		 773 aa  95.5  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.44 
 
 		 1055 aa  94.7  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  28.06 
 
 		 1593 aa  94.4  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  26.07 
 
 		 948 aa  93.6  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  26.73 
 
 		 1068 aa  92.8  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  35.81 
 
 		 1626 aa  92.8  3e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.93 
 
 		 1357 aa  91.3  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  27.37 
 
 		 1741 aa  91.7  8e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  25.7 
 
 		 949 aa  90.9  1e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  26.3 
 
 		 732 aa  91.3  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  26.47 
 
 		 948 aa  90.5  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1165 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1165 aa  89.4  3e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3347  antigen 43  26.47 
 
 		 948 aa  89  4e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  25.64 
 
 		 769 aa  88.2  8e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  26.09 
 
 		 2057 aa  87.4  0.000000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  23.88 
 
 		 955 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.88 
 
 		 955 aa  86.7  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  24.27 
 
 		 955 aa  87  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  25.37 
 
 		 1349 aa  85.9  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  25.37 
 
 		 1327 aa  85.5  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  23.75 
 
 		 955 aa  85.5  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.33795 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.82 
 
 		 1197 aa  85.1  0.000000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  27.63 
 
 		 1277 aa  84.3  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.49 
 
 		 1009 aa  84.3  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  25.16 
 
 		 1327 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  25.06 
 
 		 638 aa  81.3  0.00000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  24.3 
 
 		 638 aa  80.5  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  24.3 
 
 		 638 aa  80.5  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  24.35 
 
 		 733 aa  78.6  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.52 
 
 		 806 aa  77.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  27.3 
 
 		 861 aa  75.5  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  23.8 
 
 		 731 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  23.25 
 
 		 759 aa  73.6  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  26.42 
 
 		 955 aa  72.8  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  23.25 
 
 		 759 aa  73.2  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  23.25 
 
 		 759 aa  72.4  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  27.19 
 
 		 955 aa  71.6  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>