149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene B21_03479 on replicon NC_012892
Organism: Escherichia coli BL21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  100 
 
 
1165 aa  2306    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  100 
 
 
1165 aa  2306    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  43.31 
 
 
1349 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  43.05 
 
 
1327 aa  575  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  43.05 
 
 
1327 aa  572  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  37.32 
 
 
1806 aa  486  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  39.66 
 
 
2637 aa  481  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  36.46 
 
 
4391 aa  460  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  42.1 
 
 
1594 aa  448  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  46.57 
 
 
1579 aa  434  1e-120  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  35.68 
 
 
4312 aa  428  1e-118  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  42.32 
 
 
1327 aa  409  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  43.14 
 
 
466 aa  399  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  45 
 
 
773 aa  399  1e-109  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.4 
 
 
868 aa  370  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  33.49 
 
 
1102 aa  322  3e-86  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  37.22 
 
 
1626 aa  316  9.999999999999999e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  42.98 
 
 
955 aa  310  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  42.65 
 
 
955 aa  310  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01154  hypothetical protein  45.95 
 
 
338 aa  271  5.9999999999999995e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  33.49 
 
 
989 aa  265  4e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1312  autotransporter (AT) family porin  42.11 
 
 
306 aa  260  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000904355  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  26.81 
 
 
2057 aa  231  5e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  35.01 
 
 
1004 aa  221  5e-56  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  34.72 
 
 
997 aa  219  2.9999999999999998e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  25.89 
 
 
1234 aa  189  3e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  26.39 
 
 
1250 aa  188  5e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.32 
 
 
806 aa  188  7e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.540701 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.12 
 
 
1234 aa  187  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  25.66 
 
 
1252 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  26.21 
 
 
1234 aa  186  2.0000000000000003e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  31.79 
 
 
1234 aa  185  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  31.86 
 
 
1277 aa  184  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  25.5 
 
 
1254 aa  179  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.985186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  25.07 
 
 
1250 aa  177  9.999999999999999e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  27.14 
 
 
995 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  28.66 
 
 
1108 aa  166  3e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  28.72 
 
 
950 aa  164  8.000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  28.1 
 
 
1861 aa  163  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  28.91 
 
 
2906 aa  163  2e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  27.95 
 
 
2578 aa  162  3e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  27.8 
 
 
3415 aa  145  4e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  28.33 
 
 
3420 aa  145  6e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  26.06 
 
 
1028 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  27.93 
 
 
3322 aa  132  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  27.02 
 
 
1571 aa  128  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  26.75 
 
 
1741 aa  128  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.48 
 
 
1086 aa  123  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  27.71 
 
 
861 aa  122  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  26.95 
 
 
819 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  27.09 
 
 
825 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  26.04 
 
 
1099 aa  116  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  26.39 
 
 
1593 aa  114  1.0000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  26.04 
 
 
2926 aa  114  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  27.77 
 
 
1269 aa  114  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  28 
 
 
1259 aa  113  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  26.93 
 
 
1040 aa  113  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  27.21 
 
 
1254 aa  110  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  27.77 
 
 
1259 aa  107  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  27.4 
 
 
1285 aa  107  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  27.36 
 
 
1268 aa  107  2e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  25.34 
 
 
1115 aa  105  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  25.31 
 
 
1093 aa  103  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  25.31 
 
 
1093 aa  103  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  26.5 
 
 
947 aa  102  4e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.21 
 
 
1357 aa  97.8  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  25.61 
 
 
1068 aa  94  2e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  26.52 
 
 
1012 aa  92.8  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37 
 
 
1055 aa  86.7  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.85 
 
 
1023 aa  86.3  0.000000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  24.02 
 
 
818 aa  85.9  0.000000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2123  putative lipoprotein  34.46 
 
 
1297 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.590284  normal  0.395646 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  26.04 
 
 
1762 aa  84  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  27.72 
 
 
820 aa  84  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  26.04 
 
 
1762 aa  84  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  25.67 
 
 
1067 aa  83.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  26.22 
 
 
1753 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  27.98 
 
 
2003 aa  82  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  25.83 
 
 
1763 aa  81.3  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  46.53 
 
 
506 aa  77.4  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  26.96 
 
 
1770 aa  78.2  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  46.53 
 
 
506 aa  77.8  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  36.47 
 
 
914 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  26.88 
 
 
1748 aa  76.3  0.000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  26.12 
 
 
1070 aa  75.1  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  25.68 
 
 
1070 aa  74.3  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  26.51 
 
 
1770 aa  72.8  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  36.5 
 
 
2363 aa  70.9  0.0000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.43 
 
 
1009 aa  68.9  0.0000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  25.75 
 
 
773 aa  68.6  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  24.83 
 
 
924 aa  67.8  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  32.62 
 
 
927 aa  66.2  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.23 
 
 
1227 aa  65.9  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.45 
 
 
3629 aa  63.9  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  23.64 
 
 
769 aa  63.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  31.23 
 
 
1459 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  33.2 
 
 
1881 aa  62  0.00000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  36.84 
 
 
864 aa  61.6  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.54 
 
 
870 aa  61.2  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  23.71 
 
 
1008 aa  60.1  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>