187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR2013 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 1593 aa  3118    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  50.73 
 
 		 1108 aa  699    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  49.95 
 
 		 2578 aa  868    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  49.95 
 
 		 1861 aa  865    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  49.7 
 
 		 2906 aa  954    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  37.13 
 
 		 1571 aa  610  1e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  46.16 
 
 		 1113 aa  607  9.999999999999999e-173  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  44.76 
 
 		 950 aa  500  1e-140  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  41.06 
 
 		 3415 aa  427  1e-118  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  41.06 
 
 		 3420 aa  426  1e-117  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  39.12 
 
 		 2926 aa  375  1e-102  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  39.08 
 
 		 1068 aa  365  3e-99  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  43.14 
 
 		 861 aa  337  1e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  38.93 
 
 		 1259 aa  307  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  39.18 
 
 		 1268 aa  305  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  38.93 
 
 		 1269 aa  305  5.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  38.93 
 
 		 1254 aa  305  5.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  38.52 
 
 		 1259 aa  302  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  38.52 
 
 		 1285 aa  302  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  33.84 
 
 		 1550 aa  218  5.9999999999999996e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  32.76 
 
 		 2711 aa  208  9e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  34.52 
 
 		 3506 aa  200  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  32.39 
 
 		 1099 aa  187  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  28.01 
 
 		 1741 aa  177  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  30.35 
 
 		 1093 aa  157  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  30.35 
 
 		 1093 aa  157  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  34.42 
 
 		 2363 aa  154  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.45 
 
 		 1357 aa  145  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  28.76 
 
 		 2637 aa  145  5e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  31.39 
 
 		 1762 aa  143  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  31.39 
 
 		 1762 aa  143  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  31.13 
 
 		 1115 aa  142  3.9999999999999997e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  29.29 
 
 		 1327 aa  142  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  31.84 
 
 		 1763 aa  141  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  31.76 
 
 		 1770 aa  141  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  28.65 
 
 		 2057 aa  140  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  31.36 
 
 		 1806 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  31.13 
 
 		 1881 aa  138  7.000000000000001e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  31.14 
 
 		 1753 aa  138  7.000000000000001e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  31.02 
 
 		 1770 aa  137  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1165 aa  132  6e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  27.73 
 
 		 1165 aa  132  6e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  28.87 
 
 		 1594 aa  126  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  29.94 
 
 		 1748 aa  125  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  27.84 
 
 		 947 aa  125  6e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  28.17 
 
 		 1327 aa  125  8e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  29.69 
 
 		 1040 aa  125  9e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  28.01 
 
 		 1349 aa  125  9e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  49.25 
 
 		 2365 aa  125  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  49.25 
 
 		 2346 aa  124  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  32.71 
 
 		 466 aa  124  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  28.01 
 
 		 1327 aa  124  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.12 
 
 		 1227 aa  123  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  28.89 
 
 		 4312 aa  122  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  29.23 
 
 		 773 aa  122  7e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  28.29 
 
 		 989 aa  121  9.999999999999999e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  28.07 
 
 		 4391 aa  120  1.9999999999999998e-25  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  36.43 
 
 		 1119 aa  118  1.0000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.71 
 
 		 1023 aa  117  1.0000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.38 
 
 		 1532 aa  117  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  48.5 
 
 		 2371 aa  117  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  42.2 
 
 		 1055 aa  115  6e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  28.61 
 
 		 1579 aa  114  2.0000000000000002e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  47.5 
 
 		 2366 aa  113  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  47.83 
 
 		 2396 aa  110  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  31.22 
 
 		 1626 aa  108  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  28.83 
 
 		 1067 aa  104  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  39.32 
 
 		 2003 aa  104  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  33.9 
 
 		 1519 aa  103  4e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.8 
 
 		 868 aa  102  5e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  36.74 
 
 		 3322 aa  102  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  28.8 
 
 		 1234 aa  101  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.08 
 
 		 3629 aa  100  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  26.91 
 
 		 820 aa  99  7e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  31.16 
 
 		 1277 aa  96.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  33.21 
 
 		 1971 aa  95.1  9e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  32.4 
 
 		 1458 aa  95.1  1e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  24.79 
 
 		 1102 aa  93.6  3e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  28.06 
 
 		 1070 aa  93.2  4e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  52.68 
 
 		 1882 aa  92.8  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  37.31 
 
 		 1530 aa  92.4  7e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  42.27 
 
 		 1322 aa  91.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  36.25 
 
 		 1180 aa  91.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  27.58 
 
 		 1070 aa  90.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  35.97 
 
 		 1508 aa  90.9  2e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  34.46 
 
 		 3391 aa  87.8  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  26.65 
 
 		 825 aa  84  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  46.21 
 
 		 852 aa  84.3  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  41.04 
 
 		 955 aa  83.6  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  27.05 
 
 		 819 aa  83.2  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  40.3 
 
 		 955 aa  83.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  34.6 
 
 		 2642 aa  82.8  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  31.06 
 
 		 1004 aa  82  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  31.06 
 
 		 997 aa  82  0.00000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.1 
 
 		 1234 aa  81.6  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  24.02 
 
 		 1234 aa  81.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  24.02 
 
 		 1250 aa  81.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  37.68 
 
 		 4238 aa  81.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  42.86 
 
 		 1782 aa  79  0.0000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  45.62 
 
 		 2407 aa  78.6  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>