126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1396 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  99.34 
 
 		 759 aa  1543    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  99.21 
 
 		 759 aa  1539    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 759 aa  1555    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  37.86 
 
 		 815 aa  347  5e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  39.57 
 
 		 638 aa  306  8.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  39.57 
 
 		 638 aa  306  8.000000000000001e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  39.35 
 
 		 638 aa  302  1e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  32.72 
 
 		 709 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  32.03 
 
 		 800 aa  265  3e-69  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  36.24 
 
 		 731 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  31.17 
 
 		 769 aa  249  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  33.52 
 
 		 773 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  34.15 
 
 		 733 aa  246  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  33.92 
 
 		 732 aa  242  2e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  33.41 
 
 		 1008 aa  242  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  32.45 
 
 		 729 aa  233  9e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  33.04 
 
 		 730 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  34.07 
 
 		 747 aa  226  1e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0751  putative autotransporter, IS5K-containing  33.41 
 
 		 429 aa  218  4e-55  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  31.29 
 
 		 863 aa  217  8e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  31.29 
 
 		 863 aa  217  8e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  31.29 
 
 		 836 aa  216  9e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.29 
 
 		 836 aa  216  9e-55  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  31.29 
 
 		 836 aa  216  9e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  30.59 
 
 		 1571 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  30.63 
 
 		 1565 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  31.88 
 
 		 863 aa  213  1e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  31.49 
 
 		 1526 aa  212  3e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.83 
 
 		 1526 aa  211  5e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1179  putative autotransporter protein  31.56 
 
 		 1541 aa  199  1.0000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0425  pertactin family protein  31.56 
 
 		 1441 aa  197  8.000000000000001e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0113574 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1177  putative autotransporter protein  29.12 
 
 		 1117 aa  176  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1286  outer membrane autotransporter  28.78 
 
 		 562 aa  171  5e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1658  hypothetical protein  34.89 
 
 		 236 aa  152  2e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000110069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  25.26 
 
 		 765 aa  104  7e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  25.47 
 
 		 955 aa  85.1  0.000000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.47 
 
 		 955 aa  85.1  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  25.47 
 
 		 955 aa  84.7  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  25.47 
 
 		 955 aa  85.1  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.33795 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0402  outer membrane autotransporter  23.88 
 
 		 714 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3258  outer membrane autotransporter  24.25 
 
 		 1000 aa  80.9  0.00000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0437  outer membrane autotransporter  24.87 
 
 		 465 aa  80.5  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0409  putative autotransporter/pertactin  23.75 
 
 		 680 aa  79.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0415  flagellar protein  23.75 
 
 		 470 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0542626 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0291  outer membrane autotransporter domain protein  24.25 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0469  putative autotransporter/pertactin  23.75 
 
 		 868 aa  78.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.043223 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0407  outer membrane autotransporter  23.75 
 
 		 681 aa  78.6  0.0000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021193 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0427  putative autotransporter/pertactin  24 
 
 		 1003 aa  78.2  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326572  normal  0.353879 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1348  putative outer membrane autotransporter  23.96 
 
 		 961 aa  75.9  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  22.27 
 
 		 1067 aa  67.8  0.0000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4057  outer membrane autotransporter  22.78 
 
 		 389 aa  67.4  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  28.71 
 
 		 1093 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  28.71 
 
 		 1093 aa  66.6  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  27.87 
 
 		 909 aa  66.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  28 
 
 		 1115 aa  65.5  0.000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1317  hypothetical protein  34.82 
 
 		 136 aa  65.1  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000510687  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  28 
 
 		 1099 aa  65.1  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  24.76 
 
 		 947 aa  64.7  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2537  autotransporter beta-domain-containing protein  27.62 
 
 		 356 aa  64.7  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686468  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1786  outer membrane autotransporter  23.08 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.682029  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  24.42 
 
 		 927 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  25.07 
 
 		 914 aa  63.5  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  24.94 
 
 		 1285 aa  62.8  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0333  outer membrane autotransporter  22.49 
 
 		 1602 aa  61.6  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  24.31 
 
 		 1108 aa  61.2  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  24.68 
 
 		 1259 aa  61.2  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  25.19 
 
 		 1268 aa  60.8  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  25.06 
 
 		 1254 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1976  hypothetical protein  34 
 
 		 108 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242164  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  24.9 
 
 		 1040 aa  59.7  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  24.94 
 
 		 1259 aa  59.7  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2929  hypothetical protein  32.99 
 
 		 108 aa  60.1  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659634  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1818  outer membrane autotransporter  21.59 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  25 
 
 		 989 aa  58.5  0.0000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3656  outer membrane autotransporter  23.46 
 
 		 358 aa  58.9  0.0000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0145714 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  25.82 
 
 		 4312 aa  58.5  0.0000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  21.93 
 
 		 1070 aa  58.5  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  25.41 
 
 		 1004 aa  58.2  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  24.35 
 
 		 1269 aa  58.2  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  21.93 
 
 		 1070 aa  57.8  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  24.18 
 
 		 466 aa  57.4  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  25.82 
 
 		 4391 aa  56.6  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.42 
 
 		 1055 aa  56.6  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  24.84 
 
 		 1327 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  24.84 
 
 		 1806 aa  55.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  24.84 
 
 		 2057 aa  55.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  23.93 
 
 		 997 aa  55.1  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.88 
 
 		 1357 aa  54.3  0.000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  21.78 
 
 		 955 aa  54.3  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1013  Outer membrane autotransporter barrel  24.91 
 
 		 645 aa  52.8  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4650  serine protease EatA  28.11 
 
 		 1285 aa  53.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  26.72 
 
 		 818 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  24.6 
 
 		 820 aa  52.4  0.00003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  21.49 
 
 		 955 aa  52.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  25.13 
 
 		 864 aa  52.4  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  25.71 
 
 		 1579 aa  52  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0051  secreted serine peptidase EatA  28.9 
 
 		 1366 aa  52  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.611432  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.61 
 
 		 868 aa  51.6  0.00006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2717  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.05 
 
 		 877 aa  50.8  0.00009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  29.69 
 
 		 1741 aa  50.8  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>