60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_1177 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A0425  pertactin family protein  54.62 
 
 		 1441 aa  724    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0113574 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1286  outer membrane autotransporter  97.13 
 
 		 562 aa  1112    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1179  putative autotransporter protein  55.39 
 
 		 1541 aa  728    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1177  putative autotransporter protein  100 
 
 		 1117 aa  2240    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  32.13 
 
 		 732 aa  222  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  33.59 
 
 		 773 aa  219  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  29.51 
 
 		 863 aa  214  4.9999999999999996e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  29.65 
 
 		 863 aa  214  7e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  29.51 
 
 		 836 aa  214  7e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  29.51 
 
 		 836 aa  214  7e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.51 
 
 		 836 aa  214  7e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  32.09 
 
 		 731 aa  213  2e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  32.13 
 
 		 733 aa  212  3e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  29.51 
 
 		 863 aa  211  8e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  31.19 
 
 		 709 aa  205  4e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0751  putative autotransporter, IS5K-containing  33.33 
 
 		 429 aa  205  4e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  32.42 
 
 		 769 aa  205  5e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  33.57 
 
 		 747 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  31.82 
 
 		 729 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  32.67 
 
 		 730 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  27.68 
 
 		 1565 aa  197  1e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  27.4 
 
 		 1571 aa  194  5e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  28.48 
 
 		 1526 aa  191  5e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1287  pertactin  43.58 
 
 		 454 aa  177  8e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  29.12 
 
 		 759 aa  176  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  28.92 
 
 		 759 aa  174  5.999999999999999e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  28.92 
 
 		 759 aa  174  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.21 
 
 		 1526 aa  169  4e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  29.24 
 
 		 638 aa  163  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  29.24 
 
 		 638 aa  163  1e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  29.24 
 
 		 638 aa  164  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  27.59 
 
 		 1008 aa  158  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1658  hypothetical protein  31.78 
 
 		 236 aa  126  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000110069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  26.1 
 
 		 815 aa  121  9e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  27.81 
 
 		 765 aa  109  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  27.92 
 
 		 800 aa  104  7e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0402  outer membrane autotransporter  28.24 
 
 		 714 aa  92  5e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0415  flagellar protein  29.14 
 
 		 470 aa  91.7  7e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0542626 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0407  outer membrane autotransporter  29.14 
 
 		 681 aa  90.9  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021193 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0409  putative autotransporter/pertactin  28.24 
 
 		 680 aa  90.9  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0469  putative autotransporter/pertactin  29.14 
 
 		 868 aa  90.1  2e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.043223 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0427  putative autotransporter/pertactin  28.81 
 
 		 1003 aa  89.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326572  normal  0.353879 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0437  outer membrane autotransporter  26.81 
 
 		 465 aa  82  0.00000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3258  outer membrane autotransporter  28.15 
 
 		 1000 aa  82  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0291  outer membrane autotransporter domain protein  26.81 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00325  hypothetical protein  28.15 
 
 		 968 aa  80.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00321  conserved hypothetical protein  28.15 
 
 		 968 aa  80.5  0.0000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0396  outer membrane autotransporter  28.15 
 
 		 922 aa  79.7  0.0000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381376  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  25.86 
 
 		 955 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.33795 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  25.86 
 
 		 955 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.86 
 
 		 955 aa  73.2  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  25.86 
 
 		 955 aa  73.2  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1348  putative outer membrane autotransporter  27.17 
 
 		 961 aa  72.8  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1317  hypothetical protein  34.82 
 
 		 136 aa  63.9  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000510687  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2929  hypothetical protein  34.02 
 
 		 108 aa  56.2  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659634  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1976  hypothetical protein  34.02 
 
 		 108 aa  55.8  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242164  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  24.83 
 
 		 1093 aa  48.5  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  24.83 
 
 		 1093 aa  48.5  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  25.52 
 
 		 1115 aa  45.8  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  23.45 
 
 		 1099 aa  45.1  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>