128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpAngola_A2781 on replicon NC_010159
Organism: Yersinia pestis Angola



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  98.81 
 
 
759 aa  1535    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  100 
 
 
759 aa  1554    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  99.21 
 
 
759 aa  1539    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  37.86 
 
 
815 aa  346  7e-94  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  39.57 
 
 
638 aa  306  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  39.57 
 
 
638 aa  306  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  39.35 
 
 
638 aa  302  2e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  32.72 
 
 
709 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  32.03 
 
 
800 aa  263  1e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  36.02 
 
 
731 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  31.17 
 
 
769 aa  247  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  33.52 
 
 
773 aa  247  6e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  33.92 
 
 
733 aa  244  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  33.92 
 
 
732 aa  240  6.999999999999999e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  33.18 
 
 
1008 aa  239  2e-61  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  32.45 
 
 
729 aa  232  2e-59  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  33.04 
 
 
730 aa  231  3e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  33.85 
 
 
747 aa  224  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0751  putative autotransporter, IS5K-containing  33.18 
 
 
429 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  31.09 
 
 
863 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  31.09 
 
 
863 aa  215  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.925993 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  31.09 
 
 
836 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.09 
 
 
836 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  31.09 
 
 
836 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  30.59 
 
 
1571 aa  214  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  30.63 
 
 
1565 aa  213  1e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.426931 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  31.68 
 
 
863 aa  211  3e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  31.49 
 
 
1526 aa  211  6e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.83 
 
 
1526 aa  210  8e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1179  putative autotransporter protein  31.33 
 
 
1541 aa  197  6e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0425  pertactin family protein  31.33 
 
 
1441 aa  194  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0113574 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1177  putative autotransporter protein  28.92 
 
 
1117 aa  175  2.9999999999999996e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1286  outer membrane autotransporter  28.57 
 
 
562 aa  169  2e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1658  hypothetical protein  34.89 
 
 
236 aa  151  5e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000110069  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  24.91 
 
 
765 aa  102  3e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  25.47 
 
 
955 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.47 
 
 
955 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  25.47 
 
 
955 aa  83.6  0.00000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  25.47 
 
 
955 aa  84  0.00000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.33795 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0402  outer membrane autotransporter  23.63 
 
 
714 aa  80.9  0.00000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3258  outer membrane autotransporter  24 
 
 
1000 aa  79  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372144  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0437  outer membrane autotransporter  24.62 
 
 
465 aa  78.6  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00321  conserved hypothetical protein  23.5 
 
 
968 aa  78.2  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00325  hypothetical protein  23.5 
 
 
968 aa  78.2  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0291  outer membrane autotransporter domain protein  24 
 
 
398 aa  77.4  0.0000000000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0415  flagellar protein  23.5 
 
 
470 aa  77.4  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0542626 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0409  putative autotransporter/pertactin  23.5 
 
 
680 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0469  putative autotransporter/pertactin  23.5 
 
 
868 aa  77  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.043223 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0396  outer membrane autotransporter  23.5 
 
 
922 aa  76.6  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381376  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0427  putative autotransporter/pertactin  23.75 
 
 
1003 aa  76.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326572  normal  0.353879 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0407  outer membrane autotransporter  23.5 
 
 
681 aa  76.6  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000021193 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1348  putative outer membrane autotransporter  23.96 
 
 
961 aa  75.1  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  22.27 
 
 
1067 aa  67  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4057  outer membrane autotransporter  22.39 
 
 
389 aa  65.1  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.679978  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  24.76 
 
 
947 aa  64.7  0.000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  28.23 
 
 
1093 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  28.23 
 
 
1093 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  24.42 
 
 
927 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  27.5 
 
 
1115 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  27.32 
 
 
909 aa  63.9  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1317  hypothetical protein  34.82 
 
 
136 aa  63.5  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000510687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2537  autotransporter beta-domain-containing protein  27.07 
 
 
356 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.686468  normal  0.451266 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  24.94 
 
 
1285 aa  63.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  27.5 
 
 
1099 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  25.07 
 
 
914 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1786  outer membrane autotransporter  22.69 
 
 
358 aa  62.4  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.682029  normal  0.590012 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  24.38 
 
 
1108 aa  61.2  0.00000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  25.19 
 
 
1268 aa  61.2  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0333  outer membrane autotransporter  22.49 
 
 
1602 aa  60.8  0.00000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  24.68 
 
 
1259 aa  60.8  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  25.06 
 
 
1254 aa  60.1  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  24.94 
 
 
1259 aa  60.1  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1976  hypothetical protein  34 
 
 
108 aa  59.3  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242164  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2929  hypothetical protein  32.99 
 
 
108 aa  58.9  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659634  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  24.35 
 
 
1269 aa  58.2  0.0000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  25.82 
 
 
4312 aa  57.8  0.0000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  25 
 
 
989 aa  57.4  0.0000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  24.18 
 
 
466 aa  57  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  24.51 
 
 
1040 aa  57.4  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1818  outer membrane autotransporter  21.21 
 
 
358 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.694582  normal  0.431978 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  25.41 
 
 
1004 aa  57.4  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  21.93 
 
 
1070 aa  57  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  21.93 
 
 
1070 aa  57.4  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  24.84 
 
 
1327 aa  56.2  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3656  outer membrane autotransporter  21.54 
 
 
358 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0145714 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  25.82 
 
 
4391 aa  55.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  24.84 
 
 
1806 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  24.68 
 
 
2057 aa  55.1  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.97 
 
 
1055 aa  54.7  0.000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  23.93 
 
 
997 aa  54.7  0.000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.88 
 
 
1357 aa  53.5  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1013  Outer membrane autotransporter barrel  24.91 
 
 
645 aa  53.5  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.645383  normal  0.106647 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4650  serine protease EatA  28.11 
 
 
1285 aa  53.1  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  26.72 
 
 
818 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  21.49 
 
 
955 aa  52.4  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  24.6 
 
 
820 aa  52  0.00004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  25.43 
 
 
1579 aa  52  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal 
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0051  secreted serine peptidase EatA  28.9 
 
 
1366 aa  52  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.611432  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  25.13 
 
 
864 aa  51.6  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  29.69 
 
 
1741 aa  50.8  0.00009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>