89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0333 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0333  outer membrane autotransporter  100 
 
 
1602 aa  3124    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  26.88 
 
 
1008 aa  132  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  26.52 
 
 
773 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  23.86 
 
 
709 aa  113  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  26.62 
 
 
730 aa  107  1e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  23.7 
 
 
769 aa  107  2e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  26.11 
 
 
729 aa  105  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  26.11 
 
 
733 aa  105  7e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  24.46 
 
 
1234 aa  104  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  24.35 
 
 
731 aa  100  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  24.68 
 
 
732 aa  99.8  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  25.29 
 
 
1748 aa  92.8  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  24.8 
 
 
1099 aa  92.4  6e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  22.39 
 
 
947 aa  89.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  24.71 
 
 
1770 aa  84.3  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  23.87 
 
 
1040 aa  83.2  0.00000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  24.51 
 
 
1770 aa  82.8  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  22.92 
 
 
4391 aa  82  0.00000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  24.19 
 
 
1277 aa  80.5  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  22.92 
 
 
4312 aa  80.9  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  23.89 
 
 
819 aa  80.1  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  23.93 
 
 
1762 aa  77.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  23.93 
 
 
1762 aa  77.8  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  23.08 
 
 
747 aa  77.4  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  24.3 
 
 
825 aa  76.6  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  23.43 
 
 
955 aa  73.9  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.33795 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  23.23 
 
 
955 aa  72.4  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  23.23 
 
 
955 aa  72.4  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  23.5 
 
 
1763 aa  72.4  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.23 
 
 
955 aa  72.4  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  23.35 
 
 
1115 aa  72  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  22.93 
 
 
1594 aa  71.6  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  23.38 
 
 
1108 aa  71.2  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  23.29 
 
 
1741 aa  68.2  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  24.09 
 
 
836 aa  67.4  0.000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.97 
 
 
868 aa  67.8  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  24.09 
 
 
836 aa  67.4  0.000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.09 
 
 
836 aa  67.4  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  30.86 
 
 
1049 aa  67  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  24.09 
 
 
863 aa  67  0.000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  24.09 
 
 
863 aa  67  0.000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  22.44 
 
 
773 aa  65.1  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  23.08 
 
 
1579 aa  64.7  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  22.55 
 
 
1113 aa  64.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  25.94 
 
 
950 aa  63.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1348  putative outer membrane autotransporter  23.23 
 
 
961 aa  64.3  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  25.33 
 
 
1593 aa  62.8  0.00000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  26.22 
 
 
818 aa  62.8  0.00000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  21.56 
 
 
1093 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  23.11 
 
 
820 aa  60.8  0.0000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  23.4 
 
 
638 aa  60.8  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  21.56 
 
 
1093 aa  60.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  22.49 
 
 
759 aa  61.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  23.28 
 
 
638 aa  60.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  22.47 
 
 
909 aa  61.2  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  23.28 
 
 
638 aa  60.5  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  22.49 
 
 
759 aa  60.1  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  22.34 
 
 
1806 aa  58.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  22.51 
 
 
1327 aa  58.2  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  24.14 
 
 
2637 aa  58.5  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  23.56 
 
 
863 aa  58.2  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  22.44 
 
 
759 aa  57.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  22.32 
 
 
1526 aa  57  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  22.07 
 
 
1565 aa  56.2  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.426931 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.2 
 
 
1526 aa  55.8  0.000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0751  putative autotransporter, IS5K-containing  25 
 
 
429 aa  55.8  0.000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  23.19 
 
 
1349 aa  54.3  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  23.11 
 
 
1068 aa  53.5  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  22.95 
 
 
989 aa  53.1  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  22.95 
 
 
1327 aa  52.8  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  22.95 
 
 
1327 aa  52.4  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  22.11 
 
 
1571 aa  52  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  23.1 
 
 
1165 aa  51.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  23.1 
 
 
1165 aa  51.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  21.93 
 
 
924 aa  51.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  24.17 
 
 
864 aa  50.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1179  putative autotransporter protein  23.29 
 
 
1541 aa  49.7  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  22.06 
 
 
466 aa  50.1  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  21.63 
 
 
2578 aa  50.1  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.45 
 
 
806 aa  49.3  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  23.66 
 
 
927 aa  48.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  19.03 
 
 
1067 aa  47.8  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  21.63 
 
 
2906 aa  47.8  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  23.68 
 
 
1626 aa  47  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  22.37 
 
 
955 aa  47  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  22.37 
 
 
955 aa  46.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  21.63 
 
 
1861 aa  45.8  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0425  pertactin family protein  22.86 
 
 
1441 aa  45.8  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0113574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  23.79 
 
 
2057 aa  45.4  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>