106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3775 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  81.27 
 
 		 1259 aa  2004    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  85.9 
 
 		 1259 aa  2139    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  100 
 
 		 1285 aa  2548    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  78.52 
 
 		 1268 aa  1957    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  79.72 
 
 		 1254 aa  1956    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  97.12 
 
 		 1269 aa  2418    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  43.31 
 
 		 1012 aa  380  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  44.68 
 
 		 950 aa  378  1e-103  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  43.82 
 
 		 1108 aa  363  1e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  38.15 
 
 		 1571 aa  344  5.999999999999999e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  43.16 
 
 		 3415 aa  342  2.9999999999999998e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  40.88 
 
 		 2578 aa  342  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  41.08 
 
 		 2926 aa  340  9.999999999999999e-92  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  43.59 
 
 		 3420 aa  339  1.9999999999999998e-91  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  40.88 
 
 		 2906 aa  339  1.9999999999999998e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  40.88 
 
 		 1861 aa  339  2.9999999999999997e-91  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  39.09 
 
 		 1113 aa  322  3.9999999999999996e-86  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  33.83 
 
 		 1068 aa  308  5.0000000000000004e-82  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  38.52 
 
 		 1593 aa  300  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  39.11 
 
 		 861 aa  154  2e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  30.83 
 
 		 1349 aa  140  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  30.83 
 
 		 1327 aa  139  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  30.83 
 
 		 1327 aa  139  4e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  27.9 
 
 		 1806 aa  120  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  29.33 
 
 		 1327 aa  116  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  28.7 
 
 		 1099 aa  115  5e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  27.86 
 
 		 989 aa  114  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  31.74 
 
 		 1067 aa  112  3e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  30.02 
 
 		 466 aa  112  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  30.52 
 
 		 773 aa  112  5e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  29.03 
 
 		 947 aa  111  7.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  30.79 
 
 		 1070 aa  110  2e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  30.65 
 
 		 1070 aa  108  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  27.4 
 
 		 1165 aa  108  9e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  27.4 
 
 		 1165 aa  108  9e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  26.89 
 
 		 1040 aa  105  5e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  28.86 
 
 		 4391 aa  105  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  26.87 
 
 		 1579 aa  103  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  27.88 
 
 		 1594 aa  103  2e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  28.86 
 
 		 4312 aa  103  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  28.69 
 
 		 1748 aa  102  4e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  28.08 
 
 		 1753 aa  100  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  26.96 
 
 		 1093 aa  100  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  26.96 
 
 		 1093 aa  100  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  27.25 
 
 		 1102 aa  99  5e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  28.66 
 
 		 1770 aa  98.6  8e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  28.57 
 
 		 1762 aa  97.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  28.57 
 
 		 1762 aa  97.4  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.4 
 
 		 868 aa  98.2  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  28.51 
 
 		 1763 aa  97.4  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  28.64 
 
 		 1115 aa  95.9  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  27.66 
 
 		 1770 aa  95.9  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  29.43 
 
 		 2637 aa  93.6  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  26.97 
 
 		 2057 aa  88.6  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.7 
 
 		 1357 aa  87.4  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  26.65 
 
 		 1250 aa  84.3  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  30.24 
 
 		 1626 aa  83.6  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  26.87 
 
 		 1741 aa  80.5  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  26.17 
 
 		 820 aa  78.6  0.0000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  27.88 
 
 		 1234 aa  77  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.25 
 
 		 806 aa  77  0.000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  27.64 
 
 		 1277 aa  75.5  0.000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  42.11 
 
 		 506 aa  73.2  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  42.11 
 
 		 506 aa  73.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  26.18 
 
 		 825 aa  71.6  0.00000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  25.5 
 
 		 909 aa  70.9  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  25.67 
 
 		 924 aa  70.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  29.61 
 
 		 1004 aa  70.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  29.61 
 
 		 997 aa  70.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  45.83 
 
 		 1086 aa  70.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  25.94 
 
 		 819 aa  68.9  0.0000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.25 
 
 		 1023 aa  68.9  0.0000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  26.36 
 
 		 864 aa  67  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  39.17 
 
 		 3322 aa  66.2  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  39.64 
 
 		 955 aa  64.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  39.64 
 
 		 955 aa  64.7  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  31.46 
 
 		 1250 aa  64.3  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  32.29 
 
 		 1254 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  31.46 
 
 		 1234 aa  63.9  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  24.94 
 
 		 759 aa  62.8  0.00000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  24.94 
 
 		 759 aa  62.8  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  31.09 
 
 		 1252 aa  62.4  0.00000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.46 
 
 		 1234 aa  62  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  31.46 
 
 		 1234 aa  62  0.00000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.85 
 
 		 1055 aa  61.6  0.00000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  24.94 
 
 		 759 aa  61.2  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1972  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.23 
 
 		 1197 aa  58.9  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.832027  normal  0.568069 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  25.97 
 
 		 1049 aa  58.5  0.0000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  34.36 
 
 		 818 aa  58.2  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  25.87 
 
 		 1971 aa  55.1  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  35.82 
 
 		 927 aa  54.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  27.46 
 
 		 995 aa  54.7  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  24.87 
 
 		 769 aa  53.5  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2249  antigen 43  27.91 
 
 		 948 aa  52.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  37.7 
 
 		 914 aa  52  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4892  antigen 43  28.07 
 
 		 948 aa  52  0.00007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  23.8 
 
 		 709 aa  49.3  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.16 
 
 		 1009 aa  49.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1395  pertactin family protein  27.06 
 
 		 949 aa  49.3  0.0004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.830364  normal  0.238303 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  23.51 
 
 		 638 aa  48.9  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>