141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1463 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  51.18 
 
 		 730 aa  665    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  50.7 
 
 		 729 aa  661    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  50 
 
 		 773 aa  693    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  54.38 
 
 		 732 aa  732    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  63.06 
 
 		 731 aa  889    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  100 
 
 		 733 aa  1454    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  50.36 
 
 		 747 aa  621  1e-176  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  43.88 
 
 		 709 aa  520  1e-146  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  42.96 
 
 		 769 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  34.63 
 
 		 1008 aa  379  1e-103  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  34.86 
 
 		 638 aa  247  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  34.86 
 
 		 638 aa  247  6.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1396  outer membrane autotransporter  34.15 
 
 		 759 aa  246  9.999999999999999e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  34.86 
 
 		 638 aa  245  1.9999999999999999e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2781  putative autotransporter protein  33.92 
 
 		 759 aa  243  6e-63  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.607714  hitchhiker  0.00262672 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1288  putative autotransporter protein  33.7 
 
 		 759 aa  241  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0916938  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02119  predicted autotransporter outer membrane protein  33.33 
 
 		 836 aa  237  7e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.463949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02078  hypothetical protein  33.33 
 
 		 836 aa  237  7e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.513967  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1468  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.33 
 
 		 836 aa  237  7e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0686504  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1458  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 		 863 aa  237  7e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.925993 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2329  putative autotransporter, IS5K-containing  33.33 
 
 		 863 aa  237  8e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1179  putative autotransporter protein  33.65 
 
 		 1541 aa  233  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.599908  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3329  putative autotransporter, IS5K-containing  34.84 
 
 		 863 aa  233  9e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0425  pertactin family protein  33.65 
 
 		 1441 aa  232  2e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0113574 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0751  putative autotransporter, IS5K-containing  34.31 
 
 		 429 aa  231  3e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3895  hypothetical protein  32.1 
 
 		 1571 aa  226  8e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2773  hypothetical protein  31.33 
 
 		 1565 aa  217  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.426931 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1028  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.4 
 
 		 1526 aa  214  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1052  outer membrane autotransporter  31.4 
 
 		 1526 aa  215  2.9999999999999995e-54  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1177  putative autotransporter protein  32.13 
 
 		 1117 aa  212  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1286  outer membrane autotransporter  31.9 
 
 		 562 aa  210  8e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0512  putative adhesin/invasin  27.84 
 
 		 815 aa  171  4e-41  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.356196  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0407  outer membrane autotransporter  28.97 
 
 		 681 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000021193 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0363  putative outer membrane autotransporter  27.97 
 
 		 765 aa  148  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.497355  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0415  flagellar protein  29.07 
 
 		 470 aa  148  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0542626 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0409  putative autotransporter/pertactin  29.07 
 
 		 680 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0469  putative autotransporter/pertactin  29.12 
 
 		 868 aa  146  1e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.043223 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0513  putative adhesin/invasin  26.89 
 
 		 800 aa  146  1e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.333959  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0427  putative autotransporter/pertactin  28.8 
 
 		 1003 aa  146  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.326572  normal  0.353879 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0402  outer membrane autotransporter  28.05 
 
 		 714 aa  144  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1658  hypothetical protein  37.56 
 
 		 236 aa  140  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000110069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3258  outer membrane autotransporter  27.95 
 
 		 1000 aa  135  3e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.372144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0291  outer membrane autotransporter domain protein  28.05 
 
 		 398 aa  134  5e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0396  outer membrane autotransporter  27.53 
 
 		 922 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.381376  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00321  conserved hypothetical protein  27.53 
 
 		 968 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00325  hypothetical protein  27.53 
 
 		 968 aa  132  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0437  outer membrane autotransporter  28.49 
 
 		 465 aa  131  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1306  putative outer membrane autotransporter  26.76 
 
 		 955 aa  127  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2424  outer membrane autotransporter  26.76 
 
 		 955 aa  127  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.33795 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01177  predicted adhesin  26.76 
 
 		 955 aa  127  8.000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2446  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.76 
 
 		 955 aa  127  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.522244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1348  putative outer membrane autotransporter  26.02 
 
 		 961 aa  117  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0333  outer membrane autotransporter  26.11 
 
 		 1602 aa  106  1e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  26.06 
 
 		 1748 aa  104  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  27.55 
 
 		 1762 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  27.55 
 
 		 1762 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  26.99 
 
 		 1763 aa  100  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  25.04 
 
 		 1579 aa  99.8  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  26.09 
 
 		 1753 aa  97.4  9e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  26.23 
 
 		 947 aa  95.5  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.29 
 
 		 806 aa  94.7  5e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  25.85 
 
 		 1770 aa  95.1  5e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  27.36 
 
 		 1806 aa  94.7  5e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  27.36 
 
 		 1327 aa  94  8e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  26.28 
 
 		 1770 aa  92.4  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  27.27 
 
 		 4391 aa  91.3  6e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  27.21 
 
 		 4312 aa  90.9  7e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  27.15 
 
 		 466 aa  90.1  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  24.05 
 
 		 1067 aa  83.6  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  26.81 
 
 		 955 aa  80.9  0.00000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  26.81 
 
 		 955 aa  79.7  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  22.46 
 
 		 1594 aa  79  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  24.74 
 
 		 1277 aa  78.6  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  29.58 
 
 		 2057 aa  77.4  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  24.03 
 
 		 1070 aa  76.6  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1317  hypothetical protein  37.07 
 
 		 136 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000510687  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  23.72 
 
 		 1070 aa  75.1  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  23.79 
 
 		 1234 aa  74.7  0.000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.4 
 
 		 1234 aa  74.3  0.000000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  24.4 
 
 		 1250 aa  73.9  0.000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0051  secreted serine peptidase EatA  23.21 
 
 		 1366 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.611432  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  24.34 
 
 		 1234 aa  73.6  0.00000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  24.66 
 
 		 1040 aa  72.8  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  24.91 
 
 		 773 aa  72  0.00000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  27.45 
 
 		 3322 aa  72  0.00000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  24.24 
 
 		 1234 aa  70.9  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.38 
 
 		 868 aa  68.9  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  24.8 
 
 		 1252 aa  67.8  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  29.95 
 
 		 909 aa  66.2  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  23.36 
 
 		 1250 aa  65.9  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  25.84 
 
 		 1004 aa  65.9  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1976  hypothetical protein  37 
 
 		 108 aa  64.3  0.000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0242164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0104  immunoglobulin A1 protease domain protein  23.57 
 
 		 1300 aa  62.8  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.270044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2929  hypothetical protein  37 
 
 		 108 aa  63.2  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.659634  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  25.84 
 
 		 997 aa  63.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.48 
 
 		 1055 aa  62.4  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  26.75 
 
 		 1349 aa  61.6  0.00000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  26.75 
 
 		 1327 aa  61.2  0.00000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  26.75 
 
 		 1327 aa  60.8  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  29.05 
 
 		 994 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>