115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2288 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 806 aa  1608    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  34.98 
 
 		 1594 aa  322  1.9999999999999998e-86  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.03 
 
 		 868 aa  305  2.0000000000000002e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  34.05 
 
 		 1579 aa  300  6e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  36.69 
 
 		 2637 aa  283  9e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  36.47 
 
 		 1349 aa  271  5e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  33.89 
 
 		 1327 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  36.27 
 
 		 1327 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  31.73 
 
 		 773 aa  268  2.9999999999999995e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  34.09 
 
 		 1806 aa  262  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  34.17 
 
 		 1327 aa  261  4e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  35.36 
 
 		 466 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  35.43 
 
 		 989 aa  244  6e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  31.71 
 
 		 4391 aa  242  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  31.71 
 
 		 4312 aa  242  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  33.54 
 
 		 2057 aa  234  6e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  30.87 
 
 		 3322 aa  227  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  32.19 
 
 		 1234 aa  208  3e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.72 
 
 		 1086 aa  207  7e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  28.4 
 
 		 1102 aa  206  2e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  28.62 
 
 		 1165 aa  189  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  28.62 
 
 		 1165 aa  189  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  32.5 
 
 		 1277 aa  188  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  32.65 
 
 		 955 aa  179  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  32.65 
 
 		 955 aa  179  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  36.75 
 
 		 1626 aa  167  9e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  28.25 
 
 		 1004 aa  159  2e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  27.55 
 
 		 997 aa  152  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01154  hypothetical protein  33.23 
 
 		 338 aa  150  9e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  28.98 
 
 		 995 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1312  autotransporter (AT) family porin  32.96 
 
 		 306 aa  136  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000904355  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  28.09 
 
 		 1234 aa  134  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  28.39 
 
 		 1252 aa  133  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  28.27 
 
 		 1234 aa  134  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  28.6 
 
 		 1250 aa  132  3e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.46 
 
 		 1234 aa  131  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  27.77 
 
 		 1250 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  28.17 
 
 		 1254 aa  128  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.41 
 
 		 1023 aa  126  2e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  28.13 
 
 		 1753 aa  123  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  31.11 
 
 		 1108 aa  121  4.9999999999999996e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  28.22 
 
 		 1748 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  28.17 
 
 		 1762 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  28.17 
 
 		 1762 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  28.55 
 
 		 950 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  26.22 
 
 		 729 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  27.55 
 
 		 1763 aa  114  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  28.82 
 
 		 3415 aa  113  1.0000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  28.72 
 
 		 3420 aa  112  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1880  outer membrane autotransporter  26.01 
 
 		 730 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.396897 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  28.04 
 
 		 818 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  30.33 
 
 		 2578 aa  107  9e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  30.33 
 
 		 1861 aa  107  1e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  30.3 
 
 		 1113 aa  106  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  29.5 
 
 		 2906 aa  106  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  27.24 
 
 		 1028 aa  103  9e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  30.58 
 
 		 2926 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  25.39 
 
 		 731 aa  102  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  28.47 
 
 		 1012 aa  102  3e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  29.17 
 
 		 1099 aa  101  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  29.08 
 
 		 1571 aa  99.8  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  26.91 
 
 		 1770 aa  99.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  28.6 
 
 		 819 aa  99  3e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  28.21 
 
 		 825 aa  98.2  6e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  26.75 
 
 		 1770 aa  97.1  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2034  Outer membrane autotransporter barrel  24.57 
 
 		 732 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.449525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2011  autotransporter, putative  23.34 
 
 		 769 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  27.36 
 
 		 909 aa  92  3e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  33.08 
 
 		 861 aa  92  4e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  27.96 
 
 		 1285 aa  90.9  8e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  24.85 
 
 		 773 aa  90.9  9e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  23.55 
 
 		 733 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  23.37 
 
 		 709 aa  89  3e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  28.09 
 
 		 1040 aa  89  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  27.68 
 
 		 1268 aa  89  3e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2897  Outer membrane autotransporter barrel  25.46 
 
 		 747 aa  84.7  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.112297  normal  0.27831 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  28.31 
 
 		 1093 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  28.31 
 
 		 1093 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  37.04 
 
 		 1049 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  44.35 
 
 		 1068 aa  80.5  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  28.6 
 
 		 1115 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  25.46 
 
 		 1593 aa  78.2  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  26.13 
 
 		 947 aa  78.2  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  24.72 
 
 		 1067 aa  77.8  0.0000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  40.25 
 
 		 1259 aa  77.4  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  31.92 
 
 		 506 aa  75.9  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  31.92 
 
 		 506 aa  75.5  0.000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  24.62 
 
 		 820 aa  73.6  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  38.04 
 
 		 1259 aa  73.9  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  38.99 
 
 		 1269 aa  73.6  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  30.88 
 
 		 1070 aa  72.8  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  30.39 
 
 		 1070 aa  72  0.00000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  38.99 
 
 		 1254 aa  72  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2985  putative autotransporter protein  22.54 
 
 		 638 aa  64.3  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3064  outer membrane autotransporter  22.54 
 
 		 638 aa  64.3  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  23.14 
 
 		 927 aa  61.6  0.00000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1888  putative autotransporter protein  21.6 
 
 		 638 aa  60.8  0.00000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0815512  hitchhiker  0.00028295 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  26.93 
 
 		 924 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  41.8 
 
 		 1009 aa  58.9  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  23.68 
 
 		 1741 aa  58.5  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>