131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1980 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012892  B21_01154  hypothetical protein  95.3 
 
 		 338 aa  641    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1980  autotransporter (AT) family porin  100 
 
 		 773 aa  1575    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0125961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1312  autotransporter (AT) family porin  97.71 
 
 		 306 aa  634  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000904355  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  42.25 
 
 		 1594 aa  504  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0377  putative outer membrane autotransporter  50.83 
 
 		 1349 aa  483  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.120406 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0332  putative outer membrane autotransporter  51.04 
 
 		 1327 aa  484  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0374  putative outer membrane autotransporter  50.83 
 
 		 1327 aa  482  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.514292  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4201  outer membrane autotransporter  37.31 
 
 		 1579 aa  469  1.0000000000000001e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.597985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3228  outer membrane autotransporter barrel domain protein  42.61 
 
 		 868 aa  429  1e-119  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00110064  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  47.81 
 
 		 1806 aa  430  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  44.12 
 
 		 1327 aa  428  1e-118  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  46.07 
 
 		 2637 aa  426  1e-118  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01481  hypothetical protein  47.59 
 
 		 466 aa  424  1e-117  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  45.93 
 
 		 4391 aa  411  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  45.93 
 
 		 4312 aa  410  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  45 
 
 		 1165 aa  399  1e-109  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  45 
 
 		 1165 aa  399  1e-109  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0217  outer membrane protein IcsA  41.54 
 
 		 1102 aa  347  6e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3962  outer membrane autotransporter barrel domain  46.63 
 
 		 955 aa  326  1e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3981  outer membrane autotransporter barrel domain  45.71 
 
 		 955 aa  320  7.999999999999999e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  37.92 
 
 		 989 aa  292  1e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  28.5 
 
 		 1234 aa  259  1e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2288  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.27 
 
 		 806 aa  256  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.540701 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01153  hypothetical protein  43.3 
 
 		 506 aa  254  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580835  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1267  hypothetical protein  43.3 
 
 		 506 aa  254  6e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0117469  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0499  putative autotransporter protein  38.53 
 
 		 1004 aa  241  4e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0561  outer membrane autotransporter  37.35 
 
 		 997 aa  234  7.000000000000001e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  48.11 
 
 		 1626 aa  232  3e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  32.76 
 
 		 1277 aa  228  3e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  32.19 
 
 		 2057 aa  203  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2528  adhesin  28.74 
 
 		 1252 aa  202  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3367  adhesin  27.85 
 
 		 1234 aa  201  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1426  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.84 
 
 		 1234 aa  200  7e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.221475  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2373  adhesin  28.84 
 
 		 1250 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1418  adhesin  28.84 
 
 		 1234 aa  199  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000765921 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  31.17 
 
 		 3322 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02159  adhesin  28.84 
 
 		 1250 aa  198  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2384  adhesin  28.28 
 
 		 1254 aa  196  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.985186 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3036  outer membrane autotransporter  27.57 
 
 		 995 aa  181  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3095  outer membrane autotransporter  25.47 
 
 		 1028 aa  159  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.446562  normal  0.576928 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0734  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.64 
 
 		 1086 aa  154  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.837049 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1059  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.06 
 
 		 1023 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  30.98 
 
 		 1108 aa  141  6e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  32.38 
 
 		 950 aa  139  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  30.77 
 
 		 1113 aa  130  7.000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  31.3 
 
 		 2578 aa  129  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  31.3 
 
 		 1861 aa  128  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  31.3 
 
 		 2906 aa  128  5e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  26.03 
 
 		 1012 aa  127  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  29.02 
 
 		 3420 aa  122  3e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  25.33 
 
 		 947 aa  122  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  29.2 
 
 		 3415 aa  122  3.9999999999999996e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  27.82 
 
 		 1040 aa  117  8.999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0695  putative autotransporter protein  30.86 
 
 		 1259 aa  114  8.000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.931243  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  28.86 
 
 		 1571 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3775  putative autotransporter protein  30.86 
 
 		 1285 aa  113  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3513  outer membrane autotransporter  30.13 
 
 		 1268 aa  112  3e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.273383  normal  0.696988 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0694  putative autotransporter protein  30.77 
 
 		 1259 aa  111  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  28.65 
 
 		 1593 aa  110  7.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3865  outer membrane autotransporter  30.86 
 
 		 1269 aa  110  7.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  26.67 
 
 		 2926 aa  108  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0763  outer membrane autotransporter  30.62 
 
 		 1254 aa  108  3e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  25.7 
 
 		 1748 aa  105  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  27.02 
 
 		 1068 aa  103  9e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  26.98 
 
 		 1763 aa  103  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  26.82 
 
 		 825 aa  101  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  26.54 
 
 		 1762 aa  99  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  26.54 
 
 		 1762 aa  99  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.6 
 
 		 1357 aa  98.6  4e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  26.61 
 
 		 819 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4055  putative autotransporter protein  25.48 
 
 		 1067 aa  96.3  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  25.1 
 
 		 818 aa  95.9  3e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  25.14 
 
 		 1753 aa  95.1  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0107  outer membrane autotransporter  24.85 
 
 		 1070 aa  94  9e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4077  putative autotransporter protein  25.11 
 
 		 1070 aa  92.8  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00997828 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  26.47 
 
 		 1741 aa  90.9  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  31.92 
 
 		 861 aa  90.9  7e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  26.84 
 
 		 1770 aa  89.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  24.86 
 
 		 1770 aa  85.1  0.000000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1247  autotransporter protein YapE  26.93 
 
 		 820 aa  84  0.00000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.56 
 
 		 1055 aa  83.6  0.00000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  26.8 
 
 		 1099 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  46.23 
 
 		 914 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1220  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.87 
 
 		 863 aa  78.2  0.0000000000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  25.8 
 
 		 1093 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  25.8 
 
 		 1093 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3035  outer membrane autotransporter  22.19 
 
 		 1008 aa  76.6  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.935795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  25.65 
 
 		 924 aa  74.3  0.000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1463  outer membrane autotransporter  24.91 
 
 		 733 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.458818  normal  0.71316 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  33.52 
 
 		 927 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3408  Outer membrane autotransporter barrel  23.13 
 
 		 709 aa  70.1  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.560212  normal  0.144243 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  31.51 
 
 		 1049 aa  67.8  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  24.27 
 
 		 1115 aa  67.8  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  23.6 
 
 		 864 aa  67.8  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1283  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.29 
 
 		 870 aa  67.4  0.0000000009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0822  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.48 
 
 		 854 aa  67  0.000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2225  autotransporter, putative  22.78 
 
 		 773 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192143  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3827  outer membrane autotransporter  23.83 
 
 		 731 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.21 
 
 		 1009 aa  65.9  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1489  outer membrane autotransporter  23.88 
 
 		 729 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>