266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0614 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  62.27 
 
 
1357 aa  805    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 
1741 aa  3294    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  53.92 
 
 
1055 aa  625  1e-177  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  34.8 
 
 
1099 aa  280  2e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  36.5 
 
 
950 aa  276  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  34.08 
 
 
1093 aa  272  4e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  34.08 
 
 
1093 aa  272  4e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  32.69 
 
 
1115 aa  246  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1341  Outer membrane autotransporter barrel  32.21 
 
 
1040 aa  203  1.9999999999999998e-50  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.108803  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  32.17 
 
 
1113 aa  200  2.0000000000000003e-49  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  37.14 
 
 
861 aa  198  6e-49  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  31.77 
 
 
2906 aa  196  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3451  outer membrane autotransporter  30.47 
 
 
909 aa  195  7e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 
1571 aa  182  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  30.47 
 
 
1108 aa  182  4.999999999999999e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  30.87 
 
 
2578 aa  178  6e-43  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3069  outer membrane autotransporter  32.39 
 
 
825 aa  177  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.27692  normal  0.553853 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  31.12 
 
 
1861 aa  177  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2797  outer membrane autotransporter  30.38 
 
 
818 aa  173  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0467702  normal  0.0793019 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2655  outer membrane autotransporter  32.19 
 
 
819 aa  174  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  31.45 
 
 
3420 aa  169  4e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  31.3 
 
 
3415 aa  167  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  44.81 
 
 
1971 aa  166  3e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3419  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.75 
 
 
1009 aa  159  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.270033 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  28.01 
 
 
1593 aa  158  9e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  31.33 
 
 
2926 aa  157  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3806  Outer membrane autotransporter barrel  29.98 
 
 
924 aa  154  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.27944  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.98 
 
 
1322 aa  149  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  29.32 
 
 
3322 aa  146  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  32.58 
 
 
1881 aa  144  1.9999999999999998e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0640  outer membrane autotransporter  28.3 
 
 
1763 aa  140  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3759  outer membrane autotransporter barrel  28.68 
 
 
1753 aa  140  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0190  Outer membrane autotransporter barrel  28.19 
 
 
1762 aa  139  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.487352  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1289  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.02 
 
 
985 aa  139  5e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0969666  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0673  outer membrane autotransporter  28.19 
 
 
1762 aa  139  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  33.61 
 
 
1530 aa  138  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1979  Outer membrane autotransporter barrel  31.59 
 
 
947 aa  138  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0897948  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  26.63 
 
 
1806 aa  135  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03531  hypothetical protein  27.06 
 
 
1165 aa  135  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.1665  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03479  hypothetical protein  27.06 
 
 
1165 aa  135  6.999999999999999e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.112471  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2710  outer membrane autotransporter  29.47 
 
 
1748 aa  132  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2492  Outer membrane autotransporter barrel  32.41 
 
 
914 aa  132  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115679  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0594  outer membrane autotransporter  28.29 
 
 
1770 aa  132  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367872  normal  0.807711 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2763  autotransporter, putative  31.87 
 
 
927 aa  132  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0118216  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2862  filamentous haemagglutinin-like protein  33.93 
 
 
1003 aa  131  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0568  outer membrane autotransporter  28.16 
 
 
1770 aa  131  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  27.88 
 
 
2057 aa  130  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1053  filamentous haemagglutinin-like protein  34.38 
 
 
1447 aa  130  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0559145  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  33.16 
 
 
1451 aa  130  2.0000000000000002e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  36.82 
 
 
1458 aa  129  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1276  Outer membrane autotransporter barrel protein  30.33 
 
 
1049 aa  129  7e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0821611 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1536  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.34 
 
 
1004 aa  125  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.00333772  normal  0.683009 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  33.77 
 
 
3506 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2282  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  34.27 
 
 
1081 aa  124  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.41488 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3284  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.11 
 
 
1137 aa  124  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.934286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5177  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.09 
 
 
1148 aa  123  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.445577  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  35.88 
 
 
1111 aa  122  9e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  30.12 
 
 
1626 aa  120  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  37.2 
 
 
1119 aa  120  3e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1018  adhesive protein CupB5  31.69 
 
 
1009 aa  119  5e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.284554  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2510  outer membrane autotransporter  28.09 
 
 
2637 aa  119  5e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.995236  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  33.49 
 
 
2346 aa  119  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5707  adhesive protein CupB5  31.23 
 
 
991 aa  119  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  33.49 
 
 
2365 aa  119  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3062  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  27.67 
 
 
4016 aa  117  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00313386 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3705  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  32.28 
 
 
1105 aa  117  2.0000000000000002e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.249518 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12280  hypothetical protein  31.07 
 
 
2716 aa  116  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  40.39 
 
 
3391 aa  117  3e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3174  hemagglutination domain-containing protein  30.68 
 
 
1910 aa  116  4.0000000000000004e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.361804  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2394  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  33.42 
 
 
4500 aa  116  4.0000000000000004e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3312  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.38 
 
 
2054 aa  116  5e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0725  filamentous haemagglutinin-like protein  32.91 
 
 
2334 aa  115  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37890  Filamentous hemagglutinin domain-containing protein  31.66 
 
 
1419 aa  115  8.000000000000001e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.687016  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0943  filamentous haemagglutinin-like protein  31.68 
 
 
2328 aa  113  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  28.76 
 
 
1068 aa  113  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58900  large exoprotein  32.91 
 
 
1417 aa  112  8.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0117693 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2106  filamentous haemagglutinin, N-terminal  34.45 
 
 
2079 aa  111  1e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0197473  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  35.55 
 
 
1130 aa  111  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4206  outer membrane autotransporter  29.57 
 
 
1594 aa  111  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.664882  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0673  putative autotransporter protein  26.37 
 
 
4391 aa  110  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1603  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  29.17 
 
 
607 aa  110  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.17462  normal  0.795272 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  40.98 
 
 
1459 aa  110  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.16 
 
 
3629 aa  109  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3430  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.73 
 
 
5613 aa  109  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0177269 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0780  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  30.77 
 
 
3132 aa  109  4e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.630028 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4252  outer membrane autotransporter  27.25 
 
 
864 aa  109  6e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0372  Outer membrane autotransporter barrel  28.66 
 
 
1277 aa  108  6e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.617347  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4106  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  31.41 
 
 
800 aa  108  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0612134  normal  0.370277 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  42.74 
 
 
2711 aa  108  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  37.09 
 
 
1882 aa  108  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.63 
 
 
1532 aa  108  1e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61200  hypothetical protein  30.88 
 
 
1994 aa  108  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2664  filamentous hemeagglutinin family outer membrane protein  30.1 
 
 
1058 aa  107  1e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  39.88 
 
 
2396 aa  107  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5271  hemagglutination activity domain-containing protein  30.88 
 
 
2271 aa  107  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0743  outer membrane autotransporter  24.62 
 
 
4312 aa  106  5e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4504  outer membrane autotransporter  30.43 
 
 
1012 aa  105  6e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.590771  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3770  Outer membrane autotransporter barrel  27.26 
 
 
1234 aa  105  8e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  37.01 
 
 
1508 aa  105  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0748  filamentous haemagglutinin-like protein  31.54 
 
 
390 aa  105  9e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.704937  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>