164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_00711 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  100 
 
 		 2711 aa  5019    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  52.6 
 
 		 3506 aa  627  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  32.04 
 
 		 2906 aa  430  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  42.28 
 
 		 2365 aa  407  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  42.49 
 
 		 2346 aa  395  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  37.15 
 
 		 1782 aa  387  1e-105  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  42.18 
 
 		 2366 aa  379  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  29.19 
 
 		 1881 aa  356  2.9999999999999997e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  34.95 
 
 		 1119 aa  354  1e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  42.06 
 
 		 2371 aa  353  4e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  34.68 
 
 		 1550 aa  349  5e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  32.09 
 
 		 2926 aa  345  5.999999999999999e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.2 
 
 		 3629 aa  291  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  30.83 
 
 		 3322 aa  280  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  40.5 
 
 		 4238 aa  278  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  40.55 
 
 		 4238 aa  270  4e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  34.5 
 
 		 1861 aa  236  4.0000000000000004e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.22 
 
 		 1227 aa  233  4e-59  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  33.88 
 
 		 2578 aa  231  2e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  30.32 
 
 		 2003 aa  223  3e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  30.03 
 
 		 3822 aa  219  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.92 
 
 		 1029 aa  219  7e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  31.9 
 
 		 1530 aa  217  1.9999999999999998e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  30.43 
 
 		 2396 aa  214  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  30.16 
 
 		 3954 aa  211  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  33.25 
 
 		 1593 aa  211  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  29.24 
 
 		 1508 aa  211  2e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  38.3 
 
 		 1971 aa  206  6e-51  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  31.69 
 
 		 995 aa  203  3e-50  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.44 
 
 		 1848 aa  202  7.999999999999999e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  31.47 
 
 		 986 aa  200  3e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.1 
 
 		 1011 aa  194  2e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  32.03 
 
 		 990 aa  193  2.9999999999999997e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.21 
 
 		 1532 aa  190  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  31 
 
 		 1055 aa  185  8.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  32.08 
 
 		 1038 aa  185  9.000000000000001e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  27.43 
 
 		 1519 aa  184  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  31.54 
 
 		 2363 aa  182  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.71 
 
 		 1081 aa  171  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.36 
 
 		 919 aa  170  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  30.7 
 
 		 1028 aa  169  8e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  29.43 
 
 		 991 aa  168  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  29.66 
 
 		 1459 aa  168  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  28.6 
 
 		 1033 aa  166  4.0000000000000004e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.93 
 
 		 1285 aa  165  1e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  30.81 
 
 		 983 aa  164  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  29.2 
 
 		 995 aa  163  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  33.25 
 
 		 3420 aa  163  5e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.19 
 
 		 1322 aa  162  8e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  33 
 
 		 3415 aa  162  8e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  28.07 
 
 		 2057 aa  161  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6534  outer membrane autotransporter barrel  39.95 
 
 		 415 aa  160  3e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0435676  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.55 
 
 		 972 aa  156  5.9999999999999996e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  29.04 
 
 		 1001 aa  154  2e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  28 
 
 		 1004 aa  154  3e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  37.48 
 
 		 3391 aa  152  9e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  28.65 
 
 		 1001 aa  152  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  29.19 
 
 		 1458 aa  151  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  34.31 
 
 		 1882 aa  150  5e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.08 
 
 		 1125 aa  149  6e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  29.23 
 
 		 1333 aa  148  1e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  34.47 
 
 		 1113 aa  147  4e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  27.91 
 
 		 650 aa  146  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  28.7 
 
 		 1152 aa  126  5e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  26.85 
 
 		 985 aa  120  3e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  31.21 
 
 		 1011 aa  117  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  26.64 
 
 		 1164 aa  116  5e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  33.49 
 
 		 3089 aa  115  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  26.67 
 
 		 2407 aa  113  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  30.14 
 
 		 1053 aa  112  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  35.39 
 
 		 994 aa  110  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  26.51 
 
 		 677 aa  109  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  42.74 
 
 		 1741 aa  107  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  29.95 
 
 		 852 aa  102  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  27.92 
 
 		 1129 aa  102  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  27.92 
 
 		 1129 aa  102  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  27.92 
 
 		 1131 aa  102  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  27.92 
 
 		 1131 aa  102  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  27.92 
 
 		 1131 aa  102  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  27.92 
 
 		 1131 aa  102  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  29.75 
 
 		 1016 aa  101  3e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  27.43 
 
 		 1006 aa  100  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  28.37 
 
 		 1062 aa  100  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  28.23 
 
 		 1130 aa  100  5e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  27.72 
 
 		 1056 aa  99.8  7e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  28.57 
 
 		 1131 aa  96.3  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  36.73 
 
 		 1111 aa  91.7  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  35.65 
 
 		 1632 aa  90.5  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.1 
 
 		 1357 aa  89  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.33 
 
 		 1694 aa  89  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  35.22 
 
 		 1806 aa  87  0.000000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  37.02 
 
 		 950 aa  82.8  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  34.38 
 
 		 1130 aa  81.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  27.69 
 
 		 488 aa  79.7  0.0000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  26.74 
 
 		 942 aa  79.3  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  28.95 
 
 		 1093 aa  78.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  28.95 
 
 		 1093 aa  78.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  24.34 
 
 		 980 aa  77.4  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  25.69 
 
 		 965 aa  76.3  0.000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  44.04 
 
 		 1571 aa  75.9  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>