87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2115 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 1694 aa  3225    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  32.38 
 
 		 1172 aa  288  5.999999999999999e-76  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  32.94 
 
 		 1458 aa  257  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  32.67 
 
 		 1459 aa  249  3e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.9 
 
 		 1322 aa  171  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1209  outer membrane autotransporter, putative  33.94 
 
 		 3484 aa  150  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1208  outer membrane autotransporter TapA  33.33 
 
 		 991 aa  136  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  28.84 
 
 		 1550 aa  130  3e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  28.31 
 
 		 2396 aa  107  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.12 
 
 		 1125 aa  106  4e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1881 aa  103  4e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  24.33 
 
 		 1519 aa  99  7e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.13 
 
 		 1489 aa  93.6  3e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  24.14 
 
 		 1769 aa  90.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  25.39 
 
 		 1119 aa  90.1  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  27.15 
 
 		 2711 aa  88.6  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  33.49 
 
 		 3954 aa  85.5  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.57 
 
 		 1011 aa  84.3  0.00000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  31.85 
 
 		 2407 aa  83.2  0.00000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  33.84 
 
 		 1180 aa  79.3  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  28.22 
 
 		 2366 aa  77.8  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  34.11 
 
 		 3822 aa  78.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  28.65 
 
 		 4238 aa  78.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  28.11 
 
 		 2346 aa  77.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  29.47 
 
 		 1971 aa  77  0.000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  34.11 
 
 		 4238 aa  76.3  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  31.65 
 
 		 995 aa  75.9  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  24.44 
 
 		 1782 aa  75.9  0.000000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  34.74 
 
 		 986 aa  75.5  0.000000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  27.94 
 
 		 2365 aa  75.1  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  29.04 
 
 		 1130 aa  75.1  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.65 
 
 		 1081 aa  72.8  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.05 
 
 		 1227 aa  72.4  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  28.92 
 
 		 1111 aa  71.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  26.77 
 
 		 3506 aa  70.5  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.47 
 
 		 1029 aa  70.5  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.05 
 
 		 1532 aa  68.9  0.0000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.87 
 
 		 1848 aa  68.2  0.000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.35 
 
 		 3629 aa  66.6  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  30.54 
 
 		 1333 aa  65.5  0.000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  28.09 
 
 		 942 aa  65.1  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  25.26 
 
 		 1806 aa  65.1  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  26.14 
 
 		 1626 aa  63.9  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  31.63 
 
 		 965 aa  63.5  0.00000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  30.77 
 
 		 814 aa  63.2  0.00000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.76 
 
 		 919 aa  62.4  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  32.23 
 
 		 1741 aa  60.5  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1156  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.5 
 
 		 979 aa  60.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  30.84 
 
 		 1001 aa  58.9  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1117  beta strand repeat-containing protein  28.19 
 
 		 422 aa  57.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  29.62 
 
 		 1164 aa  56.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  30 
 
 		 1019 aa  56.2  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  30.34 
 
 		 2003 aa  55.8  0.000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  35.66 
 
 		 949 aa  55.8  0.000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  35.66 
 
 		 970 aa  55.5  0.000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  35.66 
 
 		 998 aa  55.5  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  35.66 
 
 		 970 aa  55.5  0.000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  30.64 
 
 		 994 aa  55.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.47 
 
 		 972 aa  55.1  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  29.59 
 
 		 909 aa  55.1  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  31.14 
 
 		 1066 aa  53.9  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  32.64 
 
 		 1001 aa  53.5  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  26.4 
 
 		 2371 aa  53.9  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  26.24 
 
 		 1369 aa  53.5  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  31.58 
 
 		 1053 aa  53.5  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  24.92 
 
 		 1508 aa  53.5  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  32.11 
 
 		 2906 aa  52.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  36.03 
 
 		 987 aa  52  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  26.55 
 
 		 1882 aa  50.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  32.91 
 
 		 1593 aa  50.8  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5845  esterase EstA  25.91 
 
 		 646 aa  50.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  32.11 
 
 		 1099 aa  49.7  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  34.09 
 
 		 2926 aa  49.3  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  25.11 
 
 		 816 aa  48.9  0.0007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  31.3 
 
 		 650 aa  49.3  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  26.55 
 
 		 991 aa  48.9  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  26.22 
 
 		 1006 aa  48.9  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0318  outer membrane autotransporter  45.24 
 
 		 989 aa  48.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000433697 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  34.1 
 
 		 852 aa  48.5  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  33.13 
 
 		 882 aa  47.8  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  26.03 
 
 		 950 aa  47.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  28.57 
 
 		 1028 aa  47.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  27.14 
 
 		 972 aa  47.8  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.29 
 
 		 774 aa  46.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0245  Outer membrane autotransporter barrel  21.39 
 
 		 2175 aa  46.6  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.203155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  26.88 
 
 		 980 aa  46.2  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  30.84 
 
 		 1530 aa  45.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>