112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1031 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  100 
 
 
1172 aa  2197    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  38.5 
 
 
1458 aa  423  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  38.41 
 
 
1459 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.31 
 
 
1694 aa  379  1e-103  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.55 
 
 
1322 aa  249  2e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  39.11 
 
 
2366 aa  226  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  45.07 
 
 
2407 aa  219  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  38.65 
 
 
2365 aa  191  7e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  43.97 
 
 
2396 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  39.01 
 
 
2371 aa  186  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  35.94 
 
 
1508 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  37.65 
 
 
4238 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  37.65 
 
 
3822 aa  175  3.9999999999999995e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  33.83 
 
 
2906 aa  172  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  36.52 
 
 
2346 aa  169  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.29 
 
 
3629 aa  169  2.9999999999999998e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  35.16 
 
 
1971 aa  165  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1208  outer membrane autotransporter TapA  32.91 
 
 
991 aa  158  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1209  outer membrane autotransporter, putative  32.15 
 
 
3484 aa  154  1e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  34.41 
 
 
2363 aa  144  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  31.76 
 
 
2578 aa  143  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  39.48 
 
 
3954 aa  140  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.6 
 
 
1227 aa  132  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  32.35 
 
 
1550 aa  130  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  37.69 
 
 
1571 aa  127  9e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  33.91 
 
 
1111 aa  125  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.22 
 
 
1848 aa  123  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  31.22 
 
 
1881 aa  120  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  29.3 
 
 
1119 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  31.19 
 
 
1130 aa  114  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  30.09 
 
 
1782 aa  113  2.0000000000000002e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.62 
 
 
1285 aa  112  5e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  38.69 
 
 
1108 aa  111  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  38.51 
 
 
4238 aa  110  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  29.91 
 
 
1530 aa  102  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  30.41 
 
 
3391 aa  101  1e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  25.98 
 
 
2711 aa  101  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  34.29 
 
 
1882 aa  95.1  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  32.97 
 
 
3506 aa  93.6  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  37.86 
 
 
1099 aa  93.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  32.31 
 
 
950 aa  90.9  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.03 
 
 
1532 aa  90.1  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  28.43 
 
 
3322 aa  89.7  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  31.88 
 
 
3420 aa  85.1  0.000000000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  30.97 
 
 
852 aa  82.4  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  32.18 
 
 
3415 aa  82.4  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.09 
 
 
1357 aa  81.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  32.87 
 
 
2926 aa  81.3  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  39.42 
 
 
1741 aa  80.1  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  34.67 
 
 
1093 aa  78.2  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  34.67 
 
 
1093 aa  78.2  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  39.86 
 
 
1053 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  32 
 
 
1180 aa  75.5  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  34.91 
 
 
1593 aa  74.3  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  29.53 
 
 
1113 aa  74.3  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  37.74 
 
 
1164 aa  74.7  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.92 
 
 
1029 aa  74.3  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  35.29 
 
 
1769 aa  73.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3370  outer membrane autotransporter  43.06 
 
 
1068 aa  72.4  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  26.96 
 
 
2057 aa  71.6  0.00000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  31.47 
 
 
994 aa  70.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.36 
 
 
1489 aa  70.9  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  43.7 
 
 
1115 aa  69.3  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  31.72 
 
 
2642 aa  68.9  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  24.63 
 
 
1001 aa  65.1  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.25 
 
 
1125 aa  65.1  0.000000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.8 
 
 
1081 aa  64.3  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  46.34 
 
 
987 aa  62.8  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.8 
 
 
919 aa  61.6  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  31.65 
 
 
1001 aa  61.6  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  30.33 
 
 
986 aa  60.8  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  35.66 
 
 
1033 aa  60.5  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  40.4 
 
 
861 aa  59.7  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  29.28 
 
 
1446 aa  59.3  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0082  beta strand repeat-containing protein  30.79 
 
 
1300 aa  58.5  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  31.65 
 
 
991 aa  58.2  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  32.72 
 
 
1055 aa  57.8  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  36.26 
 
 
814 aa  57.8  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  28.18 
 
 
1861 aa  57.8  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  27.1 
 
 
1519 aa  57.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  32.68 
 
 
1806 aa  57.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  33.2 
 
 
1632 aa  57  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  28.33 
 
 
2003 aa  56.6  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  33.11 
 
 
1004 aa  56.2  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  28.99 
 
 
995 aa  56.2  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.16 
 
 
1011 aa  55.8  0.000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  37.3 
 
 
1062 aa  55.1  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0614  parallel beta-helix repeat-containing protein  38.68 
 
 
36805 aa  55.1  0.000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  37.87 
 
 
882 aa  55.1  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  29.38 
 
 
1325 aa  55.1  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  42.2 
 
 
1066 aa  54.7  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0725  Outer membrane autotransporter barrel  29.46 
 
 
3504 aa  54.7  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  34.13 
 
 
677 aa  53.5  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  33.33 
 
 
1028 aa  53.1  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  29.21 
 
 
1078 aa  52.8  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  34.44 
 
 
650 aa  51.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  29.17 
 
 
990 aa  50.8  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  32 
 
 
816 aa  48.9  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3640  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.59 
 
 
1673 aa  47.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2566  hypothetical protein  29.41 
 
 
617 aa  47  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>