123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3087 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  43.48 
 
 		 1111 aa  642    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  75.99 
 
 		 814 aa  835    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 		 2407 aa  4443    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  47.07 
 
 		 1081 aa  647    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  52.89 
 
 		 1019 aa  619  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  55.42 
 
 		 1078 aa  609  9.999999999999999e-173  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  57.38 
 
 		 1130 aa  580  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  55.99 
 
 		 987 aa  573  1e-161  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  47.53 
 
 		 1180 aa  566  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  50.4 
 
 		 907 aa  534  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  53.42 
 
 		 882 aa  529  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  43.83 
 
 		 1532 aa  370  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  37.62 
 
 		 1177 aa  284  2e-74  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  44.07 
 
 		 1458 aa  271  1e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  46.94 
 
 		 1459 aa  240  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  41.33 
 
 		 678 aa  231  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.05 
 
 		 3629 aa  212  7e-53  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  36.66 
 
 		 2396 aa  207  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  44.32 
 
 		 1172 aa  207  2e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  45.78 
 
 		 1322 aa  206  4e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  28.5 
 
 		 1881 aa  201  1.0000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  33.4 
 
 		 2906 aa  192  7e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  31.67 
 
 		 1530 aa  176  3.9999999999999995e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  29.08 
 
 		 2003 aa  174  2e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  27.64 
 
 		 1119 aa  162  6e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1826  outer membrane protein  59.12 
 
 		 190 aa  160  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400541  normal  0.391918 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  31.01 
 
 		 1971 aa  158  1e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  36.56 
 
 		 1508 aa  141  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  35.42 
 
 		 2578 aa  137  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.92 
 
 		 1227 aa  136  5e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.69 
 
 		 1848 aa  130  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  26.77 
 
 		 2711 aa  123  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.89 
 
 		 1694 aa  120  1.9999999999999998e-25  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.85 
 
 		 1029 aa  121  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  27.04 
 
 		 2366 aa  119  7.999999999999999e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  27.84 
 
 		 2346 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  27.84 
 
 		 2365 aa  117  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  41.51 
 
 		 2642 aa  115  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  44.4 
 
 		 1741 aa  113  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  34.4 
 
 		 3391 aa  110  3e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  27.09 
 
 		 2371 aa  107  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  24.45 
 
 		 1519 aa  103  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  40 
 
 		 994 aa  103  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  36.71 
 
 		 950 aa  101  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  37.58 
 
 		 2926 aa  99.8  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0933  outer membrane autotransporter  24.18 
 
 		 4248 aa  97.8  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.29 
 
 		 1489 aa  98.2  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  25.89 
 
 		 3506 aa  97.4  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  38.79 
 
 		 3954 aa  96.3  7e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  30.2 
 
 		 1782 aa  94.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2009  autotransporter-associated beta strand repeat protein  45.32 
 
 		 1806 aa  94  3e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.979207  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  45.32 
 
 		 1632 aa  92.8  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  25.23 
 
 		 816 aa  92.8  8e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  27.69 
 
 		 1333 aa  92.4  9e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  28.82 
 
 		 3322 aa  92  1e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  33.57 
 
 		 1113 aa  90.1  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  24.81 
 
 		 990 aa  88.6  0.000000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  43.4 
 
 		 1550 aa  87.4  0.000000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  41.12 
 
 		 1571 aa  86.7  0.000000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  39.34 
 
 		 4238 aa  86.7  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  25.28 
 
 		 1769 aa  86.7  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  35.14 
 
 		 2363 aa  85.1  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  38.89 
 
 		 3822 aa  84.7  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  28.04 
 
 		 1016 aa  84  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.82 
 
 		 919 aa  83.6  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  39.85 
 
 		 1099 aa  83.2  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  26.74 
 
 		 1028 aa  82.8  0.00000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  27.71 
 
 		 1325 aa  82.4  0.00000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  30.93 
 
 		 3415 aa  82.4  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  44.25 
 
 		 1093 aa  81.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  44.25 
 
 		 1093 aa  81.3  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  34.22 
 
 		 1164 aa  81.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  27.97 
 
 		 1152 aa  80.1  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  40.66 
 
 		 1115 aa  79.7  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  43.17 
 
 		 1446 aa  79  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  45.61 
 
 		 3420 aa  77  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  40.43 
 
 		 1593 aa  75.5  0.00000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  22.03 
 
 		 1369 aa  75.5  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  39.71 
 
 		 861 aa  74.3  0.00000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  27.89 
 
 		 1056 aa  73.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  36.5 
 
 		 4238 aa  73.6  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  36.36 
 
 		 1108 aa  73.6  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  34.41 
 
 		 1861 aa  73.6  0.00000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  28.31 
 
 		 1001 aa  73.2  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  25.38 
 
 		 1012 aa  70.1  0.0000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0082  beta strand repeat-containing protein  37.79 
 
 		 1300 aa  68.6  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  27.94 
 
 		 1001 aa  68.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0725  Outer membrane autotransporter barrel  32.11 
 
 		 3504 aa  68.6  0.000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  25.84 
 
 		 995 aa  67.8  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  28.5 
 
 		 1179 aa  67.4  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.57 
 
 		 1357 aa  66.2  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  29.21 
 
 		 852 aa  65.9  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.65 
 
 		 1125 aa  65.5  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  38.58 
 
 		 677 aa  65.5  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  28.06 
 
 		 986 aa  64.7  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3802  outer membrane autotransporter  24.51 
 
 		 2083 aa  65.1  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  29.11 
 
 		 1038 aa  62  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0264  beta strand repeat-containing protein  36.22 
 
 		 860 aa  62  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  29.41 
 
 		 1004 aa  62  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.57 
 
 		 972 aa  61.2  0.0000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>