156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_6533 on replicon NC_008062
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  50.09 
 
 		 2396 aa  732    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  50.93 
 
 		 1508 aa  898    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 		 3822 aa  6501    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  50.05 
 
 		 2365 aa  1219    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  50.02 
 
 		 2371 aa  1083    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  50.07 
 
 		 2346 aa  1219    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  99.95 
 
 		 4238 aa  5143    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  43.34 
 
 		 3629 aa  920    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  49.91 
 
 		 2366 aa  1166    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  98.46 
 
 		 4238 aa  5129    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  72.99 
 
 		 3954 aa  3341    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  31.24 
 
 		 1881 aa  451  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  44.05 
 
 		 3506 aa  439  1e-121  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  36.84 
 
 		 1971 aa  386  1e-105  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.97 
 
 		 1227 aa  355  8e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  32.09 
 
 		 1119 aa  342  9e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  31.91 
 
 		 2906 aa  324  1.9999999999999998e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.71 
 
 		 1285 aa  315  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  36.95 
 
 		 991 aa  312  6.999999999999999e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.91 
 
 		 1848 aa  311  2.0000000000000002e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  32.18 
 
 		 2003 aa  307  2.0000000000000002e-81  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  37.44 
 
 		 995 aa  303  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  32.49 
 
 		 1550 aa  296  5e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.68 
 
 		 1029 aa  281  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  35.45 
 
 		 990 aa  279  6e-73  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  35.59 
 
 		 1033 aa  275  2e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  34.72 
 
 		 1004 aa  270  5e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  31.68 
 
 		 3322 aa  268  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  31.9 
 
 		 2711 aa  265  1e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  33.38 
 
 		 986 aa  262  9e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  33.98 
 
 		 995 aa  258  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  31.5 
 
 		 1055 aa  257  3e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  34.72 
 
 		 1001 aa  253  5e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  34.22 
 
 		 1038 aa  253  8e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  34.85 
 
 		 1028 aa  251  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  29.6 
 
 		 1519 aa  248  9.999999999999999e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  34.36 
 
 		 1001 aa  243  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  32.82 
 
 		 650 aa  243  5.999999999999999e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  32.51 
 
 		 1782 aa  243  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  33.85 
 
 		 983 aa  238  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.56 
 
 		 919 aa  228  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  32.85 
 
 		 1530 aa  223  5e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  36.39 
 
 		 1053 aa  221  1e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  44 
 
 		 1459 aa  219  5.9999999999999996e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.49 
 
 		 972 aa  215  2e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  44.21 
 
 		 1458 aa  212  1e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  32.32 
 
 		 1164 aa  210  4e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  35.19 
 
 		 1129 aa  209  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  35.19 
 
 		 1131 aa  209  1e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  34.99 
 
 		 1129 aa  207  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  34.99 
 
 		 1131 aa  207  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  34.99 
 
 		 1131 aa  207  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  34.99 
 
 		 1131 aa  207  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.16 
 
 		 1011 aa  206  8e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  34.83 
 
 		 1130 aa  202  9e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  31.49 
 
 		 985 aa  199  7e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  35.19 
 
 		 1131 aa  198  2e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  30.27 
 
 		 1056 aa  196  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  31.86 
 
 		 994 aa  196  8e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  32.05 
 
 		 1333 aa  194  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  30.53 
 
 		 1011 aa  191  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  36.43 
 
 		 1172 aa  179  9.999999999999999e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  33.84 
 
 		 2578 aa  171  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  31.47 
 
 		 677 aa  170  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  33.91 
 
 		 1062 aa  167  3e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  33.24 
 
 		 980 aa  164  3e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  30.94 
 
 		 1152 aa  164  4e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  32.27 
 
 		 1006 aa  162  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  31.55 
 
 		 1016 aa  161  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  35.24 
 
 		 2407 aa  155  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.22 
 
 		 1125 aa  155  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  29.73 
 
 		 1882 aa  148  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.61 
 
 		 1532 aa  136  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  34.17 
 
 		 3391 aa  136  7.999999999999999e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  36.76 
 
 		 1113 aa  127  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  33.26 
 
 		 1741 aa  126  8e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  34.03 
 
 		 1111 aa  125  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  27.73 
 
 		 2057 aa  125  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  35.35 
 
 		 1130 aa  123  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.2 
 
 		 1694 aa  119  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  31.01 
 
 		 1593 aa  116  7.000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  27.49 
 
 		 2848 aa  112  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.61 
 
 		 1322 aa  111  2e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  30.4 
 
 		 2642 aa  109  1e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  33.76 
 
 		 994 aa  103  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.04 
 
 		 1081 aa  100  4e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  27.46 
 
 		 488 aa  100  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  29.22 
 
 		 1861 aa  99  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  33.09 
 
 		 852 aa  94.4  4e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  37.27 
 
 		 2926 aa  92  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  36.36 
 
 		 950 aa  89.4  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  43.18 
 
 		 2363 aa  88.6  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  29.2 
 
 		 814 aa  87.4  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  29.29 
 
 		 407 aa  85.9  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  36.24 
 
 		 861 aa  84.3  0.00000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  35.03 
 
 		 3420 aa  83.2  0.00000000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  28.57 
 
 		 1012 aa  82  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.63 
 
 		 774 aa  82  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  34.85 
 
 		 3415 aa  80.1  0.0000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  32.11 
 
 		 3089 aa  77.8  0.000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>