229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A2572 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1263  serine protease  99.73 
 
 
1129 aa  2240    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  100 
 
 
1129 aa  2245    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  92.04 
 
 
1130 aa  1972    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  99.73 
 
 
1131 aa  2240    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  99.73 
 
 
1131 aa  2240    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  99.56 
 
 
1131 aa  2237    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  99.91 
 
 
1131 aa  2244    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  99.73 
 
 
1131 aa  2240    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  49.17 
 
 
995 aa  513  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  47.18 
 
 
983 aa  511  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  52.34 
 
 
991 aa  510  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  47.76 
 
 
1001 aa  476  1e-132  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  45.44 
 
 
1001 aa  466  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  44.83 
 
 
1028 aa  380  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  39.29 
 
 
1055 aa  367  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  42.04 
 
 
1038 aa  360  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  41.98 
 
 
1033 aa  350  9e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  40.19 
 
 
1004 aa  335  4e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.05 
 
 
1125 aa  324  5e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  36.03 
 
 
986 aa  305  4.0000000000000003e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  34.66 
 
 
995 aa  300  1e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.36 
 
 
1029 aa  300  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  33.65 
 
 
1550 aa  275  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.49 
 
 
919 aa  272  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  32.11 
 
 
1119 aa  270  8.999999999999999e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  35.86 
 
 
1508 aa  243  1e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.09 
 
 
1227 aa  238  4e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.59 
 
 
1011 aa  235  3e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  34.58 
 
 
2003 aa  234  7.000000000000001e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  34.39 
 
 
3506 aa  232  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.46 
 
 
972 aa  228  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  36.52 
 
 
2371 aa  226  2e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  36.52 
 
 
2366 aa  226  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  29.73 
 
 
1881 aa  222  3e-56  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  32.94 
 
 
2365 aa  221  6e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  30.42 
 
 
650 aa  220  8.999999999999998e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  35.12 
 
 
4238 aa  220  8.999999999999998e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  32.94 
 
 
2346 aa  220  1e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  34.92 
 
 
4238 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  34.99 
 
 
2396 aa  219  2e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  32.63 
 
 
990 aa  219  2e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  35.12 
 
 
3822 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  33.72 
 
 
3954 aa  217  9e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.09 
 
 
1285 aa  217  9.999999999999999e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  34.76 
 
 
1053 aa  212  3e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  30.97 
 
 
1782 aa  210  1e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  31.55 
 
 
677 aa  201  9e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  33.27 
 
 
1062 aa  200  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.69 
 
 
1848 aa  198  4.0000000000000005e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  28.02 
 
 
1519 aa  192  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  29.17 
 
 
1164 aa  185  4.0000000000000006e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  30.25 
 
 
1333 aa  185  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  34.75 
 
 
1011 aa  178  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  30.47 
 
 
985 aa  172  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 
1056 aa  168  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  29.32 
 
 
1152 aa  152  4e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  28.95 
 
 
980 aa  150  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  28.2 
 
 
1006 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  30.15 
 
 
994 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  30.69 
 
 
1016 aa  145  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  30.91 
 
 
488 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.81 
 
 
906 aa  120  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  26.82 
 
 
974 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  27.61 
 
 
954 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4538  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.61 
 
 
710 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.12 
 
 
1489 aa  109  3e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  28 
 
 
2711 aa  107  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24 
 
 
913 aa  101  9e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  27.81 
 
 
959 aa  99  4e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  29.53 
 
 
1446 aa  98.2  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.73 
 
 
910 aa  97.4  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.19 
 
 
915 aa  96.3  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.84 
 
 
926 aa  94.4  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.82 
 
 
3629 aa  93.6  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.45 
 
 
774 aa  92.8  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  26.64 
 
 
816 aa  91.3  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  24.69 
 
 
1769 aa  89  4e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  27.38 
 
 
407 aa  87.8  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  27.34 
 
 
998 aa  84.7  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  26.46 
 
 
1156 aa  82.8  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  26.7 
 
 
1154 aa  82.4  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  25.43 
 
 
965 aa  82  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  26.85 
 
 
970 aa  81.6  0.00000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  32.48 
 
 
1180 aa  79  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  26.17 
 
 
1179 aa  77.4  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.18 
 
 
1134 aa  76.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  26.83 
 
 
942 aa  76.6  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  25.71 
 
 
909 aa  76.3  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  39.35 
 
 
987 aa  75.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  27.36 
 
 
1066 aa  75.5  0.000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  24.94 
 
 
970 aa  73.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1156  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.05 
 
 
979 aa  73.6  0.00000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  24.94 
 
 
949 aa  73.9  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  28.03 
 
 
882 aa  71.2  0.00000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.05 
 
 
1532 aa  70.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3186  putative autotransporter  45 
 
 
145 aa  70.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396056  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.39 
 
 
1081 aa  70.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  28.67 
 
 
1025 aa  70.5  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0273  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.4 
 
 
754 aa  69.7  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.74 
 
 
1322 aa  67.8  0.000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>