230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_0234 on replicon NC_008784
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1263  serine protease  100 
 
 
1129 aa  2246    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  99.73 
 
 
1129 aa  2240    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  91.86 
 
 
1130 aa  1966    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  100 
 
 
1131 aa  2250    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  100 
 
 
1131 aa  2250    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  99.47 
 
 
1131 aa  2239    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  99.82 
 
 
1131 aa  2246    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  100 
 
 
1131 aa  2250    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  49.17 
 
 
995 aa  515  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  47.34 
 
 
983 aa  512  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  52.34 
 
 
991 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  47.94 
 
 
1001 aa  478  1e-133  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  45.6 
 
 
1001 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  44.64 
 
 
1028 aa  379  1e-103  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  39.12 
 
 
1055 aa  365  3e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  41.85 
 
 
1038 aa  358  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  41.79 
 
 
1033 aa  348  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  40 
 
 
1004 aa  333  1e-89  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.88 
 
 
1125 aa  321  5e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  35.88 
 
 
986 aa  303  9e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  34.5 
 
 
995 aa  298  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.22 
 
 
1029 aa  297  6e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  33.38 
 
 
1550 aa  275  3e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.3 
 
 
919 aa  270  8.999999999999999e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  31.97 
 
 
1119 aa  268  2.9999999999999995e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  35.71 
 
 
1508 aa  241  5e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.95 
 
 
1227 aa  238  5.0000000000000005e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.96 
 
 
1011 aa  237  7e-61  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  34.19 
 
 
2003 aa  232  3e-59  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  34.21 
 
 
3506 aa  230  1e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.27 
 
 
972 aa  227  1e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  36.33 
 
 
2371 aa  224  7e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  36.33 
 
 
2366 aa  224  8e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  29.57 
 
 
1881 aa  220  1e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  30.42 
 
 
650 aa  220  1e-55  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  32.81 
 
 
2365 aa  219  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  34.92 
 
 
4238 aa  219  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  32.81 
 
 
2346 aa  218  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  34.72 
 
 
4238 aa  218  5e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  34.92 
 
 
3822 aa  218  7e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  32.44 
 
 
990 aa  217  8e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  34.85 
 
 
2396 aa  217  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  33.57 
 
 
3954 aa  215  2.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  32.94 
 
 
1285 aa  215  4.9999999999999996e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  31.11 
 
 
1782 aa  211  5e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  34.58 
 
 
1053 aa  210  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  31.39 
 
 
677 aa  198  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  33.08 
 
 
1062 aa  198  5.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.54 
 
 
1848 aa  196  2e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  28.02 
 
 
1519 aa  192  4e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  30.25 
 
 
1333 aa  185  5.0000000000000004e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  29.27 
 
 
1164 aa  182  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  34.75 
 
 
1011 aa  178  6e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  30.47 
 
 
985 aa  173  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  33.33 
 
 
1056 aa  168  5e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  29.32 
 
 
1152 aa  152  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  28.73 
 
 
980 aa  148  6e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  28.03 
 
 
1006 aa  147  8.000000000000001e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  30.15 
 
 
994 aa  145  3e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  30.42 
 
 
1016 aa  145  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  30.91 
 
 
488 aa  124  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.81 
 
 
906 aa  122  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  27.44 
 
 
974 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  28.36 
 
 
954 aa  116  3e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4538  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.61 
 
 
710 aa  114  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  28 
 
 
2711 aa  108  7e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.73 
 
 
1489 aa  107  1e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.18 
 
 
913 aa  103  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.79 
 
 
910 aa  98.2  7e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  29.53 
 
 
1446 aa  98.2  7e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.38 
 
 
915 aa  97.8  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  27.98 
 
 
959 aa  97.8  1e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24 
 
 
926 aa  96.3  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.82 
 
 
3629 aa  94  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.45 
 
 
774 aa  92.8  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  26.64 
 
 
816 aa  91.3  9e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1156  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.44 
 
 
979 aa  90.1  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  27.49 
 
 
407 aa  88.2  8e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  24.82 
 
 
1769 aa  87  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  27.56 
 
 
998 aa  85.9  0.000000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  26.46 
 
 
1156 aa  82.4  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  27.07 
 
 
970 aa  82.4  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  26.7 
 
 
1154 aa  82  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  25 
 
 
965 aa  80.9  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  32.48 
 
 
1180 aa  78.6  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  26.8 
 
 
942 aa  78.2  0.0000000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.18 
 
 
1134 aa  76.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  26.01 
 
 
1179 aa  75.9  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  27.04 
 
 
1066 aa  75.9  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  39.35 
 
 
987 aa  75.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  25.48 
 
 
909 aa  75.1  0.000000000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  25.19 
 
 
949 aa  75.1  0.000000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  25.19 
 
 
970 aa  74.7  0.000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  28.03 
 
 
882 aa  72.4  0.00000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.05 
 
 
1532 aa  71.2  0.00000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  28.67 
 
 
1025 aa  70.9  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3186  putative autotransporter  45 
 
 
145 aa  70.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.396056  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0273  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.4 
 
 
754 aa  70.1  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2954  autotransporter-associated beta strand repeat protein  24.72 
 
 
947 aa  69.7  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154236  hitchhiker  0.00450699 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.26 
 
 
1081 aa  68.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>