77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0585 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  100 
 
 		 852 aa  1636    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  46.48 
 
 		 3415 aa  537  1e-151  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  46.48 
 
 		 3420 aa  535  1e-150  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  29.71 
 
 		 2906 aa  105  4e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  31.41 
 
 		 1971 aa  99  4e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  29.74 
 
 		 1530 aa  94.7  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  30.3 
 
 		 2578 aa  93.2  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  29.62 
 
 		 2711 aa  91.7  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.22 
 
 		 3629 aa  90.1  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  28.92 
 
 		 1881 aa  89.7  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  30.35 
 
 		 2926 aa  87.4  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  31.07 
 
 		 3506 aa  86.3  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  30.41 
 
 		 1882 aa  82.8  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  31.21 
 
 		 2365 aa  82.4  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  31.21 
 
 		 2346 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40.46 
 
 		 1029 aa  80.9  0.00000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  30.2 
 
 		 1508 aa  78.2  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  41.18 
 
 		 1108 aa  77.8  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  45.34 
 
 		 1782 aa  77  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  29.86 
 
 		 2396 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  35.02 
 
 		 4238 aa  74.7  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  32.05 
 
 		 1458 aa  74.7  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  28.35 
 
 		 1741 aa  74.3  0.000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  34.66 
 
 		 4238 aa  74.3  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  34.66 
 
 		 3822 aa  73.9  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  41.18 
 
 		 1172 aa  72.8  0.00000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  29.39 
 
 		 3322 aa  71.6  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.19 
 
 		 1532 aa  71.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  36.96 
 
 		 1180 aa  69.7  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  36.2 
 
 		 1550 aa  69.7  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  31.49 
 
 		 1459 aa  69.3  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  37.67 
 
 		 1861 aa  68.9  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  34.21 
 
 		 1571 aa  67.8  0.0000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  31.03 
 
 		 994 aa  67.8  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  38.26 
 
 		 1111 aa  67.8  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  28.87 
 
 		 2057 aa  66.6  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  45.45 
 
 		 1593 aa  66.6  0.000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2208  beta strand repeat-containing protein  45.45 
 
 		 1869 aa  65.9  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.848116  normal  0.0253068 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  37.43 
 
 		 1078 aa  63.5  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  28.96 
 
 		 3391 aa  63.5  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4307  outer membrane autotransporter  40 
 
 		 1099 aa  62.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.157591  hitchhiker  0.00000542564 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.6 
 
 		 1285 aa  62.4  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  27.61 
 
 		 2642 aa  61.2  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.11 
 
 		 1848 aa  60.8  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  33.51 
 
 		 1113 aa  59.7  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  35.8 
 
 		 2407 aa  59.3  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  36 
 
 		 1130 aa  58.5  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4985  Outer membrane autotransporter barrel  39.19 
 
 		 1093 aa  57.4  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.68858  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.82 
 
 		 1227 aa  57  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3175  outer membrane autotransporter  39.19 
 
 		 1093 aa  57.4  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0115385 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  35.04 
 
 		 1019 aa  55.1  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.06 
 
 		 1081 aa  54.3  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  27.18 
 
 		 1119 aa  53.9  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  33.6 
 
 		 3954 aa  53.5  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  38.68 
 
 		 950 aa  52.4  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  34.62 
 
 		 995 aa  52  0.00005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  32.99 
 
 		 2003 aa  52  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  34.21 
 
 		 2363 aa  51.2  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3853  outer membrane autotransporter barrel domain protein  46.48 
 
 		 1055 aa  51.2  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.229574  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1258  beta strand repeat-containing protein  34.62 
 
 		 550 aa  51.2  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.305666  normal  0.49742 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2939  outer membrane autotransporter barrel  38.85 
 
 		 1115 aa  50.1  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.988742  normal  0.687954 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.12 
 
 		 1694 aa  49.3  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0725  Outer membrane autotransporter barrel  30.91 
 
 		 3504 aa  48.9  0.0004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  33.1 
 
 		 1519 aa  48.1  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  29.13 
 
 		 3089 aa  48.1  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  32.58 
 
 		 986 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  42.96 
 
 		 861 aa  47.8  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  40 
 
 		 1357 aa  47.4  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0033  autotransporter-associated beta strand repeat protein  36.5 
 
 		 348 aa  47.8  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.354567 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1117  beta strand repeat-containing protein  40.43 
 
 		 422 aa  47.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  34.31 
 
 		 1006 aa  47  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  29.4 
 
 		 2371 aa  47.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2957  beta strand repeat-containing protein  58.14 
 
 		 683 aa  47.8  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.280909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0082  beta strand repeat-containing protein  27.27 
 
 		 1300 aa  46.2  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1055  filamentous haemagglutinin-like protein  31.47 
 
 		 1451 aa  45.4  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0430168  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.67 
 
 		 910 aa  45.4  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1690  beta strand repeat-containing protein  32.03 
 
 		 1632 aa  44.3  0.009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.638042 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>