193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3756 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 		 3506 aa  6384    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  52 
 
 		 2711 aa  638    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  45.91 
 
 		 2365 aa  623  1e-176  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  46.67 
 
 		 2346 aa  620  1e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  44.24 
 
 		 2366 aa  607  1.0000000000000001e-171  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  39.48 
 
 		 2396 aa  601  1e-170  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  44 
 
 		 3629 aa  554  1e-156  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  44.37 
 
 		 2371 aa  550  1e-154  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  34.08 
 
 		 2906 aa  513  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  42.48 
 
 		 1550 aa  435  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  30.8 
 
 		 2578 aa  430  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  40.77 
 
 		 4238 aa  404  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  40.79 
 
 		 1508 aa  400  1e-109  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  37.44 
 
 		 2926 aa  387  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  41.19 
 
 		 4238 aa  387  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  37.72 
 
 		 1119 aa  370  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  37.05 
 
 		 3954 aa  367  2e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  36.16 
 
 		 3822 aa  357  2.9999999999999997e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  38.85 
 
 		 986 aa  346  4e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  38.98 
 
 		 995 aa  346  4e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  34.08 
 
 		 3420 aa  344  2e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  34.06 
 
 		 3415 aa  338  2e-90  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  36.24 
 
 		 1971 aa  335  6e-90  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.62 
 
 		 1227 aa  335  6e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  35.76 
 
 		 2003 aa  323  3e-86  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  35.53 
 
 		 1029 aa  318  9.999999999999999e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  28.62 
 
 		 1881 aa  306  6.000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.69 
 
 		 1848 aa  304  2e-80  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  37.52 
 
 		 1028 aa  301  1e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.72 
 
 		 1011 aa  300  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.1 
 
 		 1285 aa  300  5e-79  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  38.3 
 
 		 1038 aa  297  2e-78  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  36.74 
 
 		 1055 aa  296  4e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  36.05 
 
 		 1033 aa  296  4e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  36.44 
 
 		 991 aa  295  8e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  35.05 
 
 		 1782 aa  295  1e-77  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  36.51 
 
 		 1004 aa  292  9e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  35.03 
 
 		 995 aa  291  2e-76  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  34.12 
 
 		 650 aa  285  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  34.15 
 
 		 983 aa  283  3e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.15 
 
 		 919 aa  282  7e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  31.99 
 
 		 1519 aa  282  1e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  34.98 
 
 		 985 aa  274  2e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  36.56 
 
 		 1001 aa  271  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  35.03 
 
 		 1001 aa  264  3e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  39.84 
 
 		 1056 aa  261  2e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  35.46 
 
 		 994 aa  251  1e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.72 
 
 		 972 aa  246  6e-63  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  34.66 
 
 		 1129 aa  234  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  34.66 
 
 		 1131 aa  234  3e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  34.46 
 
 		 1131 aa  232  8e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  34.46 
 
 		 1131 aa  232  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  34.46 
 
 		 1131 aa  232  8e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  34.46 
 
 		 1129 aa  232  9e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  31.65 
 
 		 990 aa  231  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  35.7 
 
 		 1053 aa  231  3e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  34.53 
 
 		 1131 aa  230  5.0000000000000005e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4855  outer membrane autotransporter  33.13 
 
 		 1861 aa  228  1e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.07 
 
 		 1125 aa  226  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  32.38 
 
 		 1152 aa  223  5e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  33.94 
 
 		 1130 aa  222  1e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  34.79 
 
 		 1062 aa  222  1e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  34.79 
 
 		 1016 aa  219  9.999999999999999e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  35.88 
 
 		 1164 aa  215  1e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  29.6 
 
 		 1333 aa  213  4e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  34.48 
 
 		 677 aa  213  6e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  33.05 
 
 		 1006 aa  207  3e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  32.62 
 
 		 1530 aa  206  9e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2013  outer membrane autotransporter  35.47 
 
 		 1593 aa  203  5e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  31.38 
 
 		 980 aa  198  2e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  36.11 
 
 		 1571 aa  195  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  40.04 
 
 		 2363 aa  191  2e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  35.7 
 
 		 1011 aa  183  7e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  35.06 
 
 		 488 aa  174  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0173  outer membrane autotransporter  39.77 
 
 		 1113 aa  171  2e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0108054  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.16 
 
 		 1532 aa  171  2e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2736  beta strand repeat-containing protein  31.79 
 
 		 1882 aa  167  2.0000000000000002e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.883139  normal  0.0228341 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6534  outer membrane autotransporter barrel  38.81 
 
 		 415 aa  166  6e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0435676  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  39.18 
 
 		 3391 aa  163  6e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2454  ShdA  29.82 
 
 		 3322 aa  157  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2662  ShdA  33.27 
 
 		 2057 aa  156  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.285141  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.67 
 
 		 1081 aa  152  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  27.05 
 
 		 1769 aa  144  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  30.84 
 
 		 407 aa  138  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.06 
 
 		 1489 aa  135  1.0000000000000001e-29  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0082  beta strand repeat-containing protein  29.46 
 
 		 1300 aa  135  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.420525 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  33.45 
 
 		 1741 aa  126  6e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  34.84 
 
 		 3089 aa  115  1.0000000000000001e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  28.43 
 
 		 1180 aa  115  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3372  autotransporter beta-domain-containing protein  30.33 
 
 		 311 aa  112  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  34.29 
 
 		 994 aa  112  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0152  outermembrane transporter  36.13 
 
 		 861 aa  112  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  unclonable  0.0000458443  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.48 
 
 		 1322 aa  108  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  32.77 
 
 		 1459 aa  105  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  26.87 
 
 		 882 aa  106  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  28.5 
 
 		 942 aa  103  7e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  38.16 
 
 		 1111 aa  102  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.08 
 
 		 926 aa  101  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  26.59 
 
 		 2407 aa  99.4  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  24.34 
 
 		 2848 aa  94.7  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>