135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0132 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 
972 aa  1896    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  39.58 
 
 
919 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.19 
 
 
1029 aa  371  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  37.34 
 
 
1119 aa  361  3e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.73 
 
 
1227 aa  355  2.9999999999999997e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  36.61 
 
 
2003 aa  343  5.999999999999999e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  35.2 
 
 
995 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  35.17 
 
 
1519 aa  306  1.0000000000000001e-81  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  33.53 
 
 
1550 aa  301  4e-80  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  34.48 
 
 
986 aa  298  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  37.87 
 
 
995 aa  292  2e-77  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  38.53 
 
 
1001 aa  289  1e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.74 
 
 
1011 aa  289  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  36.5 
 
 
1333 aa  288  5e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  36.83 
 
 
991 aa  287  7e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  37.8 
 
 
1001 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  34.51 
 
 
650 aa  284  5.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  36.31 
 
 
1285 aa  283  1e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  34.53 
 
 
1055 aa  278  4e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  34.71 
 
 
1038 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  36.9 
 
 
983 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.76 
 
 
1848 aa  273  1e-71  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  35.04 
 
 
1508 aa  268  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  34.78 
 
 
1782 aa  265  4e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  32.45 
 
 
1881 aa  264  8e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  35.68 
 
 
1028 aa  263  1e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  33.75 
 
 
1033 aa  257  9e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  34.92 
 
 
2396 aa  255  3e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  33.39 
 
 
1004 aa  255  3e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  34.2 
 
 
990 aa  252  3e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  34.2 
 
 
3506 aa  251  7e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  33.39 
 
 
2346 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  33.39 
 
 
2365 aa  250  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  36.46 
 
 
2366 aa  246  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  36.25 
 
 
2371 aa  245  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  34.04 
 
 
1130 aa  238  5.0000000000000005e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  33.46 
 
 
1129 aa  231  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  33.46 
 
 
1131 aa  231  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  33.27 
 
 
1131 aa  230  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  33.27 
 
 
1131 aa  230  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  33.27 
 
 
1131 aa  230  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  33.27 
 
 
1129 aa  229  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  37.8 
 
 
1056 aa  229  2e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  33.47 
 
 
3954 aa  227  1e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  33.67 
 
 
4238 aa  226  2e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  33.65 
 
 
1131 aa  226  2e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  33.67 
 
 
4238 aa  226  2e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  33.67 
 
 
3822 aa  225  3e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  35.16 
 
 
1062 aa  220  8.999999999999998e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  34.66 
 
 
1125 aa  218  5.9999999999999996e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  31.12 
 
 
1006 aa  217  9e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3082  outer membrane autotransporter  31.23 
 
 
1164 aa  209  3e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.184876  normal  0.275156 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0892  autotransporter, putative  35.2 
 
 
1016 aa  207  6e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  34.57 
 
 
1011 aa  202  3e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  33.82 
 
 
1053 aa  201  7.999999999999999e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3061  outer membrane autotransporter  29.78 
 
 
677 aa  177  6e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.26513 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  30.22 
 
 
1152 aa  170  1e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  28.13 
 
 
985 aa  158  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  30.33 
 
 
1769 aa  157  9e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  29.65 
 
 
2711 aa  156  2e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  28.8 
 
 
980 aa  154  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  27.88 
 
 
994 aa  154  1e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.64 
 
 
1489 aa  151  7e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4135  outer membrane autotransporter  30.55 
 
 
407 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00592356  normal  0.777233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5638  Outer membrane autotransporter barrel  32.17 
 
 
488 aa  125  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.190969  normal  0.144242 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.27 
 
 
3629 aa  125  5e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.99 
 
 
1081 aa  112  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  27.66 
 
 
1066 aa  103  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  26.65 
 
 
882 aa  103  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  34.22 
 
 
816 aa  99.4  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  27.77 
 
 
1180 aa  97.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.58 
 
 
915 aa  92.8  3e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.33 
 
 
926 aa  87.4  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3372  autotransporter beta-domain-containing protein  26.18 
 
 
311 aa  85.9  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357676  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  23.67 
 
 
913 aa  83.2  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  25.75 
 
 
814 aa  81.6  0.00000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  22.03 
 
 
906 aa  80.9  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25 
 
 
910 aa  80.1  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  27.65 
 
 
965 aa  80.5  0.0000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.91 
 
 
1532 aa  79  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.84 
 
 
774 aa  78.2  0.0000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  27.1 
 
 
909 aa  77.4  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  27.95 
 
 
1459 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  25.42 
 
 
959 aa  76.3  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  25.82 
 
 
1012 aa  73.9  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1156  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.38 
 
 
979 aa  74.3  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.909327  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  27.51 
 
 
1458 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  25.19 
 
 
972 aa  71.6  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  39.32 
 
 
987 aa  70.9  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  26.57 
 
 
2407 aa  70.5  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1662  pertactin family protein  31.23 
 
 
1626 aa  68.6  0.0000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.459563 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2238  putative Outer membrane autotransporter protein  28.68 
 
 
1025 aa  67.4  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.669565  normal 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  24.8 
 
 
939 aa  67  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  40.22 
 
 
2926 aa  65.5  0.000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.79 
 
 
1322 aa  65.1  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  23.11 
 
 
1369 aa  65.1  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.11 
 
 
960 aa  64.7  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1711  outer membrane autotransporter domain-containing protein  31.55 
 
 
1327 aa  64.7  0.000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  35.09 
 
 
1111 aa  63.9  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2148  putative lipoprotein/autotransporter domain-containing protein  31.55 
 
 
1806 aa  63.9  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.589392  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>