225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1306 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 		 1489 aa  2897    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  60.11 
 
 		 1769 aa  1508    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  29.4 
 
 		 1119 aa  162  4e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.27 
 
 		 972 aa  146  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  27.05 
 
 		 990 aa  145  5e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  28.65 
 
 		 1001 aa  133  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  31.46 
 
 		 1881 aa  132  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  27.9 
 
 		 1001 aa  130  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  27.36 
 
 		 985 aa  130  3e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  29.01 
 
 		 1550 aa  129  4.0000000000000003e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  26.44 
 
 		 3506 aa  127  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  31.34 
 
 		 1125 aa  125  4e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  25.6 
 
 		 994 aa  125  6e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.01 
 
 		 1029 aa  125  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.59 
 
 		 919 aa  124  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  26.61 
 
 		 1369 aa  123  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.65 
 
 		 1227 aa  123  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  29.87 
 
 		 650 aa  122  3.9999999999999996e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  27.18 
 
 		 983 aa  122  7e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  26.93 
 
 		 1782 aa  121  7.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  28.51 
 
 		 1519 aa  121  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  28.09 
 
 		 816 aa  120  1.9999999999999998e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  27.22 
 
 		 1055 aa  117  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.98 
 
 		 1081 aa  114  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  27.46 
 
 		 1033 aa  112  7.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  26.04 
 
 		 991 aa  112  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  26.54 
 
 		 1062 aa  110  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  29.03 
 
 		 1111 aa  109  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.44 
 
 		 1322 aa  109  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  27.14 
 
 		 1180 aa  109  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  27.51 
 
 		 986 aa  108  8e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  28.49 
 
 		 1028 aa  107  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  28.12 
 
 		 1152 aa  106  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  25.2 
 
 		 1130 aa  105  8e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  26.04 
 
 		 995 aa  105  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2572  serine protease  25.96 
 
 		 1129 aa  104  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1327  serine protease  25.96 
 
 		 1131 aa  104  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0234  serine protease  25.85 
 
 		 1131 aa  102  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.411978  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0506  serine protease  25.85 
 
 		 1131 aa  102  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1063  serine protease  25.85 
 
 		 1131 aa  102  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1263  serine protease  25.85 
 
 		 1129 aa  102  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  27.96 
 
 		 1038 aa  102  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  26.94 
 
 		 1004 aa  101  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  28.06 
 
 		 1333 aa  101  1e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  26.29 
 
 		 2407 aa  100  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  26.31 
 
 		 995 aa  99.4  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  28.98 
 
 		 2396 aa  99.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1408  serine protease  26.16 
 
 		 1131 aa  99  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0123331  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  24.91 
 
 		 1458 aa  98.2  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6464  outer membrane autotransporter  24.96 
 
 		 1459 aa  97.4  2e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  27.56 
 
 		 2366 aa  96.7  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  27.56 
 
 		 2371 aa  96.3  4e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  27.78 
 
 		 2346 aa  94.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  27.78 
 
 		 2365 aa  94.7  1e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  25.89 
 
 		 882 aa  92.8  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.93 
 
 		 1011 aa  92  7e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.88 
 
 		 1285 aa  92  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3411  Outer membrane autotransporter barrel  28.66 
 
 		 1130 aa  91.3  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  25.56 
 
 		 987 aa  91.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2115  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.22 
 
 		 1694 aa  91.7  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0846995  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  27.94 
 
 		 2003 aa  90.5  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0933  outer membrane autotransporter  23.65 
 
 		 4248 aa  90.1  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  26.02 
 
 		 1078 aa  89.4  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  26.28 
 
 		 980 aa  87  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  24.72 
 
 		 1066 aa  86.3  0.000000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.33 
 
 		 1532 aa  85.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  27.05 
 
 		 1508 aa  85.5  0.000000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.82 
 
 		 3629 aa  85.1  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  23.7 
 
 		 907 aa  83.2  0.00000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1857  outer membrane autotransporter  26.86 
 
 		 2848 aa  82.4  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.150379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.16 
 
 		 915 aa  82.4  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  26.27 
 
 		 3954 aa  81.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  27.55 
 
 		 1446 aa  80.9  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  25.9 
 
 		 4238 aa  80.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1194  autotransporter domain-containing protein  25.44 
 
 		 1068 aa  80.1  0.0000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.170523 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.17 
 
 		 913 aa  80.1  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  25.9 
 
 		 4238 aa  80.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3385  outer membrane autotransporter  26.52 
 
 		 972 aa  80.1  0.0000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.308218 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  25.9 
 
 		 3822 aa  79  0.0000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.57 
 
 		 774 aa  78.6  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  27.02 
 
 		 759 aa  76.3  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  27.48 
 
 		 763 aa  75.5  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  24.65 
 
 		 998 aa  73.6  0.00000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4377  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.35 
 
 		 641 aa  73.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3913  outer membrane autotransporter  23.49 
 
 		 1091 aa  72.8  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  25.36 
 
 		 1006 aa  72.8  0.00000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0746  Autotransporter beta- domain protein  25.28 
 
 		 2091 aa  72.8  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  24.65 
 
 		 949 aa  72.8  0.00000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  24.65 
 
 		 970 aa  72.4  0.00000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  23.3 
 
 		 814 aa  71.2  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2001  filamentous hemagglutinin family outer membrane protein  25 
 
 		 3862 aa  71.2  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  25.11 
 
 		 970 aa  71.2  0.0000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  26.42 
 
 		 942 aa  70.5  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3587  outer membrane autotransporter  24.48 
 
 		 1011 aa  70.5  0.0000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334084  normal  0.0742158 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1833  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.48 
 
 		 1048 aa  70.9  0.0000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1031  outer membrane autotransporter  36.36 
 
 		 1172 aa  70.9  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0914454  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  25.2 
 
 		 1177 aa  70.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  25.3 
 
 		 926 aa  70.1  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  24.71 
 
 		 965 aa  70.1  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  23.38 
 
 		 1154 aa  69.7  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>