150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2173 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  56.42 
 
 		 1081 aa  779    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1975  Outer membrane autotransporter  56.5 
 
 		 1111 aa  728    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2173  Outer membrane autotransporter barrel  100 
 
 		 1180 aa  2217    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.193519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4300  Outer membrane autotransporter barrel  58.6 
 
 		 987 aa  672    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.359518 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2974  Outer membrane autotransporter barrel  54.27 
 
 		 814 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2512  Outer membrane autotransporter barrel  50.14 
 
 		 1019 aa  598  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.150059 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5268  putative outer membrane autotransporter barrel  49.03 
 
 		 1078 aa  599  1e-169  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.362559 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3087  Outer membrane autotransporter barrel  47.78 
 
 		 2407 aa  593  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7237  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  53.66 
 
 		 882 aa  556  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1881  outer membrane autotransporter barrel domain protein  45.04 
 
 		 1532 aa  504  1e-141  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3958  putative outer membrane autotransporter barrel precursor  52.62 
 
 		 907 aa  496  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  37.78 
 
 		 1177 aa  303  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2708  Outer membrane autotransporter barrel  34.21 
 
 		 678 aa  209  2e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0480  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.93 
 
 		 1029 aa  177  8e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.876293  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0779  hypothetical protein  27.93 
 
 		 1881 aa  171  6e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  30.78 
 
 		 1001 aa  164  8.000000000000001e-39  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2876  outer membrane autotransporter  29.94 
 
 		 1550 aa  160  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1566  Outer membrane autotransporter barrel  28.8 
 
 		 1119 aa  155  5.9999999999999996e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  29.83 
 
 		 983 aa  154  7e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.21 
 
 		 1227 aa  153  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  29.47 
 
 		 1001 aa  149  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  30.84 
 
 		 1055 aa  149  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1774  serine protease  28.52 
 
 		 1508 aa  146  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.903556  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  29.48 
 
 		 1028 aa  142  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2325  outer membrane autotransporter  29.99 
 
 		 1782 aa  140  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0522858  hitchhiker  0.00737544 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  31.75 
 
 		 1038 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4881  outer membrane autotransporter  29.37 
 
 		 2366 aa  138  5e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.312195  decreased coverage  0.00000000166918 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4364  outer membrane autotransporter  29.57 
 
 		 2371 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430062 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4722  outer membrane autotransporter  30.54 
 
 		 2003 aa  135  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5354  outer membrane autotransporter  29.13 
 
 		 2365 aa  128  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0199943  normal  0.02642 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4933  outer membrane autotransporter  29.23 
 
 		 2346 aa  128  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.348524  unclonable  0.000124828 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0758  outer membrane autotransporter barrel  30.15 
 
 		 2396 aa  127  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00291921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0206  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.61 
 
 		 1285 aa  127  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0891162 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0336  Outer membrane autotransporter barrel  27.85 
 
 		 995 aa  127  2e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1826  outer membrane protein  48.23 
 
 		 190 aa  126  2e-27  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.400541  normal  0.391918 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3756  Outer membrane autotransporter barrel  27.72 
 
 		 3506 aa  126  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  29.66 
 
 		 995 aa  125  5e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  29.25 
 
 		 991 aa  125  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0449  Outer membrane autotransporter barrel  26.65 
 
 		 816 aa  124  9.999999999999999e-27  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.761733 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3929  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.92 
 
 		 1011 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0137  outer membrane autotransporter  24.43 
 
 		 1519 aa  121  7e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2348  outer membrane autotransporter  42.06 
 
 		 1971 aa  120  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.714224  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  27.71 
 
 		 986 aa  119  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6171  outer membrane autotransporter  37.26 
 
 		 1458 aa  119  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1203  outer membrane autotransporter  26.84 
 
 		 1769 aa  119  3.9999999999999997e-25  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1306  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.22 
 
 		 1489 aa  118  7.999999999999999e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2455  outer membrane autotransporter barrel domain protein  29.2 
 
 		 919 aa  113  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.739869  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2875  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.59 
 
 		 1848 aa  110  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.189813 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4115  outer membrane autotransporter  28.5 
 
 		 3954 aa  103  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3534  beta strand repeat-containing protein  41.51 
 
 		 2642 aa  102  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0132  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.81 
 
 		 972 aa  101  8e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1857  outer membrane autotransporter barrel domain protein  38.14 
 
 		 1322 aa  100  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000638249 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  42.13 
 
 		 1033 aa  100  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.19 
 
 		 1125 aa  99  4e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  44.52 
 
 		 1004 aa  98.2  8e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  26.83 
 
 		 985 aa  96.7  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009672  Oant_4858  outer membrane autotransporter  34 
 
 		 2906 aa  96.7  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6533  Outer membrane autotransporter barrel  28.4 
 
 		 3822 aa  95.9  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6767  outer membrane autotransporter  28.28 
 
 		 4238 aa  95.1  7e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1672  beta strand repeat-containing protein  36.91 
 
 		 3391 aa  94.7  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0848841 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6355  outer membrane autotransporter  28.25 
 
 		 4238 aa  93.6  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.51084 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2767  outer membrane autotransporter  41.41 
 
 		 1108 aa  94  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3728  cadherin  30.83 
 
 		 3089 aa  92  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  32.77 
 
 		 994 aa  92  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3532  outer membrane autotransporter  29.77 
 
 		 1152 aa  89.7  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  27.25 
 
 		 1179 aa  88.2  7e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1478  Outer membrane autotransporter barrel  27.96 
 
 		 650 aa  88.2  8e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1722  beta strand repeat-containing protein  30.74 
 
 		 1530 aa  87.4  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.885692  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2810  outer membrane autotransporter  33.45 
 
 		 2578 aa  87.8  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3532  outer membrane autotransporter  39.08 
 
 		 1571 aa  84.7  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3607  outer membrane autotransporter  25.51 
 
 		 1333 aa  83.2  0.00000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1148  outer membrane autotransporter  37.92 
 
 		 3420 aa  82.4  0.00000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7274  hypothetical protein  24.91 
 
 		 990 aa  82  0.00000000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0586  outer membrane autotransporter  40.08 
 
 		 2926 aa  80.9  0.0000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A1053  outer membrane autotransporter  37.58 
 
 		 3415 aa  80.1  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0264  beta strand repeat-containing protein  34.72 
 
 		 860 aa  80.5  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  26.95 
 
 		 1154 aa  79.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  37.6 
 
 		 1357 aa  78.2  0.0000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241851  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  26.73 
 
 		 980 aa  77.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1258  beta strand repeat-containing protein  37.16 
 
 		 550 aa  77.4  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.305666  normal  0.49742 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1933  outer membrane autotransporter  38.87 
 
 		 1053 aa  76.6  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0182819 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1554  autotransporter-associated beta strand repeat protein  34.68 
 
 		 2363 aa  75.5  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.623464 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  27.53 
 
 		 1156 aa  75.9  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  28.65 
 
 		 909 aa  75.5  0.000000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5186  outer membrane autotransporter  24.64 
 
 		 1056 aa  75.1  0.000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2817  outer membrane autotransporter  32.35 
 
 		 950 aa  75.1  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1117  beta strand repeat-containing protein  36.4 
 
 		 422 aa  74.3  0.00000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  28.52 
 
 		 965 aa  73.6  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  27.76 
 
 		 994 aa  72.8  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  24.33 
 
 		 1369 aa  72.8  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00711  YapH protein  35.16 
 
 		 2711 aa  72.4  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0184521  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0933  outer membrane autotransporter  22.35 
 
 		 4248 aa  72  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0614  Outer membrane autotransporter barrel  32.94 
 
 		 1741 aa  71.6  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0347869 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0585  beta strand repeat-containing protein  32.23 
 
 		 852 aa  69.7  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.184792  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0854  outer membrane autotransporter barrel domain protein  33.83 
 
 		 3629 aa  69.7  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  30.6 
 
 		 1325 aa  69.3  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.4 
 
 		 1134 aa  69.3  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1123  outer membrane autotransporter  28.34 
 
 		 1062 aa  69.3  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948475  normal  0.876639 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1429  serine protease  29.79 
 
 		 1130 aa  68.9  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  37.13 
 
 		 942 aa  68.9  0.0000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>