More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_2147 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_2147  outer membrane autotransporter barrel domain protein  100 
 
 
1134 aa  2278    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3437  Outer membrane autotransporter  74.89 
 
 
1179 aa  1640    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0360967 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2586  Outer membrane autotransporter barrel  77.78 
 
 
1154 aa  1766    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.501537  normal  0.680105 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2017  Outer membrane autotransporter barrel  78.04 
 
 
1156 aa  1789    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.375408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2102  outer membrane autotransporter  25.5 
 
 
1006 aa  190  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4232  beta strand repeat-containing protein  31.94 
 
 
1446 aa  171  6e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.819177  normal  0.109622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1650  autotransporter, putative  25.8 
 
 
1055 aa  164  9e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6125  beta strand repeat-containing protein  30.55 
 
 
1325 aa  163  1e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1649  autotransporter, putative  24.47 
 
 
1001 aa  157  1e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3733  Outer membrane autotransporter barrel  25.36 
 
 
1038 aa  157  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.418268  normal  0.311183 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3734  Outer membrane autotransporter barrel  24.58 
 
 
1001 aa  153  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.29394 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  25.81 
 
 
954 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3549  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.83 
 
 
1125 aa  146  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4538  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.51 
 
 
710 aa  145  3e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  26.34 
 
 
974 aa  142  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2684  Outer membrane autotransporter barrel  24.32 
 
 
1028 aa  139  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.335444  unclonable  0.0000368637 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4738  outer membrane autotransporter  24.75 
 
 
1004 aa  139  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2683  Outer membrane autotransporter barrel  24.12 
 
 
983 aa  138  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.525643  hitchhiker  0.000404465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4737  outer membrane autotransporter  24.43 
 
 
1033 aa  132  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1114  serine protease  27.82 
 
 
965 aa  129  4.0000000000000003e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0955353  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1004  beta strand repeat-containing protein  25.36 
 
 
909 aa  127  2e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0308  beta strand repeat-containing protein  27.98 
 
 
970 aa  119  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  unclonable  0.000000319801  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18630  putative serine protease  23.74 
 
 
995 aa  119  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.169589 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0206  beta strand repeat-containing protein  28.17 
 
 
970 aa  118  5e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2701  outer membrane autotransporter barrel domain protein  21.73 
 
 
906 aa  118  6e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000419199  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0340  serine protease  27.98 
 
 
949 aa  118  6.9999999999999995e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  decreased coverage  0.000000485293  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2954  autotransporter-associated beta strand repeat protein  26.47 
 
 
947 aa  117  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0154236  hitchhiker  0.00450699 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1611  putative serine protease  23.27 
 
 
991 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0234  serine protease  27.74 
 
 
998 aa  116  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.249897  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01745  serine protease  24.67 
 
 
942 aa  107  1e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0135  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.85 
 
 
910 aa  104  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4035  deoxyuridine 5'-triphosphate nucleotidohydrolase Dut  32.67 
 
 
994 aa  102  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.565458 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7520  outer membrane autotransporter domain-containing protein  26.43 
 
 
1177 aa  103  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1082  outer membrane autotransporter barrel domain protein  30.1 
 
 
915 aa  101  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0245  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.59 
 
 
882 aa  100  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.983074  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0256  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.94 
 
 
868 aa  99  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0273  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.23 
 
 
754 aa  97.1  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3729  outer membrane autotransporter barrel domain protein  28.12 
 
 
913 aa  95.1  6e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17620  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.89 
 
 
595 aa  92  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2277  outer membrane autotransporter  29.34 
 
 
980 aa  91.7  7e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.356388 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0365  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.75 
 
 
487 aa  91.3  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.02 
 
 
577 aa  89.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1099  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  28.73 
 
 
495 aa  87.4  0.000000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0536343  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0931  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.58 
 
 
500 aa  87.4  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143808  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00703  serine protease  33 
 
 
911 aa  86.3  0.000000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.585891  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4066  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.58 
 
 
1081 aa  86.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.392825  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0234  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.63 
 
 
852 aa  86.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2188  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.58 
 
 
415 aa  85.1  0.000000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.180724  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4226  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.27 
 
 
1454 aa  84.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.542738  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0453  outer membrane autotransporter  26.64 
 
 
959 aa  84  0.00000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0488  outer membrane autotransporter barrel domain protein  27.39 
 
 
774 aa  83.6  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.510592  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1928  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.07 
 
 
452 aa  84  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0364  subtilisin-like serine protease-like  28.35 
 
 
692 aa  82  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.75506  normal  0.695654 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4085  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.75 
 
 
615 aa  81.6  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1805  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.51 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0411901  normal  0.0459712 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0787  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.2 
 
 
612 aa  81.3  0.00000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2318  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  30.84 
 
 
771 aa  80.9  0.0000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.848662  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0527  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.38 
 
 
688 aa  80.1  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.841411  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1837  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.81 
 
 
770 aa  80.1  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.00570496  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1288  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.09 
 
 
645 aa  80.1  0.0000000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.237324 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2056  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.74 
 
 
392 aa  80.1  0.0000000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.317337  normal  0.564481 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0162  subtilisin-like serine proteases-like  24.89 
 
 
576 aa  80.5  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.107211  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0357  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.07 
 
 
577 aa  79.3  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4060  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.53 
 
 
627 aa  79.3  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0156752  normal  0.194218 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1295  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30 
 
 
639 aa  79  0.0000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3844  outer membrane autotransporter barrel domain protein  26.61 
 
 
926 aa  78.6  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1788  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.09 
 
 
635 aa  78.2  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2496  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  24.6 
 
 
575 aa  76.6  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.212596  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3564  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.81 
 
 
1060 aa  76.3  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2458  outer membrane autotransporter  24.83 
 
 
1369 aa  76.3  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00908706  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2354  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.68 
 
 
453 aa  76.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0341  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.17 
 
 
627 aa  75.9  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.835088 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5326  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.41 
 
 
398 aa  75.5  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5200  autotransporter, putative  23.8 
 
 
986 aa  75.5  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5838  outer membrane autotransporter barrel domain protein  24.63 
 
 
1227 aa  75.1  0.000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0783  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.17 
 
 
597 aa  75.1  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2098  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.49 
 
 
426 aa  74.7  0.000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0552  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.41 
 
 
490 aa  74.7  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3522  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.91 
 
 
615 aa  74.3  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1417  serine protease  27.35 
 
 
1175 aa  73.6  0.00000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0223  FHA domain-containing protein  27.02 
 
 
513 aa  73.2  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.443938 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4267  outer membrane autotransporter  26.26 
 
 
939 aa  73.9  0.00000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4314  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.33 
 
 
431 aa  72.8  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.106523 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06400  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.69 
 
 
797 aa  72.4  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3502  peptidase S8 and S53 subtilisin kexin sedolisin  29.02 
 
 
1106 aa  72.8  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250656  hitchhiker  0.00117601 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1891  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.66 
 
 
626 aa  72.8  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2865  outer membrane autotransporter  24.71 
 
 
994 aa  72.4  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0664  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.51 
 
 
689 aa  72.4  0.00000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.38238  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3055  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  25.13 
 
 
483 aa  72  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.154731  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1068  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.23 
 
 
682 aa  72  0.00000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  26.44 
 
 
644 aa  71.6  0.00000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2826  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.84 
 
 
718 aa  71.2  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.460965  normal  0.0320057 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3162  putative hemagglutinin-related protein  33.12 
 
 
1012 aa  70.1  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0861  intracellular serine protease  24.42 
 
 
307 aa  70.5  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000163196  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5637  Outer membrane autotransporter barrel  24.79 
 
 
985 aa  70.5  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217038  normal  0.176654 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1062  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.35 
 
 
710 aa  70.1  0.0000000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.00000196875  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0678  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  32.11 
 
 
510 aa  69.7  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0623565  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2081  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  27.59 
 
 
848 aa  69.7  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2196  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.01 
 
 
423 aa  70.1  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1827  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.4 
 
 
1054 aa  69.7  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.426628  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>